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国军特别行动队队长叶尚武一心为国抗日，听闻皖南事变中同胞自相残杀，他将无数愤慨都发泄在了轰炸日军油库的行动中。在追击逃跑日军的过程中他偶然得知弟弟叶尚文被俘入狱，决定舍弃一切，化名贺韬到鹿山监狱实施营救。此时的叶尚文因为中共重庆地下党学联负责人的身份在鹿山监狱内受尽折磨。而在重庆由皖南事变掀起的轩然大波还在发酵，中共重庆工委外联组长陆远行奔波不断，与老辛为维护抗日统一战线做出最大努力。重庆码头管制严格，雾都晚报女记者庄惠看不惯稽查署暴行，出手相助平民。在日特的威逼利诱下，稽查署内奸，二处处长刘博开始伙同鹿山监狱监狱长周富贵展开一个惊天阴谋。贺韬经多方打听得知监狱内正缺拉粪工人，于是趁机装疯卖傻混入监狱之中。在观察数天之后，他联系上了之前的竞争对手，中共高级特工庄栋，两人联手计划越狱行动。周富贵在刘博的鼓动下，暗中进行部署，促使监狱犯人自发暴动从而得利升官。贺韬在狱中见弟弟受尽苦楚，决定提前实施越狱计划。
心急如焚地贺韬提前进行了越狱计划，带着大家一路外逃，可也正好落入了之前周富贵埋下的圈套之中，所有人都死在了隐蔽的枪口下，只有贺韬得幸生还。监狱暴动被镇压的消息同时传到了重庆，稽查署一处处长王丰安气愤之极，当即赶往鹿山。凭借对新闻的敏感，雾都晚报的女记者庄惠偷偷搭上了去往鹿山的顺风车，想要一探究竟。周富贵为了防范王丰安的审查，开始紧锣密鼓的做起准备，以防露出马脚。与此同时，庄惠先一步来到鹿山监狱，在附近偷拍齐思武枪杀共产党的照片，但不小心从树上掉下被抓回审问。贺韬潜回监狱开始自己的复仇计划，他换上罗钦的军官服潜入浴室杀死齐思武和周富贵，而后开车强行冲出大门。王丰安勘探凶杀现场寻找蛛丝马迹，让张亮带队一路围追堵截贺韬。而此时，贺韬早已在追兵的必经之路上埋好了炸药，并想好了脱身的万全之策。
郎忠邀请王丰安到两江会馆喝茶，欲了解庄惠情况并拜托王丰安关照庄惠。贺韬再次回到重庆，继续自己的复仇计划。可这山城三教九流、鱼龙混杂，当务之急便要寻个靠山。打听再三，郎忠便成了最佳的选择，不料初次登门，贺韬就吃了闭门羹。杜欣回到家后向王丰安叙述了老辛听闻监狱事件之后的反应，她断定老辛肯定是个共产党员，王丰安若有所思。贺韬几经辗转，寻得了一个空宅子，作为自己的临时住所，准备开始自己的下一步计划。庄惠因为去鹿山丢了报社的相机而被陆远行追要不止，有气没处撒的她和关敏到稽查署门口逼问了一通，也是无功而返。码头上唐三例行要查验货物与新上任的防疫局局长罗钦发生争执。在一旁查案的王丰安一眼认出这个罗钦就是当时鹿山监狱的狱医，遂让贾启云上前解围，做个顺水人情。贺韬准备趁乱在码头暗杀罗钦，没想到庄惠突然出现喊住了贺韬。罗钦惊慌之中朝天开枪，人群大乱，庄惠被挤落水中，贺韬无奈下水救人。看着落水救人者浮在水面的衣服，王丰安推断庄惠与鹿山案绝对脱不了干系，于是派贾启云查探庄惠与罗钦的关系。得知庄惠落水，郎忠气极
