公元680年，唐高宗李治预备御驾亲赴泰安祭天，安排太子李贤由张柬之大人和郭大人先赴泰安做祭天准备事宜。泰安知府为太子准备了行宫，并安排捕头胡风山去浴花谷玲珑姑娘那里买来大量的花草。太子李贤在自己的行宫中邂逅正在管理花草的玲珑，一见倾心，想念非常，就专门去找寻玲珑姑娘并为其画像，而玲珑也对李贤很感兴趣。唐高宗御驾亲赴泰安途中遇到埋伏，护卫死伤惨重，虽歼灭了敌人，但高宗差点被羽箭所伤，大为惊怒。

狄仁杰来到浴花谷，发现浴花谷的主人玲珑姑娘已经失踪，而恰巧碰到张顺子给浴花谷的花浇水，但张顺子却否认知道玲珑的去处。胡捕头以跟踪张顺子为由，把狄仁杰带到浴花谷的山洞中，在山洞中发现散落的兵器，胡捕头告诉狄仁杰太子李贤曾经到过浴花谷，并把线索指向太子。种种证据表明李贤太子和私藏兵器有关，但狄仁杰却不这样认为。狄仁杰和色子到外查访。

狄仁杰为了能公开查案，决定自己亲自去京城向皇上请旨，让色子留下来监视胡捕头，但他们没想到他们正在一步一步走进别人设的陷阱。色子奉命监视胡捕头，但胡捕头却被人杀害，色子当场被御林军包围，他们诬陷是色子杀了胡捕头，是杀人灭口。色子为了不连累狄仁杰，甘愿被捕。狄仁杰来到京城，面见高宗皇帝，在大殿上高宗责怪他不应该不请旨就开始查案，认为他这是无视皇上。

皇太后武则天知道太子被劫持后，十分动怒，于是派狄仁杰到成都府查明案情，狄仁杰向武则天请示要带押在天牢里的色子一起办案，武则天准许。狄仁杰用明修栈道暗度陈仓的计策，带着色子从小路赶奔成都府，但不想他们在去成都的路上被刺客袭击，刺客被抓后向他们透露派他们的是武大，狄仁杰从他们的武功上推测他们应该是边境的士兵。

色子跟踪刺客发现刺客去了张柬之大家的府，张柬之派人叫狄仁杰去他府上，原来是那个刺客给张柬之送来一个戴着太子戒指的断指。张柬之和李多祚都认为那个是太子的手指，太子应该已经遇害了。但狄仁杰却认为这个手指不是太子的，应该是有人专门拿这个手指来迷惑他。狄仁杰告诉李多祚刺客的藏身之处，但等李多祚带着御林军到的时候，刺客已经逃走，最后一无所获。

徐莫愁到了成都，虽诊断有方，却无力解毒。用他自己的话说，是因为从来看不起使用这种毒药的人，所以从来也没有研究过如何为其调配解药。徐莫愁是有名的毒药专家，在江湖上也大有名气，他怎么可能配不出解药呢？狄公根据徐莫愁到来前后张柬之的反常表现，决定进一步敲山震虎，于是召开了有张、李、徐参加的案情分析会。

张柬之要狄公抓捕自己，并带着他与假太子的尸体一道回京交差。说到激动处的狄仁杰拿起酒壶，咕嘟咕嘟地灌了起来，狄仁杰中毒了。张柬之大骂徐莫愁在酒里下毒陷害狄仁杰，可徐莫愁解释，为了顺利转移太子把狄公灌醉而已。就在他们趁狄公酒醉酣睡之际，准备将太子顺利转移出去的时候，却惊奇地发现，太子不见了。原来，是色子奉了狄公密令，已经提前将太子控制并转移了。

就在段无涯恼羞成怒准备对狄公下手之际，色子及时赶到，出手化解。狄公游说太子，终于争取到太子的理解与配合。成都一案，至此告破。太子就要随狄仁杰进京了，武府师爷阿寿网罗杀手，行刺太子，没想到等着他们的是色子。狄公发现，十多个黑衣人，每个人的嘴角处都挂着鲜红的血迹。可色子认出，这些人都是当地口子帮的地头蛇。狄公断定，指使黑衣人劫杀活太子的幕后主使，应该就是五年前在泰安制造冤案的人。

