夜晚的紫禁城庄严静穆，年少的康熙皇帝还在乾清宫内批阅奏折。无数只巨大的风筝悄无声息的落在乾清宫前，从风筝里跑出无数个壮汉准备夜袭紫禁城。禁卫军纷纷赶到与这群壮汉打了起来，一白衣男子径直闯进大殿内欲赐杀康熙皇帝。这名男子正是天地会总舵主陈近南。康熙发现有刺客侵入，开动了机关，一排铁栅栏挡在了他和陈近南之间。少保鳌拜闻讯赶来保护康熙，鳌拜练有金钟罩刀枪不入，陈近南的攻击损伤不了鳌拜的一根汗毛。鳌拜的右手伸出一个金刚爪抓向陈近南。陈近南逃出殿外，鳌拜紧跟其后杀将过来。一只风筝从天而降，风筝上的人一把抓住陈近南飞出了紫禁城。花姐是扬州丽春院的一名妓女，早已人老珠黄，生意廖廖。她生有一子名叫韦小宝，可花姐从来不让韦小宝叫她娘只能叫她花姐。韦小宝从小在丽春院长大，耳濡目染长成了一个地道的地痞小混混。他顽劣成性，哪里有热闹都少不了他，但他从小看众姐妹受苦骨子里却有几分侠肝义胆。扬州大街上，一个中年男子满脸是血被鳌拜的黑鹰队追杀。他误跑进丽春院碰到正在洗衣服的花姐，他掏出银子请求花姐让他在这儿躲一阵子。

茅十八和韦小宝被蒙上双眼带进了海公公的房间。海公公以为茅十八是平西王的人，问他此次进京有什么任务。茅十八说自己不是平西王的人，这次来到京城只是想找鳌拜比武。海公公劝茅十八为朝廷做事，茅十八说自己虽然不是天地会的成员，但是他一心反清复明。海公公敬茅十八是条好汉，说今天的事就不了了之。听说海公公要放了他们两个，茅十八和韦小宝拔腿就往外走。谁知海公公斥责两人不懂江湖规矩，要让他们两个留点东西再走，茅十八和韦小宝被迫转身。正在这时海公公的哮喘病发作，他让随身的太监小桂子扶自己到内屋泡冷水。茅十八被海公公点了穴跑不动，韦小宝怕他们俩在这里丢了性命，灵机一动他把海公公放在桌子上的药全部倒在了海公公的杯子里。海公公泡好了冷水，从内屋走出来把杯子里的药全部喝了。突然间海公公什么也看不到了跌倒在地上，小桂子正要扶起海公公被韦小宝一刀捅死了。茅十八的双腿被点了穴道只能倒立着慢慢爬出去，为了给茅十八争取离开皇宫的时间，韦小宝决定自己先留下来。

韦小宝每天和小玄子都去布衣库比武，可是每次他都打不赢小玄子。海公公告诉他小玄子学的是武当派的武功，要用他们少林派的武功去制他。海公公让韦小宝每天苦练少林大擒拿手。鳌拜假传圣旨下令没收了庄允城的家产，并且把男丁全部押往京城。庄允城的女儿双儿看到父亲和爷爷都被黑鹰队的人押走了不禁痛哭流涕。鳌拜的手下建议鳌拜要把庄允城和天地会扯上关系才能彻底扳倒苏克萨哈。鳌拜决定利用经常给自己送消息的风际中来完成这个阴谋。夜晚几个天地会的人到刑部大牢救庄允城，被黑鹰队的人抓住。温家兄弟为了让韦小宝替他们保守秘密请韦小宝喝酒，韦小宝告诉温家兄弟他们借的钱是海公公的不可能不还，如果不还他就要去告诉他们的上司乌公公。温家兄弟说如果让海公公和乌公公知道了他们俩就没命了，韦小宝让他俩带自己去上书房见皇上，他就会替他俩保守秘密。韦小宝喝醉了，他误闯进宁寿宫以为是到了自己的房间，爬上床就睡着了。宁寿宫是康熙是宠爱的妹妹建宁公主的闺房，建宁公主洗完澡也径直到床上睡觉了，韦小宝无意亲吻了建宁，酒醒了一大半慌忙逃出宁寿宫。

康熙说这下韦小宝知道他的秘密了，韦小宝连忙说自己无意触犯了龙体向康熙请罪。康熙却说他每天还要和韦小宝比武而且还是真打，康熙和韦小宝约定人前韦小宝叫他皇上人后韦小宝还是叫他小玄子。康熙因为鳌拜冒犯自己心情不好，他告诉韦小宝鳌拜掌握八旗兵权在朝中目中无人，经常无视他这个皇帝，为此他很苦恼。康熙让小宝为今天的事情保守秘密。海公公听了韦小宝和小玄子打斗的详情后，他说韦小宝是在故意让着小玄子。他抓住韦小宝问小宝是怎么知道小玄子就是皇帝的。韦小宝无奈把今天在上书房发生的事情都告诉了海公公。海公公劝告韦小宝今后皇帝再说要和他做好朋友之类的话，他千万不要附和，否则有可能性命不保。老谋深算的海公公其实早已知道韦小宝不是真的小桂子，但是他还想利用韦小宝去为自己偷取四十二章经，所以并没有揭穿小宝。海公公要收小宝为徒教他武功，让他继续到上书房找四十二章经。慈宁宫内皇太后雍容华贵端坐在凤椅上，一只蜜蜂从她面前飞过，只见她指甲一弹蜜蜂就死了，这位深居大内的皇太后竟然是一名武林高手。

皇太后的师兄担心皇太后会武功的事被宫内其他人知道，对小桂子起了杀心。建宁差人传小桂子晚上去她宫里侍奉，韦小宝无意中把建宁会阴风爪的事告诉了海公公。韦小宝来到宁寿宫，建宁让他绣一只鸡，故意拿针扎着他玩儿。侍卫总管多隆来到宁寿宫说皇上要找小桂子到布衣库比武，小宝才得以脱身。建宁让手下宫女喜鹊每天到尚膳监教小桂子学三个时辰的刺绣。鳌拜怂恿朝中大臣上折子弹劾苏克大人，看到这一百多个弹劾苏克的折子康熙不得不处死了苏克。康熙摆脱不了鳌拜的控制心里憋闷，他来到布衣库对着假人一通乱揍以发泄心中的委屈。韦小宝带着康熙一起烤鸡吃，康熙的心情终于多云转晴。韦小宝说建宁公主逼着自己学刺绣，康熙让他找个宫女替他绣这只鸡不就行了。多隆告诉韦小宝，鳌拜练有金钟罩护体，征战沙场别人近不得他身，颇受先皇器重。多隆见韦小宝深讨康熙喜欢，为了拉拢小宝，多隆和韦小宝义结金兰。索额图告诉皇上庄允城并没有被天地会劫走，而是被鳌拜的手下杀死了。

皇太后得知陪康熙练武、和建宁玩耍的人都是海公公身旁的小桂子，她决定除掉小桂子。晚上皇太后的师兄夜访尚膳监和海公公厮打起来，皇太后的师兄并未占上风。皇太后的师兄告诉皇太后海公公虽然眼睛瞎了却仍然能够躲避自己发出的钢珠，武功十分了得，而且海大富用的招数也不是出自少林派。康熙得了两名高手，决定利用紫云山狩猎的机会除掉鳌拜。康熙到紫云山狩猎，建宁假扮太监也跟了来，在路上建宁被石头绊倒，暴露了身份，索额图说自己会照顾建宁公主让康熙放心。康熙设计鳌拜，让鳌拜到树林中去猎杀麋鹿，鳌拜射中麋鹿就顺势喝下麋鹿的血。这时白尔赫带领禁卫军包围了鳌拜，双方在树林打斗起来。康熙等人在围帐之中等待白尔赫的好消息，陈近南却飞身来到康熙身边欲刺杀康熙，紧要关头韦小宝用身体挡住了康熙，陈近南认出了韦小宝，因自己欠小宝的人情，陈近南饶过了康熙，说自己从此与韦小宝两不相欠，说完就飞走了。眼看鳌拜就要被两名高手治服，黑鹰队队长铁虎却趁陈近南刺杀康熙之际跑进树林增援鳌拜，白尔赫被黑鹰队俘获。

