犯人张竞民在押解途中反抗时，他们在车里听到了外面枪响，一共响了十五声，季洁报告了二点钟方向的枪声。大斌开车和季洁准备带人先行归队，韩丽在门口被张竞民吐了吐沫，季洁知道了沈耀东女儿得了白血病。张竞民在监狱中要袭击王勇时被打倒在地，他很无奈地发出了叫声。大斌来吃饭的时候捐了一万块，其它人也都捐了钱。马德亮进来后说了案件的一些情况，他蹲下刑侦支队门口不走，表面上看起来像是他把老婆杀了。

季洁和王勇来到李全安家中，在他家里发现了那件左白右黑的衣服，他被当成嫌疑人带走。季洁的话让李全安难受起来，经化验陈小娟的体内的液体就是李全安的，他交待了那晚的情况。李全安说他十点一刻出门的，他走之前陈小娟说要接着聊。张竞民想通了，他接受了佟林的安排。季洁查出了和陈小娟网聊的就是李全安家中的电脑，有人盗用了李全家家中的无线路由上网，马德亮被再次逮着，是李全安的无线路由器出卖了他。

沈耀东带领季洁和王勇背着佟林到张竞民家搜查，在通讯录上发现老黑的手机号和袁大坤的是同一个号码。 第二天案情分析会上，沈耀东说已经查到去“锦绣地”谈判的五人的线索，并要求佟林解释电话号码的事情，佟林承认自己为工作撒了谎，引起大伙不满。佟林利用郑一民从沈耀东嘴里套出嫌疑人李胜保的地址。沈耀东告诉季洁和王勇在通讯录上发现电话号码是他给佟林设的套，说明郑一民和佟林之间一定有不可告人的秘密。

郑一民和季洁问佟林让张竞民跟踪陈雪的原因，佟林说自己当时在特情支队工作，只能找张竞民做这些下三滥的事。季洁要求和佟林一起调查天城小区的爆炸案，目的是协助沈耀东暗中调查佟林和郑一民是否有黑势力保护伞的问题。但在关键时刻佟林瞒着所有人带着季洁和王勇突然来到了五组布控已久的李胜保家，并找到了在“锦绣地”谈判时被打伤的那五个人，遗憾的是已经死了两个重伤，剩一个活着的秦大力还被佟林“洗了脑”。

天城小区爆炸案，在轰炸师当过兵的牛国光为儿子上试验中学拿出全部积蓄和借款要买厉建军的房子，临近过户厉建军却再次提出涨价。凶手直指牛国光，却苦于没有证据。锦绣地“16枪案”再次陷入困境。郑一民在会上对此极为不满，要求大伙必须想出个招来。四个完全不相干的人都在半夜2点接到亲人、好朋友打来的电话，让他们在天亮之前离开本市，并且不许问原因。六组接到报案后顿时紧张起来，“原子弹爆炸”的消息传遍了上上下下。

沈耀东带着郑一民和季洁居然在佟林家找到了崔强的尸体和那把12年前丢失的五四手枪。沈耀东和季洁讯问佟林，佟林却将他是如何与郑一民、谢局一起设局引沈耀东“上钩”的事实全盘托出，从而揭露了沈耀东“黑警察”的真实面目。沈耀东坦白了自己被逼无奈走向犯罪深渊的真实情况和原委，并要求协助警方抓捕犯罪嫌疑人葛安，戴罪立功。警方终于制止了释放毒气的犯罪行为，避免了一场大灾难。

沈耀东在抓捕犯罪嫌疑人葛安时，以死来悔改自己的所作所为。郑一民宣布上级正式任命佟林为重案六组新一任组长。一名叫乌正奇的男人在家中死于破裂的鱼缸前，从各方面看都是一起意外。韩丽等不敢轻易结案。新任组长佟林介入此案，在调查中发现乌正奇的母亲乌秀莲教授，正是一位大名鼎鼎的爆破专家，当年曾是佟林的客座教授。

佟林跟进乌正奇死亡案，查出品行恶劣的乌正奇，不仅跟母亲关系相当紧张，而且在三年前强暴过乌秀莲的保姆杨颖。佟林顶着六组人对他的误会，从蛛丝马迹入手，跟乌秀莲进行数次交锋，终于查清令所有人都大感意外的真相。季洁和王勇查到犯罪嫌疑人是香香家小区小卖部老板，经调查，发现真凶竟然是香香的母亲，案子虽然破了，季洁的心情却十分沉重。

