被世人称为赵大善人的赵灵安突然身死，还被传出了狐妖索命的传闻，这一离奇案件吸引了刚上任的六扇门女捕头丁昭昭。丁昭昭前往赵府了解案情，却被赵府管家当成了土匪，还需要亮出六扇门腰牌才化解误会。据赵府管家所言，赵灵安前几日外出经商，于昨日晚上刚刚回到府中，还带了一名貌美女子回府，房门紧闭与女子独自在房中嬉闹一夜之后，第二日便化作陶俑死在屋内，女子也不知所踪。丁昭昭回到六扇门，欲向侍郎萧远道请得办理赵灵安之案，却被萧远道以案情危险女子不适合涉足为由拒绝。不甘心的丁昭昭找来好姐妹医女温思行到停尸房对赵灵安的尸体进行调查，发现了一些异常之处。为了进一步查找线索，丁昭昭又潜入赵府与“侠盗”楚不凡撞在了一起。

丁昭昭与黑衣人打作一团。丁昭昭怀疑黑衣人便是自己想要寻找的杀人凶手，本欲拉着楚不凡一同抓人，楚不凡却立马撇清二人关系，三人闹出的动静引起了赵府下人的注意，楚不凡和黑衣人都趁机逃脱。丁昭昭与温思行分析案情之时，对楚不凡出现在赵灵安府上颇为疑虑。虽然夜探赵府没有抓住黑衣人，但丁昭昭却认出楚不凡身份，并拿到了楚不凡极为重视的木佩，逼得楚不凡不得不答应与丁昭昭合作，帮助其破解赵府迷案。而且丁昭昭还自赵府管家口中得知，赵灵安回府当晚一直头戴帷帽，并未露出容貌，只能凭借声音判断应当为赵灵安。但赵灵安一直随身携带的扳指却并不在尸体之上，赵府管家以为妖狐将扳指带走，丁昭昭却觉得，其中另有蹊跷。

丁昭昭对于能让楚不凡帮自己破案一事十分得意，向温思行炫耀，但也明白二人一官一匪，身份有别，所以特意叮嘱温思行绝不可将此事外泄。丁昭昭与楚不凡再次来到停尸房，并肯定了丁昭昭之前的猜测，赵灵安早在回府之前已经身死，赵府下人听到的赵灵安的声音应该是口技艺人的模仿。次日，楚不凡带着丁昭昭寻找线索时，却发现有人跟踪。原来丁昭昭的父亲丁鹤虽表面支持女儿进六扇门，追求她的梦想，但对其安全仍十分担忧，故在察觉丁昭昭近几日的异常时派人跟踪。二人根据赵灵安尸体上的线索找到了案件的第一案发现场，破庙。但是对于更多的线索，却毫无头绪。复盘之下，二人将视线转移到了外出必然跟随在赵灵安身侧的一位车夫。

楚不凡调查到车夫张权好赌，且之前欠下赌坊大笔银子，却在赵灵安回来的当夜将赌债全都还上了。张权嫌疑进一步加重，二人到张权常去的赌坊堵人。果然张权被二人截住，但据张权所说，他只是被一封神秘信件约到了树林中，将载有赵灵安和美人的马车赶回来，其他的并不知晓，唯一一条有用的线索，便是拿银子收买他的人，左手似有被火烧过的疤痕。而且据其证实，当夜马车距离之前发现的第一现场并不远。萧远道听闻丁昭昭私下调查之事，本想勒令其停止，却在听到丁昭昭提起嫌犯左手有被火烧过的伤疤时瞬间惊恐，急匆匆的起身向外跑去。等到丁昭昭跟随萧远道身后赶至书院的时候，只见到了在大火中挣扎的萧远道之子萧宇杰，眼睁睁看着他命丧当场。

悲愤至极的萧远道封锁书院，调查现场所有可疑之人。众学子都称萧宇杰是在众目睽睽弹琴之时身上突然起火，当时并无他人引火，但是盘点人数时，却发现一位名叫齐明的学子不知所踪。丁昭昭惊讶的发现两人死状正符合泥犁审判的拔舌刑罚和火山刑罚。萧远道禁止丁昭昭参与此案，丁鹤担忧女儿状态，关心之时却发现了丁昭昭身上的木佩。多年之前，丁鹤曾在另一名孩童身上也见过一模一样的木佩，暗中吩咐手下调查木佩的来源。本与温思行约定好外出的丁昭昭却未出现，温思行担忧到丁府探望，原来温思行竟是丁鹤多年前收养的孤儿。丁昭昭郁闷之时，楚不凡却靠化装术混进了守卫森严的丁府，让丁昭昭对其手法产生了浓厚兴趣，为习得此门手法，任凭楚不凡驱使。