海公公带着韦小宝来到皇家陵寝，他让韦小宝找出端敬皇后的棺木，突然从棺木中飞出一个戴着面具的白衣人，韦小宝以为遇见了鬼吓得魂飞魄散，海公公也被白衣人打晕了。这时候茅十八来到陵寝挡住了白衣人，他担心韦小宝的安全，一路跟踪韦小宝来到此地。海公公让韦小宝趁着茅十八和白衣人打斗之时拿出端敬皇后的骨头，茅十八用剑划破了白衣人的面具，白衣人慌忙逃走了。只见海公公轻轻一折那骨头就断了，海公公确定端敬皇后是被化骨绵掌打死的。海公公让小宝带着他去找当年为皇族验尸的李仵作，他让李仵作回忆当时殓收端敬皇后等四人尸体时的情况，李仵作却不肯告诉他。海公公说自己一生追随先帝，这四个人对先帝十分重要，他一定要查出这件事的真相。建宁在客栈房间被人袭击，不见了踪影。海公公告诉韦小宝今天他们去找了李仵作，那一定会有人要去处理李仵作，因为建宁一直折磨小宝，他就把建宁放到了李仵作的床上。韦小宝一听赶忙跑到李仵作的家里，正好看到一个蒙面人要杀李仵作。韦小宝大叫床上的人不是李仵作，蒙面人掀开被子，被子里竟然是建宁。

康熙对鳌拜说他这里有八个小太监正在学习武功，让鳌拜给这八个小太监指点一下。八个绝命小童子把鳌拜团团围住，拿起长茅向鳌拜刺去，谁知鳌拜功夫十分了得把绝命童子各个击破，康熙见绝命童子全军覆没就拿起弓箭射向鳌拜，飞出去的箭却被鳌拜一把抓住，鳌拜大怒说康熙原来是要杀死自己，他把康熙和韦小宝打了个半死，鳌拜把康熙高高举起，准备摔死他，韦小宝急中生智取出鞭子中的绣花针向鳌拜的会阴刺去，刹那间鳌拜的纯阳神功被破，康熙和韦小宝趁此大好机会把鳌拜一通痛打，生擒了鳌拜。康熙诏告大臣鳌拜欲行刺自己已被活捉，他下令清剿鳌拜的党羽。韦小宝捉拿鳌拜立了功，康熙向皇太后替韦小宝请功，皇太后赐韦小宝六品太监首领。韦小宝把今天大战鳌拜的事情告诉了海公公，海公公问他皇太后给了他什么赏赐，韦小宝说皇太后赏了他一个小小的六品首领太监，海公公说自己从一个小太监做到六品首领用了13年的时间 。韦小宝想起建宁让自己刺的绣品海公公说已经扔了，韦小宝为了给建宁交差赶忙到垃圾堆里去寻找被扔的绣品，遇到了一个叫陶红英的宫女。

韦小宝把两本四十二章经交给了皇太后，皇太后十分高兴。索额图说他会从自己的那份50万两银子中拿出5万两犒劳手下。他让韦小宝也拿出5万银子来打点宫里的妃子、宫女和太监为自己拉拢人脉。索额图把韦小宝的45万两银子全部换成了小额的银票交给了韦小宝，方便小宝使用。韦小宝告诉海公公自己找到了两本四十二章经，但是皇上让他交给皇太后了。海公公听了脸色变得很奇怪，他说自己每天都在小宝喝的汤里下了毒，让小宝说出是谁指使他来到宫里弄瞎了自己的眼睛。韦小宝见海公公已经知道他是假的小桂子，便抽出靴子里的匕首刺向海公公，海公公一掌把他打了出去。海公公找不到韦小宝的尸体，便来到慈宁宫外面的花园，他说自己要告诉皇太后一个天大的秘密。海公公告诉皇太后先皇已经到五台山清凉寺出家了，但是主子的心中还有一个疑团尚没有解开，那就是董鄂妃之死。他这次回宫就是奉了先皇手喻查明真相。海大富说他竟然查出董鄂妃（端敬皇后）、荣亲王（董鄂妃之子）、孝康皇后（康熙生母）、珍妃娘娘（董鄂妃妹妹）都是死于化骨绵掌。

康熙觉得海公公昨晚突然死在慈宁宫的园子里很是蹊跷，小宝说海公公年龄大了，又经常胡乱吃药，暴病身亡是有可能的，但康熙还是觉得此事有疑问。鳌拜被关在康亲王府假山下面的冰窖中，风逸飞混进王府探明了鳌拜关押的地点，把地图交给了铁虎。为了防止鳌拜被人救走多隆和韦小宝来到康亲王府视察。为报父仇双儿也混进康亲王府做丫鬟，当她端茶给韦小宝的时候韦小宝认出了她，双儿长得聪慧水灵，小宝非常喜欢。铁虎带着黑鹰队来到王府想救走鳌拜，多隆带着官兵把铁虎团团围住，官兵们推出早已准备好的箭车，铁虎被射伤了只好逃走，其他的黑鹰队员全部被官兵杀死了。皇太后升韦小宝为尚膳监的总管，太监们看到韦小宝不仅受到皇上的重用，而且深得太后喜欢，都前来巴结他。陶姑姑为韦小宝绣好了鸡，韦小宝把绣品交给建宁，建宁又像往常一样拧他的耳朵欺负他，韦小宝十分恼火骂她是贱人，谁知建宁听后不仅不生气还觉得很受用，她让韦小宝多骂她几次，遇到建宁这样的奇葩韦小宝哭笑不得。铁虎躲在一个山洞里养伤，风逸飞前来给他送食物。

双儿把饭菜送到冰窖，亲眼看到鳌拜吃进去后才放心离开。小宝来到冰窖看到鳌拜毒发准备拿出匕首杀死了鳌拜，这个时候冰窖的门突然打开闯进来几个蒙面人，蒙面人也是来刺杀鳌拜的，他们与鳌拜打了起来。鳌拜的手脚被四条粗大无比的铁锁链锁着，打斗之中锁链被扯拉，触动了冰窖的机关，霎那间冰窖四周的龙头全部开始吐水，冰窖立刻被洪水淹没。水流冲破冰窖大门韦小宝和鳌拜都被冲了出来，韦小宝用铁锁链把鳌拜给勒死了。几个蒙面人取下鳌拜的首级准备离开时，多隆带着官兵赶来了。为了脱身蒙面人抓住了韦小宝当人质坐上一辆马车离开了。康熙听到韦小宝被人劫走非常着急，让手下赶紧四处寻找。这几个蒙面人原来是天地会的人，天地会的人拿鳌拜的人头祭奠了死去的兄弟。因为当初约定的是谁杀死了鳌拜谁就做青木堂的香主，为了了解小宝的底细大家追问韦小宝为什么要杀死鳌拜，小宝就把当初花姐在丽春院私藏尹香主的事情说了出来，韦小宝为了保住自己的性命，他只好说自己和大家的志向一样都是为了反清复明。

陈近南让小宝加入天地会，按照天地会规矩他在韦小宝的双脚刺下了反清复明四个字。陈近南任命韦小宝为天地会青木堂香主，他告诉会中兄弟韦小宝在宫中身居要职，天地会可以利用韦小宝里应外合一举杀死清廷皇帝康熙。花姐来到京城寻找韦小宝，徐香主得知她是小宝的娘亲便把花姐带到了天地会的香堂。韦小宝告诉花姐自己现在是天地会的人了，而且还是总舵主陈近南的徒弟。韦小宝虽然不愿意当青木堂的香主，但是形势所逼他不得不被迫接受。回到自己房间韦小宝告诉花姐自己还在宫廷当差。天地会就是因为自己在皇上身边做事才让自己做香主，因为他们要反清复明杀死皇帝。花姐听后花容失色为韦小宝的性命担心。陈近南把天地会的口令传授给了韦小宝让他回宫去继续当差。离开天地会韦小宝如鱼得水带着花姐逛京城，买了一大车的东西，花姐开心的不得了。韦小宝完好无损回到皇宫，康熙和建宁都非常高兴。建宁把韦小宝传唤到宁寿宫正跟他耳鬓厮磨时，太后却来了。韦小宝赶忙逃回自己的住所，建宁却又追了过来。

韦小宝和天地会的兄弟回来却发现徐香主被人劫走了。天地会的人认为是沐王府掳走了徐香主，为了让沐王府不敢动徐香主，他们把屏儿劫持了让韦小宝把她藏在皇宫里。韦小宝把屏儿放到自己的床上，他说屏儿在丽春院打了自己并骂自己是只小乌龟，这下屏儿落在自己手上，他要好好折磨屏儿一番。韦小宝拿起毛笔在屏儿脸上画了一只乌龟，还拿起匕首吓唬屏儿说如果她不听话就要弄花她的脸。屏儿答应小宝自己不会乱喊乱叫，韦小宝又在她的脸上抹了一些美容的草药。小太监跑来说康亲王前来找小宝，小宝顾不上屏儿就走了。建宁听说皇上要把自己嫁给吴应熊十分生气，她说自己连吴应熊人长得什么样都不知道，怎么可能嫁给他。康亲王邀请韦小宝到王府做客。索额图告诉小宝吴应熊一会儿也会来，而且吴应熊此次来到王府就是为了见韦小宝。索额图交代韦小宝无论吴应熊送他什么礼物，他都不要表现出高兴的样子，要冷淡地对待吴应熊，这样吴应熊就会送他一份大礼。吴应熊来到康亲王府见到韦小宝把小宝好好地恭维了一番。大家落座之后丫鬟们前来上茶，韦小宝却发现上茶的丫鬟竟然是建宁公主。

