字母軍團的連番作案在市民中造成恐慌，黑盾組夜以繼日地工作希望能早日破案。周小篆和蘇眠、韓沉等人商量找出線索的辦法，周小篆修復了系統的漏洞，蘇眠分析了R的心理，韓沉將一切總結歸納，誓要抓出罪犯。見眾人的情緒都不太高漲，韓沉請大家吃飯以振士氣。冷面沒有參加聚餐，從嘮叨的八卦中得知，冷面似乎跟之前受槍傷時照顧他的護士墜入了愛河。眾人胡吃海喝後盡興而歸，韓沉帶著蘇眠回到公寓，兩人愉快過夜。第二天，韓沉前往拿修好的車。蘇眠醒來時，發現家中被人闖入。來人告知蘇眠自己是A，並稱蘇眠為姐姐，他留下一封戰書後離開。黑盾組分析了戰書上的內容，字母軍團宣稱將會在7月7日7時送上一份大禮。送戰書的A、寫戰書的L，以及跟周小篆在網絡世界中博弈的R，剩下的三名字母軍團殺手全部到齊。眾人商量該如何找到他們。蘇眠通過犯罪心理分析了L的犯罪動機，推測他接下來要針對的目標範圍將是接送孩子的「父親」們。警方加強戒備，將有可能成為L目標的人儘量保護起來，L的計畫被迫流產。

韓沉從自家附近的監控中找出了A的鏡頭，找到了他曾經去過的商場。他與蘇眠前往商場調查，遇到恰好也來買書的徐司白。商場忽然警鈴大作，自動門關閉，任何人員無法出入，空調排風口內冒出大量疑似毒氣的白煙。一個男人被懸掛著出現在商場中央大堂。商場的LED屏幕播起了A的影像，A宣佈已在被劫持男子身上安裝了炸彈，要離開商場除非炸死該男子，從他身體內取出鑰匙。被劫持男子在精神崩潰中自我引爆了身上的炸彈，徐司白想沖上前護住蘇眠卻未能及時，爆炸衝擊波掀翻多人後直達蘇眠身邊，關鍵時刻韓沉將蘇眠一把護入懷中。事後警方趕到，蘇眠韓沉被及時送醫。徐司白傷勢不重，卻在醫院被字母軍團的人劫持帶走。 韓沉一直昏迷未醒，蘇眠在病房內守著他。手機收到兩段字母軍團發來的視頻，一段是小丑跳舞，一段是商場內男子被劫持的過程。視頻中字母軍團念了一首詩，蘇眠發現字母軍團並非只剩下三人，還有一個一直站在他們身後、如同啟明星般指引著他們的S存在。

A給蘇眠發來資訊，表示要對L受傷進行報復，殺更多的人。蘇眠發現無法聯絡上小篆，心中有了不詳的預感。A折磨毆打小篆，小篆卻始終不願屈服，A亮出底牌，他會在周小篆和徐司白身上各綁一個炸彈，來考驗蘇眠究竟會救誰。之後，蘇眠收到A發來的視訊，得知小篆和徐司白均被字母軍團綁架。蘇眠最終決定去救周小篆，聽到蘇眠決定的徐司白萬念俱灰地將通訊器踩得粉碎。警方找到小篆的所在位置後及時解除炸彈，小篆總算死裡逃生。韓沉拉著蘇眠再轉頭去救徐司白，在到達徐司白所在大樓的時候，樓上發生了爆炸。蘇眠以為徐司白已經遇難，痛哭涕零。徐司白這時卻完完整整地出現在她面前。原來他從A說的話中找出了密碼答案，解開炸彈裝置逃出，總算是死裡逃生。蘇眠想上前扶他，卻發覺徐司白明顯冷淡了很多。徐司白回去大哭一場，反思自己與蘇眠的感情。黑盾組則繼續追查A等人的下落。通過這幾日A等人針對自己的種種，蘇眠料定一切都是衝她而來。而在字母軍團這邊，已經消失許久的S終於出現在了他們面前。