楚不凡和丁昭昭稍作容貌修饰就顺利的混出了丁府，到书院停放萧宇杰尸体处查找线索。虽被脂粉的味道掩盖，但二人还是发现萧宇杰身上有浓重的火油味。这一异常引起了二人的疑心。赶到被烧的现场再行查探，正撞上了仍带着手下调查的萧远道。二人只得暂时躲到假山中，却意外听闻现场遗落的千金难得的布料与楚不凡身上的布料相同，丁昭昭不由对楚不凡再度升起疑心。只是未待其有什么动作，楚不凡却先行暴露在了萧远道等人的眼下，六扇门的人对其追踪未果，萧远道只得吩咐手下从布料入手调查。丁昭昭趁着众人离去对现场再次调查。在温思行的帮助下，破解了起火的真正原因。只是她还没来得及将此事上报，萧远道已将有嫌疑的段文轩抓了起来，用刑拷打。

段文轩经受不住萧远道的刑讯逼供，承认自己对平日里言辞刻薄的萧宇杰心怀不满，但是言称最初起火原因跟他确实没有关系。正当萧远道想要继续重刑逼问的时候，丁昭昭及时赶到，向萧远道阐明了萧宇杰身上起火的真正原因，洗脱了段文轩的嫌疑。萧远道的狠厉手段着实颠覆了丁昭昭对他的认知，温思行却安慰她萧远道中年丧子难免情绪失控。等到丁昭昭神思不属的回府之时，才想起自己因为一时好奇心起，乔装打扮出府并未告知父亲丁鹤，好在丁鹤并未深究。丁鹤手下调查出木佩是从赵灵安或是楚不凡处得来，令丁鹤开始不安。萧远道也从火灾案的线索锁定了楚不凡，但却命手下先去调查段文轩是否是被段家收养的再决定要不要放人。

齐明本欲扮作老丈出城，却被萧远道识破。六扇门正欲对其抓捕之时，楚不凡却突然出现，并射箭袭击萧远道。齐明趁乱逃走，六扇门全力追缉楚不凡。丁昭昭欲从六扇门的旧档案中寻找赵灵安和萧远道的相关之处，最终将目光定格在了当年同在应天府且与二人有共同牵扯的善堂上。看守档案的周秉然自幼便被萧远道收养，只是腿有旧疾行动不便才被安排了文职。丁昭昭欲向周秉然打探旧事，却被其搪塞了过去。等到丁昭昭离开后，周秉然立即向萧远道禀报了此事，萧远道却不以为意，只是对待周秉然的态度却十分耐人寻味。楚不凡躲过了官兵们的追寻，却意外的和江湖人士厮杀起来，最终敌不过选择了跳崖。丁昭昭被深夜的敲击声惊醒，出门一看竟是浑身是血的楚不凡。

楚不凡伤势过重引发了高烧，无奈之下丁昭昭只好带他去温思行家里，瘦弱的丁昭昭使劲浑身力气才把楚不凡背到了思思家。好在温思行医术高超，稳住了楚不凡的伤情。但昏迷的楚不凡却总是惊恐的大声呼喊，他的话意外的刺激到了温思行，致使温思行的头疼病又犯了。待楚不凡彻底醒来的时候，已经又回到了丁昭昭的闺房。丁昭昭怀疑楚不凡与齐明有牵连，最近的行为都是为了帮齐明逃脱，只是无论她如何逼问，楚不凡始终没有承认。楚不凡倒是对其如何当上当朝的首位女捕头感到好奇，等丁昭昭讲述其巧妙帮助贵妃破获手镯失窃案才换取六扇门捕头作为奖励的时候，楚不凡不得不感慨丁昭昭的聪慧。

丁昭昭换了身非常淑女的装扮，使得楚不凡赞叹甚美。楚不凡见丁昭昭头上戴着送给她的簪子，还说喜欢的话会多送她几支，丁昭昭有些尴尬的说只是不想浪费而已，就赶紧打岔说起萧宇杰的案件。两人怀疑是同一凶手作案的赵府妖狐案上，两人一致决定要去再找管家问问，两人刚要行动，丁鹤突然在丁昭昭门外询问丁昭昭是不是身体不适，差点发现楚不凡的行迹，丁昭昭机智的遮掩了过去。萧远道听说没有抓到楚不凡甚是生气，命令下属继续追查。楚不凡回忆追杀自己的江湖中人，总感觉其行事十分异常，丁昭昭因此对能掌握部分江湖势力的萧远道更加怀疑。为了找到两起案件的关联，丁昭昭再次找上了赵府的管家，询问其关于赵灵安在应天府时候的事情。