贺韬收拾好行李准备离开重庆，黄善却寻上门来说郎忠请他去望江楼吃饭。两人席间相谈甚欢，贺韬坦言自己欠郎忠一个人情，两人第一次见面时，那个赌命的左轮手枪并没有放子弹。郎忠笑而不语，用这个人情把贺韬留在了重庆，并告诉了他一个别人都不知道的秘密。贾启云近日经常神游，王丰安打听之下才得知，贾启云的哥哥被一个喝了酒的坦克排长压死。不出两日，王丰安秘捕这个狂妄的坦克排长，亲手枪决了他。陆远行和老辛得到了一份秘密特工的名单，庄惠哥哥庄栋的名字赫然在列，他们准备晚上到庄家一趟了解情况。当晚，王丰安带着贾启云也到了庄家，据王丰安分析，共产党庄栋是鹿山杀手的可能性极大。郎忠听闻王丰安带人围了庄家之后，带着贺韬急忙赶到庄家，庄惠见贺韬与郎忠在一起惊讶不已。
皇后夜总会里，秦如烟利用美色成功诱导唐三对暗杀李炜的杀手发出了悬赏公告。胆小的谢四虎一人来到李炜的宅子为其烧纸，却被一些风吹草动的动静吓走。悬赏公告次日便登上了各大报纸，各方势力看法不一。刘博找来了唐三，唐三说出了自己的看法，对于秦如烟的诱导，他心中其实一本明账。他正要借这个机会，一来撇清自己和李炜的死因毫无关系，二来让杀手注意到这个悬赏找到他，借这个杀手除掉郎忠。陆远行急需找出背后凶手，与老辛商量对策。尹相平看中了刘博心慌，怂恿他杀十个共产党来威慑凶手，刘博被劝服后和谢四虎，张亮准备行动计划。庄惠无意间发现了庄栋给贺韬的十字架，贺韬对庄惠撒谎是朋友送的，他不知道庄惠自己有一个一模一样的，是庄母给二人求的平安符。关敏受陆远行之命送戏票给王丰安，请他们一家去戏园看戏。王丰安难得放下了工作，穿上了便服欲和杜欣去看戏，两人回忆起过去的往事，感慨不已。王丰安让杜欣借此机会，开导开导久未谋面的陆远行。贾启云得到了王丰安的批准后与关敏一起看戏并打晕了孙兴。
戏院里，陆远行向王丰安出示了证据，洗清了庄栋是凶手的嫌疑，并告知王丰安庄栋死于鹿山监狱。戏剧结束时，杜欣为王丰安挡住了暗处打出的黑枪，中弹入院。贾启云等人追出，却跟丢了人。庄惠装病想从贺韬口中套出庄栋下落，贺韬只好编个故事蒙混过关。王丰安从稽查署赶到医院与陆远行激烈争吵，难得放下工作陪陪杜欣，却让她永远失去了做母亲的机会。王丰安在医院的长椅上留下了悔恨的泪水，在他心中，自己一直坚持的信念微微动摇。刘博等人在茅家岭秘密处决了十名学生，引发了巨大的波澜。陆远行与老辛秘密见面，分析国民党这一举动分明是报复行为，你杀我一个，我杀你十个，如此这般下去必然有更多的无辜生命受到牵连。陆远行向老辛请示，希望能和王丰安联手破案。为了不连累庄家母女，贺韬回义庄与余洁告别后准备离开重庆，可在码头得知了茅家岭事件的发生。十个无辜少年成了他的替罪羔羊，贺韬决定留下。庄惠也急着要去茅家岭采访被陆远行阻止，决定带她一起去新闻发布会。郎忠来到庄惠家中，从庄母口中得到庄惠已与贺韬好上的消息。