韦小宝回到自己房间，屏儿的穴道过了六个时辰已经自行解开了。屏儿要离开皇宫去找自己的哥哥，韦小宝让她不要乱跑。正在两人拉扯之时屏儿和小宝仿佛看到了一个女鬼向他们飞来，两人吓得跑进房间钻进被子里。女鬼说小宝害死了海公公自己是来取他性命的，韦小宝听出这个女鬼就是太后。太后把韦小宝从被子里拉出来准备杀他，韦小宝拿出匕首刺伤了太后的手，这时太后听到外面有人喊叫抓刺客，她只好逃走了。皇宫里闯进许多蒙面刺客，禁卫军和刺客打了起来。屏儿在房间里听到刺客说的暗语竟然是沐王府的暗语，她告诉韦小宝这些刺客是沐王府的人。等侍卫们都走了以后韦小宝扶着屏儿走出房间发现有一个刺客竟然还活着，屏儿发现她是自己的方怡。韦小宝和屏儿把方怡扶到床上休息，方怡看不惯韦小宝油腔滑调，她和韦小宝两人像是前世有仇，张嘴就吵架。韦小宝来到太医院为屏儿和方怡找药，他打听到禁卫军活捉了三个刺客。韦小宝给屏儿和方怡上药，屏儿告诉小宝自己叫沐剑屏，方怡叫方怡。韦小宝故意戏弄方怡，方怡说她不是好人，韦小宝则说方怡是他的大老婆。

皇太后派了四个小太监传韦小宝到慈宁宫去见她，韦小宝知道自己这一去定有麻烦。他把银票扔在地上，小太监们见钱眼开赶快俯身到地下捡银票，韦小宝趁机赶快逃了。谁知在半路上又遇到了禁卫军侍卫，小宝灵机一动告诉侍卫们那四个小太监串通刺客图谋不轨，让禁卫军们把四个太监拿下了。小宝回到尚膳监皇太后却早已在那里等着他。太后质问小宝为什么要冤枉自己是行刺皇上的幕后主使，韦小宝说这一切都是瑞栋威胁自己做的。瑞栋已经写好了太后勾结沐王府和天地会的人行刺皇上的奏折，而且瑞栋已经动身去了五台山，还跟自己留了联系方式。太后投鼠忌器不敢对小宝怎么样，韦小宝说只有自己才是对太后最忠心的人，太后不相信韦小宝，打了他三掌才回了慈宁宫。韦小宝害怕皇太后发现瑞栋的尸体会对自己不利，他拿出海公公的化尸粉涂在瑞栋的尸体上，尸体一会儿就消失了，屏儿和方怡看得目瞪口呆。索额图告诉皇上刺客的兵器上和衣服上都有平西王府四个字，说明刺客一定是平西王的人。康熙查看了证物，又根据侍卫的描述发觉这是个陷阱，他断定刺客并不是平西王府的人而是沐王府的。

回到皇宫韦小宝向康熙复命，他说自己按照皇上的旨意恩威并用把吴应熊治得服服帖帖，康熙听了甚是得意。韦小宝告诉皇上吴应熊给了自己五万两银票，他说自己跟着皇上这一辈子都不愁吃喝，他要把这些银子赏给侍卫们。韦小宝奉皇上旨意来到多隆府上，把五万两银票交给多隆。他向多隆打听刺客里有没有一个叫刘一舟的人。多隆说刺客都不用真名的，但是他可以替小宝打听一下。回到尚膳监韦小宝告诉屏儿，自己已经派人去打听刘一舟的下落了，只要刘一舟活着他就一定能把他救出来。天地会接到沐王府小公爷沐剑声的请柬，沐剑声要请他们赴宴，韦小宝决定带着弟兄们大胆走一趟。他们在沐王府见到了徐天川，徐大哥告诉他们自己被平西王的手下卢一峰掳走了，是沐剑声把他从平西王手下救出来的。沐王府仍然要天地会为白寒松的死给一个说法。徐天川说是自己误杀了白大侠要一命抵一命。韦小宝暗示沐剑声昨晚皇宫进了刺客，其中三个被抓已关进大牢。自己以为那些刺客是沐王府的人还让朋友好好照顾他们，沐剑声说那些刺客有可能是吴应熊派去的，韦小宝说那他就不必关照这些刺客了。

韦小宝告诉方怡自己在牢房里看见了刘一舟，方怡求他把刘一舟救出来。韦小宝说救刘一舟可是欺君大罪，让皇上知道可是要满门抄斩的，他让方怡答应给自己做老婆，他才肯去救刘一舟，方怡被迫答应了韦小宝的要求。韦小宝让方怡给刘一舟写封信要不然他们三个不相信他不会跟他走。韦小宝来到天牢把方怡写的信给刘一舟看了，他说天地会的韦香主是自己的朋友，因为天地会的许天川杀死了沐王府的白大侠，所以韦香主答应沐剑声把他们三人救出去，以三命抵一命，刘一舟三人相信了他。小宝叫人端来酒菜要犒劳守卫，他悄悄的在酒里下了蒙汗药准备把侍卫们都迷倒。这时太后派来董公公传唤韦小宝，韦小宝花言巧语让董公公和守卫都喝下了药酒，等众人都晕倒了，韦小宝拿出化尸粉把董公公给化掉了。韦小宝让吴立身、敖彪二人换上侍卫衣服，让刘一舟换上太监衣服离开了天牢。天地会钱老本专门为皇宫供应水果，小宝假意说水果质量不行，让吴立身三人把水果挑走顺利逃出皇宫。放走三人韦小宝又回到天牢，他用水喷醒了刘侍卫，小宝说虽然皇帝有心放走刺客。

风际中说天地会下一步的计划是绑架吴应熊，他提醒陈近南韦小宝在宫中当差免不了要收受吴应熊的好处，拿人手短，他们这次的计划先不要告诉韦小宝。康熙问韦小宝是否找到刺客的幕后主使，韦小宝说皇上英明幕后主使果然是沐王府。但沐王府这次入宫行刺目的并不是皇上，他们只是想嫁祸给平西王以报吴三桂杀害沐天波之仇。康熙听后也不打算追究沐王府。韦小宝告诉吴应熊自己在皇上面前替他澄清了刺客之事，吴应熊对他感激不尽。韦小宝说他的手下卢一峰在京城胡作非为，欺压百姓。吴应熊听后大怒说自己一定会严惩卢一峰。吴应熊在怡红院喝花酒，天地会兄弟跑进去放了许多烟幕弹，把吴应熊劫走了。沐王府的人也在怡红院周边埋伏准备劫持吴应熊，他们看到天地会的人抢了先就一路追踪到郊外。两帮人在树林里打了起来，柳大洪占了先机把吴应熊带走了。陈近南闻讯来到沐王府讨要说法。柳大洪说后天就是老公爷的忌日，他们要拿吴应熊来活祭老公爷。这次从天地会手中抢走吴应熊实在是出于无奈。柳大洪和沐剑声再三向陈近南赔罪，陈近南宽宏大量答应把吴应熊交给沐王府处理。

双儿把自己在康亲王府门口捡到的麒麟玉佩还给了韦小宝，小宝见双儿对自己如此上心心里十分高兴。杨总兵怀疑吴应熊应该还在皇宫里，他夜闯皇宫天牢被多隆抓住。杨总兵说自己要面见皇上，韦小宝答应了他，但他让杨总兵见了皇上一定要冷静。康熙说吴应熊不是自己下令杀的，让杨总兵相信自己。可是杨溢之怎么也不相信。他说平西王对朝廷忠心耿耿绝无反叛之意，让康熙放了吴应熊。康熙见杨溢之不相信自己心中大怒要杀了杨溢之。小宝向康熙求情这才保住了杨溢之的性命。吴应熊失踪之事韦小宝毫无头绪，正在他苦恼之时双儿跑来找他，双儿告诉他有一家棺材铺没有招牌，专做江湖中人的生意。她刚才已经去探查过，发现棺材铺里有一个刻着沐王府老公爷的灵牌。得此消息韦小宝喜出望外，双儿请求他一定不要伤害沐王府的人。沐王府用吴应熊活祭老公爷的地点和时间小宝都知道了，但是由于自己的身份特殊，韦小宝一时不知道让谁去救吴应熊，他猛地想起了杨溢之。韦小宝来到天牢，他告诉杨溢之是沐王府的人要拿吴应熊活祭老公爷。韦小宝说自己跟沐王府有交情，他不能出面做这件事。