赵府管家曾在赵灵安夫人卧房外偷听到一个大秘密。赵灵安在应天府时，主理善堂之事，善堂却突发大火，里面的孩子皆被烧死。众人都以为是意外，但赵府管家那夜却得知，火正是赵灵安放的。得知这一消息后，赵府管家便欲搜寻赵灵安放火的证据，欲以此换得奴籍，为自己谋一个自由身，不想却发现了一本账册，真相牵连甚广，管家担心自己暴露会被灭口，所以这么多年一直在赵府装作什么都不知道。但赵灵安与萧宇杰先后身死，让其忧心自己迟早被牵连，便在丁昭昭面前将事情和盘托出。为保其性命，丁昭昭将赵府管家安置在了温思行处。丁昭昭回府途中，看到奉萧远道之命四处抓人的六扇门之人，心情阴郁，再加上知晓了善堂行肮脏交易，一时间对官府失望至极。

楚不凡得知当初善堂有一位打手改名换姓开了镖局，正想让丁昭昭从此人入手。却被丁昭昭告知，这个如今名为赵德富的镖师刚刚身死，死因同样十分离奇，被众人发现冰冻在贴有封条的镖箱中，正应了泥犁审判的冰山刑罚。案件频发，调查之事刻不容缓，丁昭昭欲出府时，楚不凡言称同去，丁昭昭这才发现他的伤已经好的差不多了，就连自己藏匿的木佩也被其拿了回去。没了木佩的威胁，丁昭昭本以为楚不凡与其不会再有牵扯，但楚不凡竟然主动留下来相助，让丁昭昭心生波澜。昭凡二人观察赵德富的尸体后发现，赵德富实际是中毒而亡。二人欲前往破庙查探，不想刚至，却被突然冒出来的萧远道带人围了起来，萧远道还把此次捉住楚不凡的功劳归功于丁昭昭。

在萧远道挑拨之下，楚不凡当场与丁昭昭翻脸，先击退了丁昭昭，独自与六扇门的人缠斗起来，好在寻隙逃脱了。丁昭昭百口莫辩，郁闷的回府吐槽之时，楚不凡却突然出现在她面前，言称从未怀疑过她，只是为了保护丁她才假作上当。二人误会解开，楚不凡带丁昭昭来到赵德富的镖局镖师们暂时安置之处。经过询问得知，镖师原本押送的是贾员外的字画，赵德富并不在押送人员之列，只在众人出行前露过面，之后再见便是箱中冰尸。确认死者与当日送行之人确实都是赵德富后，丁昭昭又询问了整件事情的具体经过，最后目光放在了本来要运送字画的贾员外身上。贾府，丁昭昭警告楚不凡不要对贾员外家的财物动心思，忽然反应过来楚不凡当时在赵灵安府中的不妥之处。

面对丁昭昭的询问，贾员外并不配合，言语之中都是对官府的不信任，并催促其尽快破案为自己寻回价值不菲的字画。二人只得离去，两人也起了争执，楚不凡也向丁昭昭坦言自己虽对官府不信任，但相信丁昭昭是名好官，再次触动丁昭昭的内心。丁鹤以楚不凡的大盗身份为理由，劝说丁昭昭不要再与其接触，却被丁昭昭满脸坚定的为楚不凡作保。但丁昭昭不知的是，楚不凡确实和齐明有所牵扯，而最近的一桩桩案件，皆是二人合谋所为，只是齐明复仇心切，手段越来越激进。丁昭昭向丁鹤借来人手，略施小计终于从贾员外口中套得，其本欲在中途以假字画换下真字画骗取镖局保金，这才给了凶手可乘之机，只是为何假字画成了赵德富尸体，还需进一步斟查。