武则天决定由狄仁杰亲自负责监管李贤太子。狄公提出既然要监管，就要确保安全，他提议太后将太子转移到太子宫，由他亲自遴选可靠的人严密保护。可武则天又怕他一旦专管太子，有利用职务方便放走太子的可能，于是婉转下旨要他八岁的儿子狄光远进宫为质，狄仁杰心下一惊。但他还是将孩子送进了宫。他相信，舍不得孩子就套不住狼。送儿子进宫的轿子去远了，狄仁杰呆立在门前，眼中闪动着泪花。

狄公和张柬之觉得，应该将太子妃安置到他的身边。但就在狄公向太后游说之时，发生了太子妃死亡的事件。狄公立即投入调查，参与调查的大理寺赵捕头竟被人杀害了。经查证，杀害赵捕头用的飞镖和当年杀死卖令牌的摊贩使用的飞镖一模一样。赵永亮是个普通衙役，他不可能参与到这种案子里来。狄公抓到了一条重要的线索，那就是赵永亮的媳妇正在怀孕，而且案发前后下落不明。据亲戚胡三交代，是赵永亮自己杀死了怀孕的媳妇。

狄公将情况报告了武则天，武则天认为不管怎么说，琅琊王是目前最大的嫌疑犯。她要狄公即刻代皇上拟旨，宣琅琊王进京将事情讲清楚。但狄公认为，琅琊王镇守博州拥兵十万，起兵造反后果不堪设想。狄公请太后再给他一些时间。很快，色子就跟踪了段无涯，调查的结果很快明朗，原来是有人冒充了段无涯，控制了太子妃，太子妃在冒充者的手中。同时，狄公也从段无涯的口中，察觉到了一点他们的企图。

就在狄公等全力搜寻假冒红嘴的人的时候，此人却死在狄公家的书房里。狄公向武则天禀报情况，当牵涉到武承嗣和泰安案的时候，武则天却指示他，这件事就到此为止。她要狄公集中精力调查李贤媳妇的事儿。结果，想睡觉就有人送枕头，一位女子玲珑来到狄府，想求助狄公帮她找到失踪的朋友阿禄。经询问，阿禄安顿的那位朋友是一位怀有身孕的女子。狄公立即意识到，这位有孕女子就是阿禄调换窝藏的太子妃。

色子觉得玲珑和阿禄是同谋关系。狄公和色子重点对玲珑进行了调查，但一切迹象都似乎在证明，玲珑的确是纯洁无辜的。她五年前和李贤太子萍水相逢，一见钟情。后来太子被人陷害，她怕受到牵连，就躲到朋友家去了。她到洛阳就是来找太子的，只是因为人地生疏，到处都打听不到太子的消息，盘缠也用完了，没有办法，这才在破庙外租下了一块地，自己种花养活自己。她还请狄公无论如何帮帮忙，帮她打听到丈夫太子的下落。

更令狄公沉思的是：为什么所有的一切都离不开李贤太子呢？阿禄死了，武承嗣沉默了，段无涯无影无踪了，琅琊王也不再派人捣乱了。所有的人都悄然隐去，只把一个连丈夫名字都不知道的可怜女人推在了最前面，她究竟是一只没有生命、被人操纵的木偶，还是一个比阿禄和段无涯更令人恐惧的人呢？狄公带着这个问题走访了被关押的太子，但太子的反应十分敏感，他果然知道玲珑。

正当狄公和色子调查走访浴花谷，张顺子报来情况，黄有安不知去向了。狄公感到事情不妙，急忙来到黄有安可能出没的感恩堂，黄有安被杀了，看得出，他是在和凶手激烈搏斗以后被杀的。狄仁杰仔细勘察现场，尸体脸部一个微小的地方引起了他的注意。经综合分析，狄公认为杀手应该是黄有安的一个熟人。现在的问题是：如果仅仅是官匪勾结导致的内讧杀人，事情倒简单了。