方怡的籫子掉在了尚膳监，韦小宝回到尚膳监找籫子，他无意中看到了未被化尸粉化掉的柳燕的双脚。小宝想用柳燕的双脚吓唬太后，他来到慈宁宫却无意中听到太后和师兄的谈话。太后的师兄看到柳燕这么长时间都没有回来，他有些担心，太后决定和师兄一起去寻找柳燕。只见太后在床边按下一个按钮，床板就抬了起来，露出了一个盒子。太后从盒子里拿起一把短剑就和师兄出了慈宁宫。韦小宝看见他俩走了就打开床下那个盒子，发现盒子里面有三本四十二章经。韦小宝刚把三本四十二章经揣进自己怀里就发现有人进来了，他连忙躲在了围帐之后。只见一个宫女鬼鬼祟祟也来到太后房间到处翻找，像是要寻找什么东西。这时太后和师兄回来了，那宫女赶快躲进了柜子里。太后和师兄发现房间有人动过，太后连忙拿出那个盒子发现里面的四十二章经不见了。太后怀疑小偷躲在柜子里，她刚打开柜门就被躲在里面的宫女捅了一刀，太后应声倒地，太后的师兄和宫女打了起来。太后的师兄把宫女按倒在地准备掐死她，韦小宝举起匕首从背后把太后的师兄杀死了。韦小宝这才看清那个宫女原来是陶姑姑。

韦小宝把屏儿和方怡带到了天地会香堂。许天川说沐王府的人都到了石家庄，韦小宝让许大哥护送屏儿和方怡前往石家庄。韦小宝让双儿送来一副棺材，他告诉天地会的兄弟自己有个朋友在刺杀鳌拜时不幸身亡，这个朋友叫海瑞栋。小宝在这幅棺材面前祭奠了海大富、小桂子和瑞栋三人，离开天地会之前韦小宝把五本四十二章经藏在了这副棺材里。方怡和屏儿在房间里说起和韦小宝在皇宫里发生的事情，并说自己很想念小宝，她们的谈话被刘一舟听见，刘一舟听后气愤的离开。韦小宝在客栈吃饭被人下了蒙汗药，他醒来后发觉是陶姑姑救了自己。陶姑姑告诉他太后说小宝偷了宫里的佛经，这些人是太后派来杀他的。陶姑姑告诉韦小宝四十二章经共有八本，这八本聚齐就是一个藏宝图，藏宝的地点就在清廷的龙脉中。陶姑姑让韦小宝尽快找到这八本四十二章经，以免它们落入神龙教之手。陶姑姑给小宝留下了联系方式就回宫了。刘一舟心怀醋意追上韦小宝的马车要杀了韦小宝。韦小宝假意说刘一舟误会了他，自己是个太监怎么可能娶老婆，方怡说那些话只是为了气气刘一舟而已。

韦小宝正和章老三在偏房谈话，突然从外面传来一个阴森森的声音，章老三以为女鬼来了吓得跑出了房间。一个女子慢慢的从门外走了进来，小宝吓得蒙上了双眼，只听这个女子说她当初不告而别是有原因的，现在终于又看到了韦小宝，韦小宝移开双手这才发现女子原来是双儿。双儿把韦小宝带到她母亲面前，原来双儿是庄允城的孙女，这个鬼宅是双儿的家。住在这里的女人都是忠臣义士的遗孀，她们为了避免外人骚扰所以装成女鬼来保护自己。双儿的娘说韦小宝手刃了鳌拜，为这一屋子的女人报了仇，大家都很感激小宝。双儿的娘说要送个礼物给小宝，这个礼物就是双儿。韦小宝听后不禁心花怒放，他连忙送给双儿一个玉镯作为见面礼双儿回到自己房间，双儿的娘告诉双儿真正害死双儿父亲和爷爷的是康熙，她之所以要把双儿送给韦小宝就是为了有朝一日杀了康熙为族人报仇。双儿告别娘亲和韦小宝一起上路前往五台山。双儿和小宝正要坐在路边茶水摊上休息，突然看到路上来了几个穿黄衣的西域僧人。僧人们一直盯着双儿的手镯看，韦小宝和双儿看到来者不善赶紧离开茶水摊。

为了避免冲突澄光大师同意巴颜尊者带着手下到寺里查看，西域僧人们在寺里到处都没有看到他们所说的小尊者。来到一所僻静的禅院前澄光大师告诉巴颜尊者，这里居住的是一位本寺的高僧，他正在里面潜心进修不能进去打扰。巴颜尊者却带着手下打伤了清凉寺的和尚强行闯进了禅院。韦小宝和双儿也紧跟在后面探听情况。这时从佛堂里面走出一胖一瘦两个和尚，胖和尚紧紧保护着瘦和尚与西域僧人打了起来，眼看清凉寺的和尚抵挡不住，韦小宝让双儿出手相救，双儿一出手西域的僧人全部倒地。韦小宝告诉澄光大师顺治皇帝在清凉寺出家的消息已经传到了外面。他说今天西域圣教的到来就是为了挟持老皇爷，这以后一定会有其他的教派再来清凉寺骚扰，自己要面见顺治皇帝。澄光大师说顺治皇帝现在的法号叫行痴，保护他的胖和尚叫行癫，韦小宝要见行痴的事情自己做不得主，他让韦小宝去和他的师兄玉林大师谈谈。玉林大师说行痴尘缘已了，不再见任何人。韦小宝不甘心，他带着双儿夜访行痴。韦小宝告诉行痴他待在这里不安全，让他暂时换一个地方修行。

胖头陀逼着韦小宝说出其他四十二章经的下落，韦小宝看到一个农家小院中立了一块石碑，他假装惊喜说其他七本四十二章经的下落都写在这个石碑上，而且石碑上还刻着“洪教主寿与天齐”，胖头陀信以为真，要把碑文拓了回去向洪教主请功。少林高僧一路护送韦小宝和双儿回到京城。为了防止经书被盗韦小宝把经书藏在客栈的墙砖之内。韦小宝准备带双儿到京城好好玩一玩，马车却把他们带到一个陌生的地方。在这里小宝见到了方怡，方怡说她要和韦小宝到神仙岛去玩儿，结果一上岛二人就被毒蛇咬晕了。韦小宝被一个叫陆高轩的老先生救了，陆高轩说他已经昏迷了三天三夜。陆高轩也是神龙教徒，他逼韦小宝把碑文的内容翻译出来，韦小宝只得说自己大字不识一个，这些都是他信口胡诌的。可是胖头陀已经把碑文的事情报告给了洪教主，洪教主还要面见韦小宝。韦小宝和胖头陀、陆高轩二人一起来到神龙教。因为洪教主受夫人唆使残杀创教成员，引得青龙石和白龙使的不满，青龙使蓄谋已久，在刀上抹了毒药。这种毒药碰上雄黄酒就会化作一种浓香让人筋骨尽散，气力全无。

洪教主和夫人身体内的毒性已散，洪教主告诉小宝有四本四十二章经散落在皇宫内，之前黑龙使派属下到皇宫去找经书却未能成功。洪教主见小宝机灵过人，他要韦小宝到皇宫去完成此项任务，还让胖头陀和陆高轩与韦小宝随行保护韦小宝。洪夫人赐予韦小宝五龙令，神龙教众见五龙令如见教主，韦小宝可差遣每一个神龙教教众。洪夫人见韦小宝武功不高，她和洪教主分别教了韦小宝三招防身之术。回到皇宫韦小宝告诉康熙自己在五台山清凉寺找到了老皇爷，江湖各派都在打老皇爷的主意，幸好少林寺八大金刚及时赶到才化解了老皇爷的危机。他把自己在五台山的见闻都告诉了康熙。韦小宝把四十二章经交给了康熙，他说老皇爷要皇上做一代明君，永不加赋。韦小宝还说老皇爷交待不让皇上到五台山见自己。康熙听了韦小宝的汇报，对父亲更加思念。康熙说既然老皇爷很喜欢韦小宝，他想让韦小宝到五台山出家当和尚去陪伴老皇爷。这时建宁跑来找皇上，皇上怕建宁又要提她和吴应熊的婚事，赶紧打发韦小宝去陪建宁聊天。建宁说自己如果和韦小宝有了肌肤之亲，皇上就不会把她嫁给吴应熊了。