丁昭昭跑去架格库向周师兄打探当年善堂火灾之事，说近来的案件可能是善堂幸存孩子所为，周秉然听后心中骇然。待丁昭昭走后，周秉然再次向萧远道回禀此事，还提及善堂当年似有幸存之人，萧远道呵斥了周秉然，并再次叮嘱他交办的事儿做好就行。丁昭昭告知楚不凡，六扇门中关于善堂火灾记载极为模糊，楚不凡犀利的指出不妥之处，将萧远道的异常之处再次加深。周秉然忆起自己的幼时，原来他便是善堂收养的孩子之一，也曾受善堂掌权者虐待，为了自己活下去告发意图逃跑的同伴，才换得了成为萧远道义子的机会。一件件事情都与当年的善堂旧人有关，丁昭昭与楚不凡顺着这条线索查下去，找到了曾在善堂做饭的厨娘，只是这次，似乎又来晚了一步。

丁昭昭与楚不凡赶至厨娘家时，已是惨死一片，二人迅速勘察，发现厨娘女儿还尚余一丝气息。丁昭昭速将其带至温思行家，而楚不凡则留在原地继续查找线索。医术高明的温思行暂时让月儿恢复了神志，却不能保证可以留住其性命，丁昭昭嘱托温思行后又赶紧回到案发现场。却不知她走后，齐明也来到了温思行家。原来，温思行与齐明、楚不凡一样，都是当年善堂大火中逃出来的孩子。为了不暴露自己，齐明只得将见过自己真容的月儿除去。等到丁昭昭再回到温思行家的时候，温思行愧疚的向其忏悔自己没有救活月儿。温思行和丁昭昭将月儿埋葬在了乱坟岗，正好遇上了祭奠当年善堂孩子们的周秉然。周秉然悄悄的多了起来，却发现温思行很是熟悉的感觉。

温思行为周秉然看诊，之后周秉然以感谢的名义送上花生酥试探，得知温思行正如自己记忆中的同伴一样对花生过敏，再加上丁昭昭所言温思行的身世，周秉然基本确定了温思行的身份，心中大骇。楚不凡私下与齐明相见之时，斥责他杀死厨娘一家的行为过激，警告他不许再动无辜之人。对于对自己有救命之恩的楚不凡，齐明还算听从。萧远道跟踪周秉然，怀疑了温思行的身份，将其带至六扇门审问，甚至欲将杀害萧宇杰等人的恶行安在温思行的身上。面对温思行拒不承认身份的行为，萧远道直接将周秉然带来，二人当场对质。周秉然直接指出，昔日同伴身上的胎记所在。

萧远道得意的等着周秉然揭穿温思行的伪装，却发现温思行的身上根本没有胎记。萧远道愤而离开。温思行却对周秉然的行为十分不解，因为她清楚自己的确就是他们要找的那个人，但周秉然之前的说辞，分明是在为其遮掩，与幼时他出卖同伴之举判若两人。萧远道以温思行为饵，钓出了临走前想再与温思行叙旧的齐明。齐明自知难逃萧远道之手，干脆的承认了自己的身份，认下了杀害萧宇杰之事，同时以那本记录萧远道等人恶行的账册为要挟，让萧远道不敢轻举妄动。丁昭昭接温思行出狱，却被温思行恳请再见齐明一面。温思行看到齐明的伤势，悲伤至极，齐明说给她们的话听着很无情，其实是在与温思行不舍的道别，希望她幸福的活下去。

六扇门突然传来齐明在狱中自尽的消息，萧远道怀疑最后一次与齐明有单独接触的温思行和丁昭昭带走了至关重要的账册，旁敲侧击的询问之下却没有任何收获。为了得知账册消息，萧远道破天荒的同意了丁昭昭加入侦破案件，找出齐明同党。楚不凡扮作求医老丈到温思行府上，二人相认。齐明之事还没有进展，周秉然横死六扇门刑房的消息又突然传来，死法正是泥犁审判中的铁树刑罚。萧远道笃定此事是齐明同党所为，督促丁昭昭抓捕凶手。而楚不凡却怀疑此举是萧远道模仿作案，泄愤杀死周秉然，并以此为借口让丁昭昭带自己进入六扇门寻找线索。丁昭昭对刑房捕头的问询印证了楚不凡的猜测，丁昭昭迫切的要告知楚不凡时，楚不凡说还有更重要的发现。