狄公重新勘察现场，终于发现了黄有安死前故意留下的线索，即屏风上留下的一个“禄”字。他沿着这条线索又找到黄夫人，终于套出了武承嗣府上的厨子阿禄十分可疑。可阿禄明明已经死了，他是死在狄公的家里，怎么会又来谋害黄有安呢？狄公和色子找到张顺子，欲进一步核实某些情况，但张顺子反而急于向他们打听玲珑的情况，他要到洛阳去找她。

太子妃不但矢口否认“阿禄”这个朋友，而且对阿禄巧用掉包计换她出来的情况一无所知。狄公和色子都有些迷惑了。这个玲珑，她到底是无辜还是故意呢？由于黄有安的死，这一切似乎都无迹可考了。但是，黄有安死了。可已死的阿禄果然还活着吗？狄公料定，这位没死的阿禄是个假的。一个偶然的机会，色子发现了假阿禄。追到武承嗣府的房顶上时，人就不见了。玲珑又去郭湘成府上闹腾了。

狄公决定冒险采取欲擒故纵之法，在得到武则天和朝廷重臣的认同之后，同意了玲珑的请求。用皇上武则天的话说：狄爱卿深谋远虑，太子宫防备森严，凭一个手无寸铁的羸弱女子就能把人救走或者杀了吗？这绝对是不可能的。现在姑且把她当做很不错的钓饵，也许能钓出大鱼来呢。玲珑就要去见夫君太子了，她提出了一个不好拒绝的小小要求，想带一束花进去。为此她去了一趟花房，但是她被色子跟踪了。

沮丧回府后的狄仁杰，读到了玲珑生前留给他的书信，所有读到这封信的人，都流泪了。太后武则天感慨唏嘘之余，准奏将李贤和玲珑的尸体一起运往山东泰安的浴花谷安葬。宰相郭湘成对狄公的这次失误似乎很宽容：“算了，逝者已矣，就算再检讨也无济于事了。”狄公也觉得的确是人算不如天算。谁也没有想到会是这样一个结果，痴情女子，无情杀手，到底哪一个玲珑才是真正的、真实的玲珑呢。

狄公拜访了宰相郭湘成，一针见血地指出，迎合武承嗣刺杀太子的阴谋，巧用玲珑卧底，以假死欺骗众人，成功营救太子的整个计划，是他一手策划的。郭湘成苦笑承认，“狄仁杰就是狄仁杰，没有什么事能瞒得了你。”狄公进一步指出，冒充阿禄的那位假阿禄不是别人，正是他郭府的管家李禄。是个深藏不露的武林高手，他把厨子阿禄模仿得简直惟妙惟肖，让人叹为观止。

武则天对狄公的请求感到很难办，朝廷出了这么大的事，不会连一个有罪之人也没有吧？武承嗣、张光弼等趁机进谗，指责这件事与琅琊王有很大的关系，他应该是本案的元凶。但武则天识破了他们想点火捣乱、挑动战争、乘乱夺权的狼子野心和阴谋，反而传旨给礼部，命他们速派钦差前往博州、汝阳，代表皇上和她安抚琅琊王及其麾下所有官兵和当地百姓，这显然是一个出人意料的决定，所有的大臣都呆住了。

但是，由于多种历史原因的作用，战争还是未能避免。公元688年，兵部尚书张光弼以琅琊王杀害钦差大臣、拘押朝廷命官为借口，起兵围剿博州，越王李贞之子琅琊王李冲被迫开战，韩王李元嘉、鲁王李灵燮、越王李贞、上党公李申、黄国公李霭、武陵公李谊等李姓家族纷纷响应，大唐历史上出现了前所未有的混乱局面。回京复命的狄仁杰看到战争疮痍痛苦万分，他多么希望琅琊王赐的那杯酒真的放了剧毒，那样他就解脱了。

狄公找到太医毒郎中徐莫愁，说他活得太累了，得罪了不少人，连夫人都赔进去了。他找太后辞官，太后不准。他实在没办法，只好找他毒郎中，他狄仁杰也想假死？他只要骗过朝廷，就什么烦恼也没有了，就可以悄悄躲回太原府伺候夫人，还可以过清闲日子了。徐莫愁刀子般的眼睛盯着狄仁杰说，你想死是你的事，上吊、跳河、抹脖子怎么都行，就是别找我。徐莫愁还问他是不是因为一劳永逸？狄仁杰说：别知道的太多，会短命的。