来到慈宁宫皇太后急忙问韦小宝此次把自己今年的解药带来了没有，韦小宝说自己也吃了洪教主的豹胎易经丸，教主没有向自己提及此事。为了讨好韦小宝皇太后把30颗雪参玉蟾丸送给了韦小宝。韦小宝告诉皇太后洪教主此次派自己回宫是为了寻找四十二章经。康熙任命韦小宝为骁骑营副都统，让韦小宝带着骁骑营前往少林寺宣旨。韦小宝在军中无聊，他召集官兵和自己赌钱。山上王屋派司徒掌门看到山下驻扎着清兵，以为这些官兵会对王屋派不利。他派自己的儿子和侄女曾柔二人到军营中刺探情况，军中官兵都在赌钱守卫松懈，曾柔挟制了韦小宝，韦小宝假装投降趁其不备偷袭曾柔，控制了她。韦小宝怕这二人与天地会有关，他故意要和曾柔掷色子比大小，有心放了他俩。曾柔知道小宝是故意输给他，她让韦小宝把这三个色子留给自己做纪念。沐剑声带着手下也来到王屋派，他告诉司徒掌门顺治皇帝在五台山清凉寺出家，康熙一定会前去探望顺治，到时他们可以一举除掉大小两个皇帝。曾柔告诉司徒掌门和沐剑声骁骑营的统领名叫韦小宝，沐剑声听后很是惊讶。韦小宝带着骁骑营来到少林寺宣读圣旨。

韦小宝见阿珂生得美貌不由心生邪念，他故意戏弄阿珂，触犯了阿珂。阿珂被韦小宝轻薄欲引剑自刎被师姐阿琪拦住。橙光大师让阿琪扶着阿珂到寺里休息，韦小宝前来看望阿珂，阿琪要杀掉韦小宝被赶来的橙光大师制止，两人交手橙光见阿琪使的是山西霸王拳，他觉得阿琪的武功来路很神秘。风际中不满陈近南让韦小宝坐上了天地会青木堂香主之位，他让儿子风逸飞与铁虎合作杀掉韦小宝。铁虎跟踪双儿在清凉寺找到了韦小宝，他欲行刺韦小宝被橙光大师打跑了。阿珂一心寻死准备跳崖，被路过此地的台湾延平王之子郑克爽救下。俩人互生好感，郑克爽邀请阿珂与自己同行。蒙古葛尔丹王、西域圣教尊者、平西王府的马总兵、杨总兵和阿琪姑娘一行人在路上碰到，一同来到少林寺。葛尔丹和西域尊者想试探少林高僧的武功，他们提出要和橙光大师比试，交手不过几个回合，葛尔丹就输的口服心服。阿琪使出飞针暗器射向韦小宝，飞针被韦小宝的软体护甲挡了回去，小宝看起来年纪轻轻就已经练就护体神功，这让所有人目瞪口呆。阿琪斥责韦小宝作为少林高僧竟然侮辱自己的师妹。

清凉寺有难韦小宝劝说老皇爷暂时离开清凉寺避难，自己会派少林高僧护送老皇爷下山。谁知顺治却说自己是个不祥之人，他不想再连累大家，执意要留在清凉寺了结一生。一部分西域圣教尊者围坐在五台山下，韦小宝带着少林武僧成功偷袭了他们，韦小宝让众僧人把西域尊者的衣服都脱下来他自有妙用。行痴、行颠和玉林三人在禅房内准备好了柴火，只等西域尊者前来，等行痴说明身份，他们就点火焚身了却尘缘。韦小宝、双儿和众僧人穿上西域尊者的僧衣装扮成西域尊者来到禅房，趁玉林大师尚未发觉，双儿就点了三人的穴道，小宝命其他僧人给三人也穿上西域尊者的衣服并护送三人离开。临走韦小宝点了一把火烧燃了清凉寺。其他西域尊者们看到清凉寺失火以为老皇爷已经被大火烧死就离开了五台山，顺治夸赞韦小宝不伤一人就打退了敌兵。路上韦小宝一行碰到了多隆，多隆告诉韦小宝皇上和皇太后已经来到五台山，住在灵境寺里。韦小宝带着老皇爷和众僧人暂住金阁寺休息。康熙来到金阁寺要看望老皇爷，谁知老皇爷却决心不见他。

建宁公主也来到金阁寺，她吵着闹着要见父皇，顺治不得已召见了她。建宁请求顺治取消她和吴应熊的婚事，顺治说自己作为一个皇上不可能出尔反尔，而且建宁和吴应熊的婚姻关系到天下太平，他让建宁安心嫁到平西王府好好过日子。建宁无奈，她又逼迫韦小宝去向皇上提亲做自己的驸马。韦小宝和双儿在金阁寺院子里说话，突然被人点了穴道带到一处农舍，劫持他们的人是吴立身和曾柔。原来王屋派准备天亮后就炮轰金阁寺和灵境寺，他们害怕伤了韦小宝，所以抢先把小宝救了出来。吴立身和曾柔向韦小宝说出事情原委就离开了。双儿和小宝解开了绳索，韦小宝飞奔到灵境寺让康熙赶快离开。康熙刚一离开灵境寺就被大炮轰成了一片废墟。多隆保护着康熙一路逃跑，途中却遇到了铁虎，铁虎正要下手杀死康熙，双儿赶到用铁链把铁虎绑在了树上勒死了。韦小宝觉得清凉寺已被大火烧成一片废墟，那里应该是很安全的地方，他让老皇爷和行颠转移到清凉寺休息。谁知皇太后却来到清凉寺找老皇爷清算旧账。皇太后说自己并没有杀死端敬皇后等四人，那些都是海大富为了交差冤枉自己的。

康熙夸奖韦小宝办事得力，他决定多在清凉寺停留几日。二人正在清凉寺院内说话，突然一个中年貌美的师太从屋顶飞下来要刺杀康熙，韦小宝眼疾手快，替康熙挡了一剑，他身穿软体护甲，师太的剑被挡了回去，正在师太发愣之时，韦小宝抽出匕首切断了师太的长剑。师太看自己已失手，她抓起韦小宝施展轻功，带着韦小宝飞出清凉寺。师太带着韦小宝来到京城的香山上，她对着山顶的一棵树流下了眼泪。韦小宝猜想师太一定是前明的皇族，师太决定要和韦小宝一起到皇宫里看一看。韦小宝来到街上为师太采购食物。韦小宝被师太抓走后，双儿到处寻找他。双儿猜想韦小宝有可能已经回到京城，她果然在京城的街上看到了韦小宝。韦小宝说他非常思念双儿，他一定要娶双儿为妻。师太带着韦小宝从一条密道来到了皇宫，韦小宝猜想师太一定是陶姑姑口中说的崇祯皇帝的长公主。他带着师太来见陶姑姑，师太说她要到自己以前的寝宫宁寿宫去看一看。陶姑姑告诉师太只要找到八本42章经就可以破了清廷的龙脉。师太决定和陶姑姑暂时回到客栈再找机会杀掉太后。韦小宝离开宁寿宫时画了一幅画留给了建宁。

双儿哭着离开了天香楼，看着失魂落魄的韦小宝建宁狠狠的把他奚落了一顿。韦小宝见康熙回宫了，自己被师太掳走一事他还没想好怎么跟康熙交代，只觉得头大。韦小宝决定暂时先解决太后。韦小宝带着师太和陶姑姑潜伏到慈宁宫中，他们刚隐藏好，建宁和太后就走了进来。建宁替太后把42章经从康熙那里偷了出来，她让太后想办法取消自己和吴应熊的婚事。太后三言两语打发走了建宁，师太跑出来与皇太后打斗起来，太后不是师太的对手，她使出化骨绵掌对付师太，反而被师太把化骨绵掌打到自己体内。师太欲取太后性命，谁知太后却说自己是个反清义士杀不得，她说自己这个太后是假冒的。假太后告诉师太自己叫毛祖蓉，父亲毛成名是明朝的大将军，最后被清兵用反间计让袁崇焕大帅给误杀了。假太后说自己非常痛恨清兵，父亲死后自己被迫到皇宫里当了宫女侍候太后。她伺机迷晕了太后，弄了张假脸一直在后宫蒙混过关到现在。真的太后并没有死只是被自己关在慈宁宫内。韦小宝发现42章经里有秘密，他破开42章经的封皮发现里面藏有地图的碎片，原来42章经内有藏宝图的传说是真的。

