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民国时期，一个雨夜，上海某大户人家病重的秦老爷在服了孟河医派翁泉海的药后，突然死亡。秦家人将翁泉海告上法庭，翁泉海坚称：诊断无误、用药无误。翁父携翁泉海的两个女儿和葆秀来上海投奔，得知翁泉海摊上官司，到狱中探望，见翁泉海正心无旁骛地给同监的人诊病，心下有数。葆秀温婉贤淑，悉心照顾翁家老小。为查明秦仲山死因，她乔装到秦家做了佣人，得知给秦老爷看病的还有赵闵堂。赵闵堂中西医兼修，却家有悍妇。他曾和精通刺血疗法的吴雪初一同给秦仲山看病。
翁父假装身体不适，分别找赵闵堂和吴雪初诊病，拿到二人字迹，连同药方一同交到警局，预作笔迹鉴定。赵闵堂和吴雪初得知后急想对策。法庭上，翁的辩护律师提出秦老爷有服用多人药方的可能，但证据被公安局离奇弄丢了。赵闵堂上门找葆秀，劝翁家退一步不再追究，保证让翁泉海出狱；又去找秦太太，让她向法庭承认秦仲山是生前患有心病，不是药物致死。两下斡旋后，法庭宣判，翁泉海无罪，翁泉海大声为逝者喊冤。
赵闵堂的诊所受官司的流言连累，门庭冷淡，他想出个限号医病的法子，受到病人嘲讽。高小朴多处拜师学医，因铃医身份和太爱卖弄，多次遭到拒绝。终被陆大夫收做学徒。翁泉海外出行医被冷雨浇病，幸遇好心人老沙救助，两人结下友情。提到孟河，老沙若有所思。上海滩出了一个疑难杂症----孕妇死胎不能排出，很多中医束手无策，专攻妇科的赵闵堂得知后技痒，被吴雪初劝阻。翁泉海主动上门医治，家属听说是沾了死人官司的翁泉海，将他撵走。
翁泉海看到报纸宣传，主动来到赵闵堂诊所，请教孕妇症状及赵闵堂开具的药方，被赵闵堂拒绝。孕妇死胎并未如期打下，赵闵堂找各种借口替自己开托。吴雪初让他拖到患妇找西医。翁泉海再次到赵家询问孕妇情况，赵闵堂顺势将这个缠人的病例甩给翁泉海。翁泉海上门诊治，孕妇家属仍无情拒绝。葆秀当着家属的面亲自试药，感动家属，但孕妇吃了药却出了危险，面临手术；翁泉海再次调整药方，死胎终于成功排出。
已拜陆大夫为师的高小朴，因为让他去抓一味急用的药却半天不归，惹怒陆大夫，被逐出师门。原来高小朴是回家给瘫痪的娘送水去了。高小朴娘俩继续铃医生涯，有人告诉他赵闵堂能医好他娘的腿病。小朴背着娘上门求医。小朴娘用药有效，小朴上门求药方不得，密约出赵闵堂的徒弟小龙，想套出给他娘治腿病的秘方，小龙被小朴的三寸不烂之舌说的心动，却被赵闵堂抓了个现形。
翁泉海被神秘人带着，蒙着眼坐车兜圈儿，来到守卫森严的深宅大院，给一个幔帐里伸出手的人切了脉。患者没什么大碍，旁边围观的一大群人表情各异。翁泉海被安全送了回来，家人松了口气。不久神秘人又来请翁泉海出诊，翁拒绝。神秘人竟然以民族大义为理由，恳请翁泉海再次出诊。此次脉象与上次大相径庭，一次生脉、一次死脉，非常蹊跷。翁泉海有些为自家人担忧，葆秀却一直宽慰他。
小朴给赵闵堂想了一出“神龟治病”的点子，一时患者盈门。小朴又提出卖神龟，赵闵堂认为自己是名门正派，拒绝了。神秘人送来一封信，又请翁泉海出诊。依信件指引，翁泉海被带到一片树林中，一伙黑衣人用金钱和家人诱逼翁泉海给高官看病时炸死他，被神秘人乱枪打跑。枪声惊动了泉海堂的人，葆秀心急如焚。翁泉海第三次到高官家，当场诊断患者已死，三个儿子闻听立刻争斗起来，各自原形毕露。
赵闵堂和患者强辞夺理，患者们找到翁泉海，希望他能给大家评评理。翁泉海来到赵闵堂诊所，提醒他应谨遵医理医道，不能旁门左道，赵闵堂气得扔了乌龟。高小朴怂恿赵闵堂去给一位温先生诊病，诊治不顺，遭到温先生掏枪威胁，小朴侥幸脱困，赵闵堂被关起来，晕了过去。翁泉海在面馆里偶遇一女子咳得厉害，随口开个食疗方子，女子道谢后离开。翁父来到上海，张罗翁泉海和葆秀成亲，好早日抱孙子。翁泉海被迫成亲，却无意圆房，葆秀有些失望。
温家人又重金请翁泉海出诊，翁不为所动。温先生亲自上泉海堂看病，翁泉海通过望诊判断温先生脖子后面长了东西，温不让看。因曾饱受庸医之苦，温先生怀疑大夫。翁大夫诊治温先生后脖子上长的肉包并不难治，外敷一服药即好。温先生放了其它中医。翁泉海要和葆秀分居，葆秀难过。过年了，全家人其乐融融，翁泉海给亡妻烧了封信，心中悲凉。患者范先生在翁大夫处开了药方后，图便宜在药贩手里买的药材，治疗效果不好，要翁泉海退诊费。
诊所里来了个狂症患者乔大川，曾是职业刽子手，总觉得鬼怪缠身，还在医治时突然发狂险些勒死赵闵堂。范先生病好后请翁泉海吃饭，同时邀了昆曲名角岳小婉，刚好是那天咳嗽的女子，用了翁泉海的方子已痊愈，她向翁泉海致谢，俩人一见如故。翁泉海酒后回家弹起多年不碰的古琴，葆秀心下疑惑。乔大川又来到赵闵堂的诊所，觉得只有在这里才心安，赵偷偷溜回了家，乔大川找到家里，声称病好，要表示感谢，结果没聊几句突然拎出刀又发起狂来，吓得赵闵堂两口子魂飞魄散，不得安生。