经勘察与调查，狄公认为太子妃的确是自杀的。但是他非常想知道她为什么要自杀，而且为什么死得那么平静，那么从容。在找接生婆询问的时候，大家才惊然发现，接生婆失踪了。综合分析表明，有人拿着另外的一个孩子把太子妃的孩子换走了，这又是一出掉包计。郭湘成的夫人也恰好生产了。狄公找到郭湘成，他很怀疑郭大人用自己的孩子，换走了太子的儿子小太子。

狄公因监管李贤和太子妃不力，被贬为博州知府，离开了洛阳。十六年后，已经登基的武则天广开贤路，每年都要在洛阳设立专门的文武考试，凡通过考核者皆量才使用，为国效劳。武则天的侄孙女也被接进宫中，赐名锦媛，乳名馒头，一时成为宫中炙手可热的小公主。小公主因为闹事，邂逅了已经长大并被提拔为皇宫侍卫长的狄公儿子狄光远。小男女斗嘴斗气，有了一种别样的关系。

与此同时，洛阳也发生了武姓族人被杀事件。武承嗣负责调查此案，他觉得敢于杀武姓族人的仇家除了玲珑一脉，不会有别人。他要义子吴子虚调查所有进出洛阳城的陌生人，尤其是女人。博州的侦破工作有了初步进展，狄公通过调查悦来客栈的老板顺藤摸瓜，破获了老板趁人之危盗窃银两的劣迹。但是，银子是老板拿走的不假，可人未必是他害的。狄仁杰有了一种感觉，这事迟早会把他牵扯进去。

洛阳朝廷还没有来得及作出反应，博州又出事了。衙役报告城东又有一个布店的老板被杀，媳妇和儿子也一同遇害。三具血淋淋的尸体躺在当地，麻花在查验，衙役在四处搜索。经验明正身，死者也姓武。狄公认为：两起杀人案，死者都武姓，这完全不是巧合，而是有预谋、有计划的一种复仇行为。是一种可怕的、变态的复仇。

博州，狄公寻找玲珑，找得很苦。很快，对翠屏楼的蹲守有了进展。狄公果断查抄了翠屏楼，抓捕了鸨儿翠红和妓女粉儿。粉儿当堂指认了翠红的指使，翠红则豪迈地承认，事情都是她干的，她就是要这样干。她原来是郭湘成府上的丫头，她认为是狄仁杰和妖后武则天的迫害，使他家老爷家破人亡；她发过誓要为他们报仇。她要杀死所有姓武的人，狄公劝诫她一番后说，我希望你能够帮我找到玲珑姑娘，我知道她才是真正的幕后主使。

李多祚庆幸，好在狄公及时勘破了此案，不然的话，极有可能让武承嗣有可乘之机，利用他人之手达到排除异己的目的。但是，狄公担心问题恐怕不会那么简单。果然，第二天会审的时候，翠红、粉儿姑娘反水，将她们的幕后主使栽在了狄公的头上，而且言之凿凿，不容争辩。更让人想不到的是，一直跟随他协助破案的衙役麻花，也突然露出真面，对他进行了无中生有的诽谤和诬陷。所有的目光都落在狄公的脸上，他再怎么也说不清了。

狄光远听到狄公的消息后，主动向武则天请战参与破案，并且出手不凡，险些将刺客一举抓获。然而，突然又有黑衣蒙面人介入，将就要被擒的刺客救走了。武则天传旨，要不惜一切代价将凶手缉拿归案，她要看看刺客究竟是什么人。行刺失手被救的刺客就是公主馒头。令她奇怪的是，救她的蒙面人竟然将她带到了大理寺。馒头佯装要走，趁对方不注意，突然出手扯下了对方的面罩。与此同时，对方也一把扯下了她的面罩。