师太一人独战数人，她奋力把西域尊者都打跑了，自己却中了西域尊者的毒受了重伤。韦小宝抓了一个活口得知这些尊者也是为四十二章经而来，他们几个只是先来探路的还有七个尊者在后面。韦小宝给师太服下了两粒雪参玉蟾丸，师太担心自己受了重伤，如果遇见另外七名尊者他们三个会有危险。韦小宝建议师太他们三个人可以先暂时找一处农舍乔装打扮住下，自己和阿珂扮作师太的侄儿和侄儿媳妇，这样可以躲避尊者的追杀。阿珂见韦小宝无时无刻都在占自己的便宜，也和韦小宝打起了嘴皮上的官司。师太听着他们俩打铁只是笑而不语。路上他们遇见了郑克爽，郑克爽邀请他们一起前往河间府观看杀龟大会。杀龟大会并不是真的杀大乌龟，而是因为人们恨透了吴三桂出卖大明朝，引清军入关，桂与龟谐音而来。郑克爽说自己的侍从都是武林高手可以保护师太，师太得知郑克爽是忠良之后延平王次子答应与他同行。途中师太一行人来到一家酒店休息，几个尊者也来到对面桌子坐下让店小二上酒。韦小宝见势头不妙偷偷溜到厨房在酒坛里下了蒙汗药。

多隆带着一群清兵在街上碰到韦小宝。韦小宝告诉多隆自己非常喜欢阿珂，可是阿珂却心仪郑克爽，多隆和其手下决定成全小宝和阿珂的美事。多隆手下的官兵说郑克爽昨晚在河间府妓院喝花酒，欠了他们1万两银子。他们把郑克爽抓起来痛打了一顿，还要把郑克爽带走。阿珂请求小宝出手相救，韦小宝故伎重施让阿珂答应做自己的老婆他才肯救郑克爽。郑克爽受不了官兵的痛打，他求韦小宝借他银子还给官兵。阿珂为郑公子作保，说郑克爽如果不还小宝银子她就做小宝的老婆。官兵们故意装作不认识韦小宝，当韦小宝自我介绍时，官兵都故意装作大吃一惊，说韦小宝就是手刃鳌拜的大英雄把韦小宝捧上了天。官兵们装作卖韦小宝一个面子放走了郑克爽。韦小宝想到一回宫建宁就会逼他与自己成亲，他要赶快找个老婆好让建宁断了念想，可是阿珂仍然不答应他。韦小宝心生一计，他告诉吴立身自己的心上人被郑克爽抢走了，而且郑克爽还向清兵告密说吴立身等人是沐王府的人。吴立身决定要治一治郑克爽。韦小宝告诉师太郑克爽在妓院喝花酒欠人银子被别人打得落花流水。

郑克爽和冯锡范前来探望师太，郑克爽说将来推翻了清廷恢复了明朝，江山会由他们郑家来坐。他的言语惹恼了师太，师太不允许阿珂再和郑克爽来往。师太决定不再浪费时间寻找阿琪，她决定带着韦小宝和阿珂前往京城。冯锡范告诉郑克爽陈近南出身于延平王府，但是现在他已经是天地会的舵主，影响力比延平王大得多。郑克爽如果要继位必须要铲除陈近南。风际中父子记恨韦小宝，他们决定揭发韦小宝天地会青木堂香主的身份，以借康熙之手除掉韦小宝。风际中把告发韦小宝的信扔进康亲王的院子里。康亲王把信里的内容告诉了康熙。师太也让韦小宝抓紧时间找齐42章经，韦小宝想告诉师太自己已经找到五本经书，可是他想到小玄子又忍住了。回到宫中小太监告诉韦小宝有侍卫曾经到他房间拿过东西，小宝怕康熙对自己心生怀疑，第二天就跑到康熙面前编故事。他说自己被师太绑走后遇到了杨总兵，是杨总兵把自己救了出来。康熙笑着听完小宝讲完故事，突然脸色一变，让韦小宝脱下鞋子，他要看小宝的脚底是不是刻有“反清复明”四个字。

康熙告诉韦小宝假太后有一个阴谋，就是要毁掉清廷的龙脉，这个秘密藏在八本四十二章经中。康熙说自己放在上书房的那本经书一定是建宁公主偷了去，还有一本在吴三桂那里，他让韦小宝此次去云南趁机把那本经书拿回来。康亲王家里的四十二章经不见了，而皇上屡次让康亲王交出经书。康亲王无奈只得求韦小宝帮忙，他想让小宝到宫中偷一本经书自己照着做一个假的给皇上交差。韦小宝拿出一本经书交给康亲王让他换个封面就行了。为了给洪教主交差，韦小宝又拿了两本经书交给胖头陀和陆先生，让他俩转交给教主和夫人。韦小宝让阿珂到宁寿宫为自己作证，说他们俩已经拜堂成亲，好让建宁不再纠缠自己。阿珂表面上答应小宝，谁知来到宁寿宫阿珂却告诉建宁公主自己只是韦小宝买来的奴婢，小宝真心喜欢的人是公主。建宁听后大喜。康熙要把建宁公主赐给吴应熊，他下旨赐韦小宝为一等子爵，荣任赐婚使护送建宁公主到云南完婚。建宁假装上吊让宫女去把韦小宝找来。建宁在韦小宝的茶水里放了蒙汗药把韦小宝迷晕了，她和韦小宝生米做成了熟饭。

韦小宝和多隆一行护送建宁公主来到云南平西王府，他们受到平西王吴三桂的热情接待。神龙教派屏儿到云南给韦小宝送解药，屏儿遇见哥哥沐剑声，沐剑声告诉妹妹他们此行是为了杀掉建宁公主。吴三桂设宴款待韦小宝和多隆等人，韦小宝故意装醉说平西王府比皇宫还漂亮，吴三桂在云南比皇上还威风，如果把大清的皇帝给他做他也不会去做。吴三桂说自己对大清忠心耿耿，绝没有二心。韦小宝说谁忠谁奸都是自己一句话的事情。吴三桂听了心里很不舒服。韦小宝又说皇上对对吴三桂还是很放心的，否则也不会把自己最疼爱的妹妹嫁给小王爷。吴应熊听后赶快讨好韦小宝，临走送给了韦小宝很多银票。多隆和索额图都夸赞韦小宝手段高明。韦小宝问吴应熊他这次来平西王府怎么没有看到杨溢之，吴应雄告诉他杨溢之去山西办事了。韦小宝觉得在这个时候平西王派杨溢之去山西定有蹊跷。他让假扮成清兵的徐天川拿着银票去贿络平西王府的随从探听消息。建宁公主在别院不肯吃饭，要死要活的闹腾。假扮宫女的阿珂看不惯建宁打了建宁一耳光。

多隆告诉韦小宝吴三桂准备四路出兵造反，这四路兵马分别是三藩、西域教派、蒙古王格尔丹和神龙教。韦小宝决定带着卢一峰进京向皇上说明吴三桂的图谋。索额图说如果吴三桂知道他们扣押了卢一峰，肯定不会让他们这些送亲的人离开云南。为了顺利地把卢一峰运送到京城，韦小宝决定点了卢一峰的哑穴让他隐藏在皇上的亲兵中。吴三桂为了找出卢一峰他派人在公主的行宫放火，然后借救火之名搜查行宫，小宝吩咐手下不要阻拦。吴三桂手下在行宫其他的地方没有搜到卢一峰，他们认为卢一峰一定是被藏在了公主的房间里。吴应熊带人来到行宫假意关心公主的安全，他说火势即将蔓延到公主房间，请求公主移驾到别处去。吴应熊在公主房间外等了一会儿，公主却没有任何反应。他自恃即将成为公主的额附，自作主张进入建宁的房间。吴应熊进去了一会儿，就听到公主大声喊叫吴应熊要非礼她，接着就听到公主的哭声。小宝派双儿进去查看究竟，双儿出来汇报说出大事了。小宝带人跑进公主的房间，只见吴应熊浑身是血躺在地上，平西王手人赶快把吴应熊抬走救治。

平西王的女婿夏国相请小宝到监狱审问刺客，小宝一看刺客竟然是沐剑屏。小宝假意审问屏儿，他示意屏儿栽赃嫁祸夏国相说她刺杀平西王是夏国相指使的。夏国相有口难辩，他请求小宝不要把刺客的话告诉吴三桂。小宝顺势说公主要审问刺客，让夏国相把刺客交由公主处理。小宝救出了屏儿，屏儿告诉小宝她是奉洪教主之命前来给小宝送解药的。她哥哥沐剑声也来到云南想要刺杀公主，让吴三桂承担责任。皇上一定会惩罚吴三桂，吴三桂就会起兵造反。谁知他们还没有行动吴三桂的人就把他们抓了起来。屏儿还说她并没有刺杀吴三桂，小宝这才明白吴三桂用屏儿顶替了阿珂，自己中了吴三桂的奸计。平西王妃给小宝送了一封信邀请他到三圣庵商量重要事情，小宝来到三圣庵，一位长得很像阿珂的尼姑接待了小宝，尼姑说自己法号叫静寂。小宝猜测这个静寂一定是阿珂的娘。小宝把自己和阿珂的故事告诉了静寂，静寂听后说自古红颜多祸水，小宝说如果不是那些男人红颜怎么也成不了祸水。小宝说出了静寂的心声，她告诉小宝自己就是陈圆圆，陈圆圆把自己的经历告诉了小宝。