某少妇在出租屋内被人砸扁了脑袋。与其同居的男子逃跑。调查发现此前屋内另一个男子竟是死者丈夫!现场目击凶案的受害人的小男孩儿成为了破案关键，也是定案的重要证人，然而男孩儿却拒绝开口。佟林、季洁为是否让孩子卷入案子发生争执。最终郑一民支持季洁带孩子办案的主张，以帮助孩子解开心魔。王勇成了孩子的临时监护人，两人相处甚是愉快。在破案过程中，佟林也渐渐被六组组员接受。

小男孩儿突然病倒，王勇带孩子看病的路上突遇一起抢劫案。王勇最终在孩子帮助下成功逮捕了劫匪，破获了一起重大抢劫案。与此同时，案发现场发现嫌疑人身影，季洁与佟林等将其围困在楼顶，佟林苦苦相劝决心决心携人质跳楼的嫌疑人。最终案情大白，孩子生父是家庭暴力的恶魔。杀死孩子母亲的嫌疑人却得到孩子的信任。而引发命案的缘由竟是一碗普通的方便面。

韩丽与周志斌在陈雪的高档会所碰了一鼻子灰。佟林跑去向陈雪解释却意外得到一条案件线索，案件嫌疑人竟与赌球团伙有染。最终，佟林凭借智慧巧妙迫使受害企业家之妻说出案情真相，揪出一个涉案过亿元的特大赌球团伙。工地死者田松家属依旧纠缠季洁，季洁认为田妻是想多要赔偿，出于同情心找工地方却遭冷眼。

季洁经过努力最终拿到工地的一纸证明，田松属于因公死亡。而且又多给争取了五千块钱的赔偿，田妻此时却让孩子们恭恭敬敬给证明田松是因公牺牲的文件行大礼，季洁被田松妻女的举动震撼了。农民工的银行卡被自动提款机吞掉，而银行方面又反映自动提款机并未出现故障。原来是嫌疑人做了一个以假乱真的自动提款机放在路旁，诱人提款，然后得到银行卡，获取钱财。季洁、韩丽终于将犯罪嫌疑人抓获。

季洁等接案，孩子在家中离奇失踪。季洁去调查时发现了疑点，在衣柜中找到被闷死的孩子。季洁、王勇等苦苦追查，是意外，还是他杀？林志毅母亲偶然披露，志毅跟前妻生的孩子三年前同样夭折。而调查过程中，季洁等人却发现央儿并没有死。

在王彩凤家乡的婚礼现场，周志斌和韩丽找到了孩子，也找到了王彩凤的作案动机，并成功的救回孩子。季洁顺藤摸瓜，却揭开了林志毅家庭当年不欲人知的辛酸秘密。垃圾场发现一具一年半前被害者的白骨，调查被害人身份的工作大海捞针。

警察通过查找外地失踪人口，根据死者的形象特征找到一年半以前失踪的一个年轻女子，与垃圾场发现的被害人情况极其相符。只是案发时被害人腕子上作为重要线索的玉镯不知去向。追寻报案的拾荒者，原来玉镯正是他俩拿走了。郑一民亲自出现场指示佟林率六组将此案侦破。被骗去钱财和贞洁的受害人主动配合，提供线索。季洁、韩丽主动出击，迅速抓获犯罪嫌疑人。

凯琴在卫立死后第二天，就急于兑现他的五十万寿险，准备远走高飞。此外，凯琴和卫立没有孩子，季洁却找到凯琴和一个两岁小孩的亲密合影。重重疑点都集中在凯琴身上，佟林和季洁没有被表相迷惑，排除了凯琴的杀人嫌疑，但真相依然扑朔迷离。周志斌和王勇发现死者袁述遭遇过车祸但死因蹊跷。根据监控录像，他们追查到肇事车辆，并查出车主是某知名电视主持人。经调查层层揭破车主的谎言，在车主认罪后，案子却未真正完结。

石灰池尸体案的受害人实为自杀寻死，却因为车主害怕而产生的一念之差，最终惹祸上身。在季洁的追查下，卫立死亡案也终于真相大白。一位刚入住他人代租屋子的外地客刘小龙被杀死，租房人卢洪成为嫌疑人。查案中佟林行为很怪异，殴打了一位偷钱包的盗贼，受到督察调查，也引起大家猜测。

由于佟林的停职审查，季洁接手调查。季洁根据佟林的思路终于发现卢洪是一位云南警方的卧底缉毒警并依据佟林嘱咐暗中保护他。一桩突发劫持人质案让佟林“忘了”自己被停职，赶赴现场。与郑一民，特警配合，击毙歹徒。蹲守的季洁也在毒贩“杀手”欲对暴露了身份的卢洪下手时，将其抓获。果然在杀手腰身处发现绑着两颗手雷。