押解囚车的官兵队伍逶迤走出了镇子，向远方而去。囚车只剩下了一辆，里边坐着狄仁杰。镇外的山坡上，默然站立着粉儿、翠红和麻花儿。他们呆然地站着，完全是一副很失落的样子。粉儿突然捂着脸哭出了声音，她捂着脸跑去，她跑得很快，渐渐消失在晨曦中。在押解狄公回京的路上，玲珑发动了又一次袭击。但由于粉儿姑娘故意把红玫瑰放在酒店柜台上，提前提醒了狄公。这才令他们躲过一劫。

玲珑要粉儿自裁，醒来的色子挺身而出英雄救美，劝说玲珑放掉粉儿，自己愿意替粉儿去死。玲珑被震撼，她转身消失在蒙蒙的夜幕中了。色子告别粉儿姑娘，说他要走了，狄大人还背着杀人的罪名，他不愿意看着狄公无辜被关进天牢！他的功力现在虽然没有恢复，但至少可以证明狄公是无辜的！粉儿突然问色子：如果有人愿意作证的话，狄大人就会没事吗？我想和你一起回京城。

随着狄公被押解回京，玲珑等一干人马随后也秘密潜入了洛阳。玲珑来到十六年前在城外栖身的庙宇中。当年的花圃虽然已经不复存在，但废墟上依旧野花盛开。她追忆往事，觉得当年营救太子本来计划的很周详、很完美，简直可以说是天衣无缝。如果不是狄仁杰从中作梗。狄公向武则天汇报，混在京城的杀手们还没有露面。武则天调侃几句，赐了他行走金牌。狄公出得殿来，遇到了一位跋扈女子。

狄仁杰父子分析梁雨潇其人，困惑一个女孩子为什么要女扮男装参加会考？她的动机和目的究竟是什么呢？她确实是个疑点重重的人，可她身上的疑点和她那种直率的劲儿似乎又很矛盾。馒头行刺武承嗣失手，暗器伤了吴子虚的胳膊后，趁机蹿上了房顶，消失在夜幕中。狄仁杰来见武承嗣，询问吴子虚杀手特征时，无意中发现吴子虚的后脖子上有一个很不显眼的纹身，狄仁杰奇怪地看着，那纹身很像是一朵花。

狄公和李多祚分析此事，怀疑梁雨潇是郭湘成的孩子，觉得要真是那样，可就麻烦大了！二人决定此事暂时不要说出去。武则天接着传狄仁杰进宫，告诉他，她觉得十多年前的那场风云似乎又要飘回来了！狄公觉得梁雨潇利用会考的机会想进宫寻找亲生母亲，这可以理解；问题是锦媛公主为什么也会卷到其中？仅仅是因为女孩子之间的吃醋吗？像也不像，难道她们中间还有什么其他的瓜葛？他找到徐莫愁想进一步查清梁雨潇的身世。

色子和粉儿来到京城，狄公非常高兴。看见狄公没事，并且不需要作证，粉儿就打算离开。狄公分析从锦媛阁搜集的馒头鞋上洒落的那点泥土，依稀看到残碎的花瓣，很小，很不起眼。狄公的鼻子似乎闻到了什么，他把鼻子凑到泥土上仔细闻着，闻得很细。狄公若有所思：“花中有药，药中有花”。武承嗣的手下在监视狄府，被狄光远发现了。

狄仁杰在家中闭门思过，整个京城都因为天牢的命案乱了套。段无涯觉得时机不错，完全可以趁乱发难，乱而取之！唐子贤却觉得朝廷中所谓的混乱都只是表面现象，只要武则天和狄仁杰两个人不乱，他们就不能下手！他感觉好像武则天和狄仁杰是在给人们演戏！而且是一出以静制动的戏。他们是在等待机会，而武则天和狄仁杰是在等着有人跳出来！所以，他不能重蹈徐敬业和琅琊王失败的覆辙。

色子根据狄公提供的泥土，终于找到了玲珑的藏身地，在郊外破庙后面的一个暗室里。武承嗣的人也发现了这个地方，他决定露一手给皇上看看，于是命令吴子虚集合自己的人马，务必要把玲珑等缉拿归案。而此时的密室中，玲珑正在和前来奉劝她的段无涯争吵。段无涯要她必须马上罢手，不要再做任何蠢事。