丁昭昭和楚不凡躲在草丛里听到萧远道和丁鹤的交谈内容，丁昭昭越听越愤怒就忍不住冲了出去，楚不凡继续躲藏着。丁昭昭大声指责萧远道意欲污蔑自己的父亲，萧远道和丁鹤非常震惊丁昭昭的出现，但萧远道并未多做辩解，只留下了一句嘲讽之语便匆匆离去。而丁鹤义正严词的向丁昭昭表明自己的清白，将一切归咎于萧远道企图用丁昭昭做威胁让其帮忙遮掩罪行，昭昭要求其向朝廷揭发萧远道之时，丁鹤又以证据不足为由推脱。楚不凡向丁昭昭挑明自己对丁鹤并不信任，二人之间产生裂痕。丁鹤劝说丁昭昭不要再去六扇门，但一身正气的丁昭昭誓要找到萧远道作恶的证据，丁鹤和萧远道都甚是愤怒。丁昭昭满目伤怀的走进架阁库，却意外发现了一本册子。

丁昭昭满是伤感与失望的回到丁府与丁鹤对质，却意外透露出自己已经取得善堂当年账册的信息。丁昭昭失魂落魄的逃离丁府，被楚不凡带到了客栈暂时安置。在楚不凡的安抚之下，丁昭昭情绪逐渐稳定下来，并决心要为当年善堂的孩子讨回公道。直到这时，温思行才现身向丁昭昭承认自己记忆已经恢复，并且她的确是当年善堂的孩子。正当三人研究账册之时，萧远道却突然冲了进来，意图逮捕温思行与楚不凡，抢夺丁昭昭手中的账册。为了保住证据，丁昭昭只得带着账册先行逃离。未曾想回到丁府，却又被丁鹤逼迫交出账册。丁昭昭强撑之下，被丁鹤软禁在了屋中。楚不凡再次用化装术混进丁府，丁昭昭来不及高兴，便听到了温思行被捕的消息，起身便要向外走去救人。

楚不凡拦下冲动的丁昭昭，为了摆脱丁鹤的控制，将她带出了丁府。丁昭昭本欲将账册交给楚不凡保管，萧远道却派人给二人传信，告知他们若想救出温思行，便用账册交换。丁昭昭趁楚不凡不备将其打晕，把真正的账册留下，想独自带着假账册前往萧远道约定之地救温思行。楚不凡及时赶来，二人携手站在了萧远道和丁鹤面前，当温思行被带上来后，告诉他们不要交出账册，便咬下了早就藏好的剧毒自尽了。萧远道趁丁昭昭悲伤之际抢过账册，却发现是假的，于是启动了机关欲除掉现场的所有人。丁昭昭和楚不凡奋力抵抗，意外触碰了隐藏机关，终于将萧远道击杀。丁鹤百般忏悔，想要丁昭昭将账册销毁保住丁家百年清誉，丁昭昭见其如今仍不知醒悟，伤心离去。

萧远道身死之后，之前的一系列命案斟查被移交给丁鹤所在的吏部，丁鹤顺水推舟把所有罪名安在了楚不凡的身上，丁鹤命人全力击杀楚不凡并销毁账册。为讨公道，丁昭昭亲自敲响登闻鼓。丁鹤阻拦不及，丁昭昭被带到皇帝面前，生生忍下越级告御状的五十杖刑罚，才将一项项证据陈至皇帝手中，终于揭发了当年的善堂冤案，天子震怒，下令彻查，凡涉案之人皆不得免责。丁鹤被下狱，楚不凡到狱中探望，却未曾想丁鹤开口便指出了他的身份：已故荆将军之子。楚不凡这才知晓木佩早就将自己暴露，只是丁鹤权衡利弊之后选择了将其牺牲。而丁鹤之所以被卷入其中，是为了救下难产的妻子及尚在腹中的丁昭昭，就连丁昭昭的大义灭亲之举，也是丁鹤为了保护她贰策划的。

丁鹤祈求楚不凡不要将事情真相告知丁昭昭，却被楚不凡质问可曾想过当年善堂的孩子。或许是丁鹤最终仁慈的救下了当年的温思行，或许是对丁昭昭的不忍伤害，楚不凡最终没有将人参的事告知丁昭昭。丁昭昭和楚不凡来到温思行的住处，两个人喝酒谈心，丁昭昭点出了楚不凡的其他身份。楚不凡承认最初有想要利用她还翻案的初心，但是对她的感情没有虚假。丁昭昭对楚不凡等人的遭遇十分同情，但他毕竟也是犯错之人。丁昭昭问楚不凡会不会恨自己，楚不凡表明了自己的爱意，丁昭昭拿出了两人曾签下的契约，告诉楚不凡，自己会一直等他。皇帝念及楚家满门忠烈，再加之事出有因，对楚不凡从轻发落。一年后，四处行侠仗义的丁昭昭最终与出狱的楚不凡再度相遇。