李自成说自己能够死在前明公主之手也算是一种荣幸，他让师太赶快动手，师太改变主意她让李自成亲自杀了吴三桂。吴三桂和李自成一场恶战，李自成最后占了上风，他将剑架在了吴三桂的脖子上。陈圆圆说自己和吴三桂做了二十多年的夫妻，吴三桂对她一直很好，她跪下请求李自成放过吴三桂。这时夏国相带兵包围了三圣庵，韦小宝挟持了吴三桂让夏国相退兵。韦小宝为了全身而退，他要吴三桂答应自己带着吴应熊和建宁公主到京城完婚，吴三桂被迫答应。韦小宝让夏国相放了阿珂，陈圆圆和阿珂母子相见，十分激动。陈圆圆说韦小宝为救阿珂多次冒险进入平西王府，可见韦小宝对阿珂是真心的，她让阿珂嫁给韦小宝，以后不要再流浪江湖。 韦小宝带着吴应熊和建宁公主回到京城，建宁告诉康熙吴应熊欺负了她，康熙知道这一定是建宁捣的鬼，他下旨让建宁和吴应熊在京城完婚。韦小宝告诉皇上吴三桂联合西域圣教、蒙古葛尔丹王和神龙教要分四路出兵造反，康熙听后要亲自审问卢一峰。韦小宝把从吴三桂那里偷来的四十二章经交给了康熙，康熙大喜，他要把这八本四十二章经交给太后。

原福建水师提督施琅带着礼物求见韦小宝，小宝看着施琅送来的玉碗，想自己和施琅素不相识不知道施琅找自己所谓何事，施琅告诉韦小宝当初自己在郑成功手下带兵，郑成功听信妇人谗言把自己一家老小都抓了起来，他找机会逃走了，郑成功就杀了自己的妻儿老小。他来到京城却一直得不到皇上的重用，此次前来晋见韦爵爷就是想请求韦小宝给自己一个报仇的机会。韦小宝恨透了郑克爽，他积极地向康熙禀明了施琅的要求。康熙怕施琅返回福建报仇心切反而会惊动了台湾郑氏，他要施朗先帮助韦小宝去攻打神龙教，如果此次出兵施琅表现良好，他一定会重用施琅。双儿把地图拼好了，韦小宝担心地图会被别人抢走，他把地图标志一一记牢然后把地图烧掉了。施琅决定炮轰神龙岛，韦小宝担心方怡和沐剑屏会被炮弹炸死，他告诉施琅神龙教抓走了皇宫里的几个宫女，皇上交代他一定要活着把这几个宫女带回去。施琅非常感谢韦小宝的提醒，他吩咐士兵攻岛之时见到女的不能杀死只能活捉。洪教主借练功之名把方怡带到密室，他准备调戏方怡被洪夫人发现，洪教主谎称他找方怡是为了帮助自己练功。

神龙教洪夫人把韦小宝带回神龙教总坛交给洪教主审问。韦小宝告诉洪教主皇上身边有两个外国人，他们说北边有个罗刹国要来攻打大清朝，他这次来不是攻打神龙教的，而是奉皇上之命来攻打罗刹国的。可是他在半路上救了瘦头陀，瘦头陀告诉他神龙教正在起内讧，教主和夫人都被叛徒抓起来了，自己一时情急为了遏止反叛才炮轰神龙岛的。韦小宝还说他已经找到了五本经书，其中两本已经交给洪教主，另外三本他藏在京城的某个地方。洪教主对韦小宝的话将信将疑，他决定把韦小宝暂时扣押在神龙教，让赤龙使监视韦小宝。双儿藏在船舱内，等到半夜时她跑出来点了赤龙使的穴道把韦小宝救了出来，两人坐上一条小船逃离了神龙教。韦小宝和双儿来到陆地上，这里冰天雪地气温非常的低。两人生火取暖时，洪夫人在他们身后出现，准备杀死小宝，双儿把洪夫人打伤了，洪夫人施展轻功飞走了。双儿说韦小宝不能再这样放走洪夫人，否则他俩都有性命之忧。韦小宝决定追杀洪夫人，追了一会儿他们看到洪夫人倒在地上，韦小宝把洪夫人翻过来一看却原来是方怡。

韦小宝和施琅汇合了，他决定班师回朝。康熙接到三藩要求撤藩的奏折，他询问众大臣到底是应该撤藩还是不撤藩，众大臣只是一味恭维皇上，却没有一个能拿出主意的。韦小宝见状，他抖落出了一袋子金银珠宝，说这些都是在云南时吴三桂送给他的，想让他在皇上面前为自己说好话。小宝罗列了一系列吴三桂要造反的证据力主撤藩。其他众大臣也纷纷附和。康熙对韦小宝在朝堂上的表现十分满意，他决定让韦小宝回扬州看望父母。韦小宝告诉康熙自己不知道亲生父亲是谁，他从小就在扬州的丽春院生活。康熙要韦小宝在回扬州的途中顺便把王屋派除掉。吴应熊想逃离京城，他让韦小宝帮忙截回撤藩的上谕，小宝说那是不可能的。建宁埋怨韦小宝这么长时间都没有来看自己，她拿出鞭子逼着韦小宝脱衣服与自己亲热。双儿做好了一本假的《凝血神爪》，韦小宝把它放到了天地会勾引内奸去偷。吴应熊要和韦小宝赌马，他想借赛马之时逃跑。韦小宝并未识破吴应熊的诡计，但他逢赌必诈，让手下张勇在吴应熊的马身上做了手脚。

韦小宝把迷药放在了花姐给客人喝的酒壶里，阿珂和郑克爽喝了酒以后都晕倒了，韦小宝带着假扮清兵的双儿和曾柔到丽春院来带走郑克爽。谁知葛尔丹王子、西域桑结法师、阿琪早已藏在花姐的房间内，小宝三人一踏进花姐的房间，双儿和曾柔就被他们打晕了。桑结大师要杀死韦小宝，韦小宝赶快说皇上已经知道葛尔丹王子、桑结法师和吴三桂密谋造反的事情，如果他俩不帮助吴三桂归顺于大清，皇上就会封葛尔丹王子为准噶尔汗，封桑结大师为西域大法王。韦小宝还建议二人和自己结拜成兄弟，这样他们兄弟三人就天下无敌了。韦小宝让龟奴上壶好酒来庆祝三人结为兄弟，他看这个龟奴很有点面熟。小宝就告诉葛尔丹王子这个龟奴是吴三桂派来的，他们刚才说的是事情一定被他听到了，他们一定要把这个龟奴除掉。三个龟奴带着三个浓妆艳抹的女子走进来，韦小宝逼着他们每个人喝了一杯之前下有迷药的酒。葛尔丹王子三人和这六人打了起来，六人因为喝了迷药，打了一会儿都晕倒了。韦小宝仔细瞧了瞧这三个浓妆艳抹的女子，发现她们分别是洪夫人、方怡和沐剑屏。

吴三桂造反康熙宣韦小宝进京。韦小宝要带花姐一起回京城，花姐说自己在丽春院住习惯了，不想去京城。韦小宝给了花姐五万两银票让她把丽春院买下来自己做老板。阿珂身体不适郑克爽找来大夫给阿珂看病。大夫说阿珂已经有喜了，郑克爽听后大怒，他骂阿珂是个贱人，自始至终都在欺骗自己。冯锡范听说此事把郑克爽找来，他说阿珂是李自成和陈圆圆的女儿，这样的身份是不可能嫁进延平王府的。但是郑克爽的哥哥没有孩子，如果阿珂能生下一个男孩那郑克爽就能父凭子贵堂而皇之的继承王位。郑克爽听了冯锡范的话决定留下阿珂。阿珂觉得自己对不起郑克爽，她决定离开郑克爽。郑克爽说如果阿珂要走也要等生完孩子再走，阿珂不明白郑克爽的意思，郑克爽说自己的荣华富贵都系在阿珂肚子里的孩子身上。阿珂这才明白郑克爽原来不是真心对自己，她背着包袱逃跑了。郑克爽和手下一路追赶阿珂到一个悬崖边，阿珂无路可走只得跳下悬崖。她掉到一棵大树上被树枝弹起，滚落到地上大难不死，郑克爽派人到悬崖底下找到了阿珂，把阿珂带走了。韦小宝、双儿和天地会的兄弟押着吴之荣前往庄府。