狄仁杰去天牢询问梁雨潇，据梁雨潇供证，她最近几天又找过玉珠，开始玉珠一直躲着她，可后来又主动约她去。当时玉珠的样子很紧张，令她感到很奇怪。至于玉珠房间里的凶器和信件又是怎么回事？她却一无所知。但那封信件上的字迹是却显然是她梁雨潇的！梁雨潇一愣，她想到了唐子贤，狄公告别梁雨潇出来，恰恰遇到了前来探监的唐子贤，于是巧计邀唐子贤出去喝酒，借给唐、梁传书的名义，拿到了唐子贤的书法笔迹。

而此时的馒头也十分痛苦，她坐在床上，呆呆地睁着一双惊恐的眼睛。喃喃地自语着。一支短小精悍的护卫队簇拥着两辆马车在绚丽的晚霞中缓缓驶入洛阳城。分别坐在两辆马车上的是狄夫人、张柬之和狄福。随一行人前来的还有个傻子名叫糊涂，糊涂不坐马车，而是像孩子似的跑前跑后，一边嘻嘻哈哈地笑着。街道旁的酒楼上，吴子虚探出头来，一双阴冷的眼睛盯着经过的马车。

武则天亲自提审狄光远，狄光远请求她恩准三天时间，如果三天之内不能将凶手绳之以法，愿意在满朝文武面前自刎谢罪！张柬之带兵包围了狄府，宣皇上口喻，对狄府严加管束，无旨一律不许擅自外出，违令者格杀勿论！狄仁杰一声不吭，一动不动，他仿佛真的成了一块石头。张柬之正准备离开，石头般的狄仁杰终于说话了。“张大人，能麻烦您一件事吗？替我到锦媛阁向锦媛公主请安！”张柬之受狄公委托，前来求见锦媛公主。

玲珑主动投诚见到了狄仁杰，供认粉儿是她杀的，与梁雨潇无关！她求狄仁杰把梁雨潇放了，由她去坐牢！狄仁杰告诉她，你想自首当然欢迎，但要以人易人，恐怕不是你我能说了算！大周的律条不是像做买卖，你给银子我给货那么容易！即使没有这种所谓的交换，你坐牢也是迟早的事！不过，狄公还是很想知道，玲珑为什么要做这种交换？玲珑说至少你应该相信梁雨潇不会杀人。

不幸的是，被抓进大理寺的玲珑很快就死了。经调查，是有人伪造圣旨混入监狱杀死了她。这个伪造圣旨的又是什么人呢？他们为什么要杀死玲珑呢？狄公从玲珑自首的目的是想用自己交换出关在牢里的梁雨潇开始推理，由此断定郭湘成不仅还活着，接着他根据梁雨潇提供的情况，发现唐子贤的字和郭湘成非常相像，难道唐子贤会是郭湘成当年换走的那个太子的后人。

狄仁杰到监狱里看望飞燕姑娘，飞燕是替光远而死的，她也不想活在这仇恨中。红唇将军段无涯到大明宫遇刺皇上，结果早让狄仁杰识破，命令化装成傻子的色子保护皇上。唐子贤也在此刻去偷袭了狄府，被狄光远察觉到，最终狄光远负伤。对垒的两军同时回眸，他们看到了一支短小精悍的马队，看到了奔驰在最前面的狄仁杰和李贤。战争的硝烟没有燃起，天空中的太阳依旧明媚。武则天大赦天下，泰安冤案也终于得到平反。

对垒的两军同时回眸，他们看到了一支短小精悍的马队，看到了奔驰在最前面的狄仁杰和李贤。战争的硝烟没有燃起，天空中的太阳依旧明媚。武则天大赦天下，泰安冤案也终于得到平反。一辆马车驶出洛阳城，马车上坐着狄仁杰和狄夫人，赶车的竟然是李贤，色子骑着一匹马跟随在后面。狄夫人想让狄公参谋一下娶哪位姑娘更合适，可回答她的却是狄公的呼噜声。他太累了，睡着了，睡得很香。