郎忠怒气冲冲地回到望江楼，秦如烟正巧上门，碰了个软钉子。刘博带着杜月到医院看望杜欣，王丰安发誓一定要让凶手偿命。贺韬回到义庄，看见余洁旧伤复发晕倒在地上，他急忙抱着余洁去了七女的药房。尹相平正在药房与七女谈事，听到贺韬的叫门声后急忙躲进了暗室。因为开门的时间差，让贺韬对七女的身份产生了怀疑。庄惠在新闻发布会上处处与国民党军方代表针锋相对，尖锐的问题让代表无法正面回答，只得草草结束。刚离开发布会的庄惠就被稽查署请回，刘博警告了她之后，对其下了药送回刘宅欲行不轨。尾随而至的贺韬成功地救出庄惠，把她带到了自己的临时住处安置。庄惠醒来后继续纠缠贺韬，询问庄栋的下落。
稽查署欲在皇后夜总会举行表彰大会，为谢四虎颁发晋升令。各方纷纷就本次表彰大会产生怀疑，而这个表彰大会背后的真正目的，其实是刘博为了引出杀手，好解决自己的后顾之忧。王丰安也想借机抓捕凶手，陆远行则准备阻止杀手继续行凶，弥补国共合作的裂痕。庄惠不顾陆远行阻拦，偷偷拿走表彰会请帖，准备晚上当场质问刘博茅家岭事件前后始末。 贺韬在义庄发现炸弹之后，心生一计，与余洁共同制作了香槟炸弹，准备袭击庆功会场。炸药的份量不够，贺韬想到了后山上的哑弹，但来到后山却发现尹相平带着手下在排弹。如此这般，他对尹相平是共产党的身份更加坚信不疑。唐三做好多方面的准备，迎接表彰会的到来，只有谢四虎此时手足无措，他不想被当做靶子可又不得不上。余洁得知贺韬的决定后，嚷着要跟去帮忙，可贺韬知道这次凶多吉少，趁着喝酒，打晕了余洁，并独自带着炸弹前往皇后夜总会。
一连串的事情让谢四虎对刘博产生了恨意，他准备了些小礼物到刘博家讨杜月欢心。趁杜月不备，在其茶水中下药，准备趁杜月人事不省时给刘博戴绿帽。熟料，刘博正巧回来，而此时的贺韬潜了入刘家，用枪威胁刘博打电话给监狱，告知有位长官要来办事。贺韬前脚离去， 怀志远尾随其后连杀刘博夫妇二人，藏在衣橱里的谢四虎目睹了这一切。贺韬潜入监狱，见到董群之后却被其赶走，只能眼睁睁地看着董群引爆炸弹自杀。在医院的王丰安与陆远行听说刘博一家被杀之后惊讶不已，陆远行出院回到报社与老辛商讨刘博被杀的背后目的。贺韬要求尹相平告知他的真实身份，尹相平带他进入已伪装好的密室，成功地让贺韬相信他就是中共地下党特派员。七女成功地说服余洁让自己照顾庄惠，以便掌握贺韬的一切动向。陆远行暗示贺韬，杀手不该杀死妇女，贺韬不愿背负黑锅，决定找到幕后真凶。
贺韬离开医院来到国威俱乐部，告知尹相平，谢四虎趁乱逃走的消息，并误以为尹相平是共产党。秦如烟开始了教书的生活，这让她感到了前所未有的踏实，余洁和薛娃子也跟着孩子们一起学习。贺韬了解了秦如烟的想法后让她安心地在书坊教书，自己帮她去解决唐三那边的麻烦。张亮偷偷地把谢四虎的逃跑路线泄露给了尹相平，怀志远早早埋伏在树林里狙杀了谢四虎全家。次日消息传出，王丰安官复原职被局座委以重任，探寻真相。尹相平利用苦肉计加深了贺韬对自己的信任，他向其说明了黑猫计划行动的重要性，进一步诱导贺韬为自己做事。薛娃子无意间撞破七女的身份，被七女残忍杀害。陆远行私下与国民党合作、私自放走鹿山案杀手，被组织撤销职位，送往延安反省学习。陆远行表示不消灭乌鸦他哪也不去。鉴于贺韬近日经常失踪，陆远行亲自到夜总会查探消息。尹相平看到报纸上关于贺韬与庄惠的新闻，要求怀志远查明庄惠与贺韬的关系，以防黑猫计划受其影响。