韦小宝回到京城，他把葛尔丹王子和桑结法师给他写的契约交给康熙，说葛尔丹王子和桑结法师已经跟吴三桂翻脸，答应为清廷效力。小宝还告诉康熙自己已经和二人结拜成兄弟，康熙听了很是惊喜对韦小宝大加赞赏。韦小宝把假太后押到慈宁宫听从皇太后发落，小宝以为这次太后会大大的赏赐他。谁知皇太后却面无表情地让他先退下去，原来皇太后已经被瘦头陀劫持。韦小宝刚一出慈宁宫，就碰到了归家三口。归辛树逼问小宝皇上到底在哪里，正好这时皇太妃和皇太后的轿子一前一后从此路过，皇太妃的轿子里其实坐的是毛祖蓉和瘦头陀。韦小宝并不知情，情急之下他决定舍弃太妃保护皇上。他告诉归辛树前面那顶轿子里坐的就是皇上，归辛树三人向轿子里刺了几剑就逃跑了。太后说轿子里被杀死的两个人是反贼，此事不可声张，让小宝把两个人烧了。康熙早已知道韦小宝是天地会香主。他假意和韦小宝比试摔跤，脱下韦小宝的鞋袜，撕去小宝粘在脚底写着“扫墓”二字的人皮，“反复”二字露了出来。康熙大怒说念在韦小宝对自己还有三分忠心的份上，这次就饶了韦小宝的性命。

为躲避清兵的追杀大家分散逃跑，韦小宝带着曾柔、屏儿和建宁公主躲进一个农舍里。张勇带着清兵前来搜查，他放过了四人，还给韦小宝留了一大沓银票。四人继续跑路却遇到了神龙教洪教主。他们被带到了神龙岛，神龙岛被小宝的大炮已经轰为一片废墟，洪教主决定重振神龙教。可他的手下只剩赤龙使、青龙使、瘦头陀、胖头陀和陆高轩五人了，五人说洪教主不相信他们让他们吃易筋豹胎丸，结果让他们很痛苦，他们向洪教主索要解药。洪教主无奈给了他们每人一黄一白两粒解药，陆高轩却不肯吃掉白色的解药，他说这白色的解药是毒性很强的百涎丸，是夫人让他找药时他发现的。洪教主问夫人生病为什么不找自己拿药，夫人这时呕吐起来。建宁多嘴说洪夫人一定是怀孕了，洪教主大怒他以为夫人的奸夫是陆高轩，一掌拍死了陆高轩。其他四人看到洪教主对手下无情无义便一起发力，和洪教主动起手来。韦小宝趁乱赶紧拉着几个老婆向海边跑去，洪夫人也跟着来了，她告诉韦小宝自己肚子里的孩子是小宝的。洪教主追来洪夫人和小宝合力杀死了洪教主。

阿珂被郑克爽绑着也跟着他们一起来到海上，郑克爽的船被海水打翻后，阿珂被张勇救起，她告诉张勇郑克爽和冯锡范在船上密谋要杀死韦小宝，张勇赶快让阿珂到通吃岛上给小宝报信。风际中让韦小宝把郑克爽押回京城，让郑克爽归顺清廷，然后自己再举荐韦小宝做天地会的总舵主，召集十八省的堂主到京城聚会，到时把他们一举歼灭。韦小宝这才明白风际中就是天地会的内奸，风逸飞趁韦小宝和风际中说话之时悄悄来到小宝背后想暗杀韦小宝，韦小宝举起火枪打死了风逸飞。风际中要为儿子报仇他提起长剑向小宝刺去，被双儿用含沙射影一箭射死。混乱之中郑克爽和冯锡范挣脱了绳索驾着小船逃走了。韦小宝和七个老婆快乐地隐居在通吃岛。几个月后他得了两个儿子和一个女儿，小宝用色子给儿女们起名字，两个儿子叫韦虎头和韦铜锤，女儿叫韦双双。皇上派张勇到各个小岛四处寻找小宝，最后终于在通吃岛找到了韦小宝，康熙下旨封小宝为通吃伯，要韦小宝回到京城，灭了天地会。韦小宝不想做不忠不义之人，他以建宁公主刚生产完身子还很虚弱为借口，没有奉旨随张勇回京。

韦小宝来看望茅十八，茅十八骂他是个忘恩负义的混蛋。韦小宝说茅十八冤枉了自己，杀死陈近南的是郑克爽而不是自己，而且自己还替天地会除掉了风际中这个内奸。茅十八说满城的皇榜都写的是韦小宝杀了自己的师傅陈近南，双儿说自己也看到了皇榜。韦小宝这才明白自己犯了滔天大罪，康熙不但不怪罪自己还给自己加官进爵的原因。这皇榜一出，他在江湖就无法立足，只能乖乖的为朝廷效力。皇上说茅十八当街骂自己和小宝，他让韦小宝明天亲自监斩茅十八。韦小宝说茅十八对自己有恩，请求皇上不要杀他。皇上说如果小宝要保全茅十八那就拿小宝自己的命替换。康熙怕韦小宝再次潜逃，他把小宝的七个老婆和孩子都接进宫中，让小宝不要再耍什么花招。多隆拿着韦小宝给他的借据向郑克爽要了三十万两银子，韦小宝听到郑克爽这个名字就怒不可遏。他带着多隆来到郑克爽府上挑衅，郑克爽拿出最后仅有的五万两银子交给了韦小宝，冯锡范说杀死陈近南是他的主意，让小宝不要再为难郑克爽。晚上韦小宝让手下伪装成泰都统的人把冯锡范从府中接了出来，韦小宝把冯锡范痛打了一顿才放他走。

小宝被关入天牢韦小宝担心天地会兄弟的安全，他四处寻找天地会成员。这日韦小宝和屏儿在街上溜达，突然看见了许天川。徐天川带着二人来到银杏胡同里的一处宅院，天地会各堂主都藏身于此。众人见小宝进来纷纷将他围住，个个对他怒目而视。屏儿为韦小宝作证说韦小宝是清白的，天地会的内奸是风际中，总舵主陈近南是被郑克爽杀死的，茅十八也被小宝施计放走了。屏儿向他们讲了之前的种种经历，各堂主听后方知大家都上了康熙的当。各堂主商议决定推举韦小宝为天地会总舵主，但他们怕其他弟兄不服，让韦小宝去立一件大功，那就是刺杀康熙。韦小宝死活不同意。回到宫中康熙向韦小宝问起冯锡范失踪一案，小宝说冯锡范失踪那日自己和多隆在一起喝酒并不知内情，皇上把冯锡范失踪一案交给韦小宝去调查。之后康熙脸色一变，冷冷地问韦小宝今日在银杏胡同和朋友们聊得可开心。韦小宝一听脸都吓白了，康熙说看在小宝死活不同意刺杀自己的份上就再饶过小宝一次。康熙感慨地说自己勤政爱民，为什么汉人们仍然这么痛恨自己。

小宝归隐鹿鼎山康熙不买韦小宝的帐，他执意要韦小宝写出天地会的名册，于是韦小宝画了一本画儿交给皇上，让皇上按图去抓人，皇上被小宝激怒，决定处死韦小宝和他的老婆孩子。韦小宝哭着求皇上放过自己的老婆孩子，当康熙听到小宝哭喊小玄子时，他答应韦小宝只杀他和双儿两个人。建宁带着其他五位姐妹一起来到皇宫请求皇上饶过韦小宝，康熙说君无戏言，让她们六个赶快到天牢去见韦小宝最后一面。韦小宝让众姐妹不要难过，他说用自己一条命可以换回天地会十万兄弟的命是很值得的，自己的儿女长大了也会为自己骄傲。他让苏荃带着众姐妹变卖所有的家产，到扬州接上花姐，好好的过下半辈子。韦小宝一一和六个老婆道别，大家围着小宝抱成一团泣不成声。韦小宝和双儿被押往刑场，天地会兄弟前来劫囚却被清兵们追杀。多隆想韦小宝宁死都不肯出卖天地会兄弟，如果自己把天地会的人抓起来了，韦小宝就白死了，想到这里多隆让手下停止追杀天地会。苏荃带着众姐妹想从皇宫小道前往午门，中途被索额图拦住，索额图早已把虎头和铜锤抱回皇宫，众姐妹只好作罢。