L和R則扮成工作人員模樣潛入電信大樓。由於警方在全城加強了戒備，L和R費了不小的力氣才將病毒植入終端主機。他們更是在全城安排各類危險物品分散警力。周小篆通過對R在網絡上的行蹤的追查，發現R曾經入侵一家游輪公司的內網竊取其中一艘「皇家艾森威」號游輪的資料，他懷疑字母軍團會在這艘游輪上搞恐怖活動。另一方面，韓沉與蘇眠在接到一處廣場上的炸彈威脅報警，趕往廣場排爆。徐司白也跟隨鑑證人員前往取證。事後證明這又是一次假報警。韓沉對此感到氣憤，聯想起之前A在派出所留下的影像、再結合周小篆提供的游輪信息，兩人頓時想到字母軍團的下一次恐怖活動地址將會在游輪上。兩人匆匆離開現場趕往碼頭。他們剛走，廣場上便出現了帶有字母的小丑影像，擔心蘇眠安危的徐司白隨即帶領警員丁俊前往碼頭追趕二人。游輪上張燈結綵，某個基金會的慈善舞會將在游輪上進行。韓沉和蘇眠以將會發生恐怖襲擊為理由要求活動立即取消，卻遭到拒絕。見無法阻止活動，兩人混入賓客當中上船。之後趕到的徐司白和丁俊也來到船上。

所謂的兒童慈善基金會只是斂財的幌子，通過演戲的方式將基金會無恥的一面曝光出來後，乘客們十分憤慨。A表示會對幾位主犯進行懲罰。秦文瀧得知了韓沉蘇眠等人就在船上，不由地擔心起幾人的安危來。刑警調出基金會的背景，發現這個基金會曾與五年前字母軍團的案件有關。秦文瀧得知了韓沉蘇眠等人就在船上，不由地擔心起幾人的安危來。刑警調出基金會的背景，發現這個基金會曾與五年前字母軍團的案件有關。遊輪上，蘇眠等人根據L的提示，先是救出了基金會內負責採買的高層張福采，隨後幾人又在船體內的不同地方找到了會計師季子萇。季子萇帶著蘇眠和韓沉在船體內亂轉，隨後在機房內救出經理陳素琳，又發現了另一名人質何亞堯。沒想到何亞堯與陳素琳互相使眼色，欲偷襲韓沉和蘇眠。韓沉揭露季子萇就是有潔癖的L，一直掩飾得很好的L這時也終於露出了猙獰的嘴臉。L突然引爆炸彈，蘇眠昏倒中被人帶走。

蘇眠在與字母軍團眾人的相處中，慢慢瞭解到其他的殺手們的個性。A是擅長火藥爆炸物調製的年輕人；T沉默寡言，槍法高明，是以狙擊為主的殺手；E是調配有毒物品的專家，她製毒，再由L下毒，兩人配合無雙；L有潔癖，頗有藝術品位，另一位M就是蘇眠的引薦人，外表是咖啡店的店主，實際上是酷愛性窒息的殺人狂，另外還有一個殺手K，由於大家都戴著面具，蘇眠並不知道K就是許湳柏。蘇眠無意中進到S的書房，S書房內放著蘇眠少女時期偷拍的照片，蘇眠大驚失色，知道自己的身份早就暴露。蘇眠強作鎮定，躲進房間內給許教授發訊息。許教授看到訊息，欲去救蘇眠，許湳柏阻止。許湳柏駕車撞翻自己父親的車，許教授昏迷入院。在知道兒子的真實身份後，許教授選擇跳樓自殺，許湳柏也因此變得更加扭曲。字母軍團的計畫仍然在進行，A和L偽裝成警察找到和蘇眠長相相似的表妹白錦曦，她也是一名警校學生，A和L哄騙白錦曦救援身陷危險的蘇眠，隨時做好準備代替蘇眠，白錦曦擔心表姐安危，毅然和男友分手。由於蘇眠失去聯絡，韓沉知道蘇眠陷入了危險。