佟林从装录像带的布袋上闻到酒味，为辨别布袋上的酒的品牌，佟林喝酒喝得大醉并搅乱了解救赵鹏绑架案的布控现场，面临革职。赵鹏被解救，提供线索，郑一民在苏渤海车里找到绑架赵鹏的证据，下令通缉苏渤海。楚文被杀一案经查明，孔令珊，刘眉眉姐妹俩与楚文都有私情。姐妹俩又都承认自己用有毒的茶叶毒死了楚文，季洁终于找出了真凶。

佟林从赵鹏绑架案的结案报告中发现疑点，重回仓库后挖出苏渤海妻子叶晓琳的尸体。佟林带王勇去四川继续寻找酒的线索，找到了天下 第一舌品酒鉴定师帮忙调查布袋子上酒的味道。韩丽在网上关注一个叫BIOS的网友自杀直播，发现事态越发严重，已经发展为一起谋杀案件。季洁等人赶赴现场，在天涯社区工作人员和广大网友的支持配合下，找到并成功解救了BIOS的父亲，逮捕了涉嫌故意杀人的BIOS。

通过天下 第一舌的鉴定，佟林，王勇查询出布袋子上酒的出处——陈雪。佟林从四川回来找陈雪询问情况，陈雪早已有所准备，矢口否认。佟林无功而返。韩丽却意外的发现赵鹏老婆冯四会与陈雪关系密切，案情有了新的进展。六组的同事们看见了韩丽和有妇之夫李石的合影，议论纷纷。但韩丽依然集中精力工作。

经过六组的调查，原来是龙兴国替杨大成支付赎金后，杨大成不知感谢的态度令龙兴国非常心寒，于是龙兴国策划了一场教训杨大成的好戏，却阴差阳错害了自己的亲生儿子。佟林跟踪冯四会，发现了六百万现金，经过调查，冯四会交代是陈雪让她“绑架”赵鹏。锦绣地“16枪案”又变得扑朔迷离。

季洁和王勇调查发现，就在秦建国死前一天，他的千万财产和房产全部转移到司机谭金德名下，谎称跟李薇素不相识的谭金德却是李薇的初恋男友。其中有贪婪有暗算有不忠和背叛，案情的发展越发的出人意料。韩丽在与死者老婆薛萍三个小时的访谈中，查出凶手就是薛萍，薛萍承认自己杀了人，并交代了作案过程与动机。韩丽虽然成功抓获了嫌疑人，但也经历了惊心动魄的三小时。

秦建国一案终于告破，最终抓获的嫌疑人竟然是个窃贼，但结局不乏人性的温暖。六组在枯井内发现腐烂男子弃尸，查到死者家中，竟惊诧得知死者妻儿也死于半年前的一场大火。死者小舅子冯立有重大嫌疑，季洁带人抓捕，冯立立刻承认了害尽天良的犯罪事实，之后却屡屡耍赖推翻口供。六组的人面对如此恶人，恨从心生。

乔父一心盼望女儿嫁入豪门，因此恨死赵大同对女儿的纠缠。最终查明竟是乔父劝阻未成出手杀害女儿的爱人。杀害亲姐姐一家三口的冯立因证据不足依法只能释放。六组组员们愤慨不已。副支队长郑一民争取到十二小时，命令佟林带嫌疑人复查现场。经办此案的季洁不满却又无奈地接手发生在医院急诊室的另一桩“谋杀案”。

医院“谋杀案”，季洁和韩丽熬了整整一个通宵，也终于突破值班医生李伟的心理防线，找到了案件真相：一起由于医生不负责任导致的过失杀人案!嫌疑人冯立在复查现场“意外”脱逃。佟林与组员配合当地派出所警员展开追捕。最终佟林在规定时间内将嫌疑人冯立带回来并拿到了证据。开“摩的”吊座儿的司机魏家喜在家中被害，佟林等展开调查，发现魏家喜一直照顾着房东一家，房东太太李彩莲对魏家喜又格外关心。

佟林发现魏家喜还曾与著名女学者有过一段私情，但都没有找到杀人线索，最后终于通过公交车上的监控探头找到线索并抓获了入室抢劫杀人的凶手。季洁，韩丽，李少成百般阻拦朱雷预谋报复杀人的行为，终于使其终止犯罪。一老者被送进医院后抢救无效死亡，而送老者到医院的两男一女又都不见了。季洁等人开始介入调查此案。

