联邦调查局开始调查一名大学女生的失踪案，主管该案的联邦调查局行为科学部负责人Jack探员邀请对连环杀手的心理世界有独特见解的犯罪分析专家Will加盟他的团队。Jack自知他无法独立完成「顾问」工作，于是拉来了聪明绝顶的精神病学专家Hannibal医生。谁也没有料到，这位医生不仅是全美国最「成功」的连环杀手，还是一个不折不扣的食人恶魔。

Graham正式成为FBI的特别调查员，并开始帮助Jack Crawford和BAU小组(行为分析组)寻找一名将受害人活埋的变态凶手——不仅如此，他还在埋受害人的土地上种蘑菇(本质上就是拿身体当「肥料」)在心理治疗过程中，Hannibal利用Will对Abigail的责任感逐渐取得了Will的信任，并且诱使Will敞开心扉说出了杀死Hobbs的真实感受。

Jack认为Abigail参与了其父亲Garret Jacob Hobbs所犯下的连环谋杀案。尽管Alana Bloom医生提出了反对意见，但是在Hannibal的支持下，Abigail被护送回明尼苏达州。在那里，她发现了许多针对她和她的家人的敌意行为。更糟的是，一个模仿作案者杀害了Abigail的一个朋友。Hannibal建议他们藏起尸体以保护Abigail——但隐瞒秘密是要付出代价的。

will又投入到了新的案件调查当中，这次的两起命案都是发生在家庭之中，一家大小全部遇害。命案的共同点是作案手法相似，而且两个家庭都有一位小男孩在案发前失踪。经过will和调查组的携手调查，他们把目标指向了失踪的小男孩。

Will和BAU调查组开始追踪另一名连环杀手。这名凶犯的主要作案特点是：将受害人的后背切开，割下肉条装饰成「天使的羽翼」，使受害人从正面看起来像个天使。重新回到一线工作让Will感到了沉重的心理压力，他的精神状态也将面临巨大考验，Hannibal决定抓住机会在Will和Jack之间制造矛盾。

昔日同事Chilton医生与Jack和Alana取得联系，称他们已经抓住了臭名昭著的「切萨皮克开膛手」。不久之后，Chilton医生的一名病人便犯下一起谋杀案，作案手法与「切萨皮克开膛手」十分相像。调查组认为真正的开膛手应该是一名外科医生，并且仍然在逃——因为Jack以前的门生Miriam成了开膛手的下一个作案目标。

BAU调查组接手一起新案件，受害人都被取走了某个器官。Jack认为切萨皮克开膛手可能再次出现，但Will坚信受害人之死只是一系列非法活体器官摘取行为出现意外而导致的后果。与此同时，Will一直被奇怪的恶梦困扰——他梦见自己是Abigail的父亲！Alana Bloom渐渐落入Hannibal的诱惑陷阱中，而Hannibal也开始去见他自己的心理医生Bedelia Du Maurier。

又有新的命案发生了，这次是一个乐团的成员遇害。凶手用极其残酷的手法，把受害者的喉咙割掉、插入琴弦，做成了一个人体乐器安放在舞台的中央。汉尼拔通过他的患者认识了tobias，tobias是个疯狂的乐器爱好者人，他们一样拥有不可告人的可怕癖好。

BAU调查组追踪一个恶心的连环杀手：他杀死受害人，又将受害人的尸体从坟墓中挖出来做成一个图腾柱，仿佛他们是他的「战利品」。当Nick的尸体被人发现之后，Jack和Alana质问Abigail是否对他的死知情。Nick的尸体再次出现给Will带来某种启发，他对Abigail隐瞒的秘密有了新的想法，而Hannibal则竭力怂恿Will保留自己的一些秘密。

一起谋杀案中的两名受害人被凶手以同种手法毁容——他们的脸被「绘」成了「格拉斯哥笑脸」。Will第一次在犯罪现场失去控制，不仅弄乱了现场，而且还幻想自己犯下了第一起谋杀案。核磁共振检查显示他患上了严重的脑炎，但Hannibal威胁他的主治医师Sutcliffe不准说真话，只能告诉Will「他一切都好」。

Gideon医生逃脱了警方的羁押，发誓要杀死对他进行分析鉴定的精神病学专家。Will和BAU调查组通过监视Freddie Lounds的博客来追查Gideon的下落，希望在他伤害Alana之前抓住他。为了诱使Will和Gideon共处一室，Hannibal故意用阴谋手段误导BAU调查组的侦查方向。Jack质问Chilton医生是否和Gideon的逃跑有关联。

Georgia Madchen在一场爆炸中丧生，Will坚信模仿作案的凶手仍然活着。BAU调查组找到Abigail与「Minnesota Shrike」案件受害人之间的关联，可是当他们准备逮捕Abigail时，却发现Will提前将她从医院带走了。Will的幻觉越来越严重，导致他在明尼苏达州失去了Abigail的踪迹。

Will从明尼苏达州返回，但Abigail并没有一起回来。Hannibal故意告发Will，Jack和BAU调查组随后发现了一些十分不利于Will的证据——他不仅杀害了Abigail，而且很可能就是那个他们一直在追踪的、犯下多起命案的「模仿杀手」。Jack和Alana不得不面对现实：Will真的有能力杀人。Will遭到逮捕，但他拼命想要逃出去。为了挣脱手铐，他甚至自残一只手指！