保安群殴案件，引发出了新旧物业与业主的层层矛盾。调查中，佟林，王勇刚锁定犯罪嫌疑人，却发现物业公司与赵鹏案有着千丝万缕的联系。死者女儿回到医院认尸，季洁在层层剥离案发经过时发觉，老者千里迢迢来寻亲并非像女儿所说亲情不合，而是被人强行拘禁入会，老者痛心不已才选择跳楼正告女儿脱离魔窟，而逼他死的人正是身为传销代表的亲生女儿!由此揭开传销会的疯狂…

佟林最终发现死者竟是被亲如兄弟的新物业保安刺死，原因居然是一张三十块钱的充值卡。一旦伤害了自己的利益，多少亲情都变为疯狂。“艺术家”杨大毛，精心策划了一起杀人案，季洁侦破无从下手。另一位“艺术家”酋长，提供了重要线索——一盒录有杨大毛和死者对话的录音带。季洁受到以前一个案子的启发，迅速破案，却苦于没有证据。

“艺术家”杀人案，当警察查找到物证时，嫌疑人居然要求警方承认他是这个案件设计的原创，否则死活不说出物证所在。季洁将计就计，取得物证，顺利破案。佟林查出群殴事件是因为养蛐蛐的人被车撞后压死了蛐蛐，才不依不饶，暗地挑拨车主与他斗蛐蛐的宿敌结怨。双方雇人群殴，连伤两命。佟林顺藤摸瓜终于破案。

季洁终于劝阻了方国栋的寻死行为，也被老方的痛苦深深震撼。周志斌跟踪出租车，出租车又接上了两个等候已久的男人，与此同时六组接获情报，三个越狱犯正在追捕中，确定就是这三个人。为了救孩子，周志斌决定不亮明身份，备受屈辱却最终救下孩子。佟林对季洁感慨说道：有比勇敢更重要的！

四齿钉耙谋杀案，佟林等人在死者相好姚丽云家中发现了给死者发短信的手机。并在死者屋内找到姚丽云的内衣。在所有证据都指向姚丽云的时候，案情却又有了新的方向。季洁收到的快递内容是佟林和陈雪多年前的合影，引起季洁和郑一民的怀疑。季洁从铁锹的照片找出新线索，回到仓库后又挖出苏渤海的尸体。王勇从假邮递员衣服里剩余瓜子的味道入手，开始破案，通过对比，欲找出假邮递员的线索。

四齿钉耙谋杀案，季洁终于看出破绽，发现是老查的儿子査建华精心策划嫁祸给姚丽云的。王勇也通过瓜子找到了光头男，季洁等人跟随光头男子找到赵鹏的情人薛晓琪。季洁将薛晓琪带回刑侦支队询问相关事情。陈雪到刑侦支队给赵鹏做说客，并带佟林在街心花园见薛晓琪。季洁得到佟林的假消息，到北杨洼观音寺抓捕赵鹏失败。佟林的行为越发令人怀疑。

季洁和王勇慰问警员家属，发现周志斌母亲行事怪异，跟随她到了工商银行。原来周母以为周志斌被绑票，要汇巨额赎金，被季洁及银行工作人员等拦下。六组接到报案，一名绑匪挟持一名人质在联合银行门口，与众警员僵持，季洁赶到，趁给绑匪递水的瞬间，成功将绑匪击毙。陈雪带佟林去医院见赵鹏，得知新的线索——有关锦绣地十六枪的重要录音。

佟林的做法虽然得到谢局首肯，但是他和李少成仍要停职待查。佟林与薛晓琪在冷饮店见面聊天，薛晓琪看见佟林拿着赵鹏的手机，得知赵鹏已经出事儿了。薛晓琪被带回刑侦支队交出带有重要录音的证物——U盘。经调查，范明哲，宋辉和庞文学在上大学时曾经一起轮奸过区丽华，事隔多年，三人来找区丽华认子，被区丽华的丈夫李子强策划杀害。季洁等将李、庞抓获归案。

佟林听薛晓琪在电话里放原始录音的内容，还隐约听到了陈雪的笑声，季洁在监控录像里找到了新的线索——锦绣地“16枪案”的凶手葛安的哥哥葛雄。郑一民，季洁等人来到葛雄家，看到了葛雄家桌子上布满肮脏的吸毒用的锡纸和针管，在另一间房间里救出被绑的高翔宇秘书杨可。据杨可说，葛雄已将薛晓琪杀害，并将原始录音带烧毁，佟林万分沮丧。