民國天津的拜河大典驚現一大一小兩具屍體。大的為漕運商會會長丁義秋；小的為一死嬰，通體綠毛。剛留學回來的漕運少爺丁卯認為昨晚剛剛救他上岸的小河神郭得友有嫌疑。老河神郭淳對丁義秋施展點菸辨冤，卻沒說結果。郭得友心存懷疑，潛入漕運商會，不顧禁忌施展點菸辨冤暈倒。被丁卯發現。

郭得友施展點菸辨冤暈倒，青梅竹馬小神婆顧影趕到漕運商會解圍。原來丁卯也已經驗過屍，和郭得友得出的死因一致，丁義秋是死在海裡。丁卯在警局拿到臨時警探身份，回到龍王廟欲調查郭得友，被郭淳阻止。當晚有人潛入龍王廟偷死嬰，老郭展示江湖經驗將死嬰奪下。丁卯折服，搬到龍王廟拜老郭為師。漕運商會胡總管埋怨郭淳為何要收下丁卯。

郭得友和顧影去鬼市查接生記錄，丁卯去警局差失蹤人口。最終查出薛府有個小姐薛媛媛前段時間生下一子，近日卻亡。郭得友忽悠丁卯以弔唁為幌子調查，薛府老爺薛慶陽以為姦夫上門將其拿下。郭得友和顧影趕到解圍。薛慶陽說薛媛媛與人私通懷上一子，後回家。薛慶陽欲掩蓋家醜，將薛媛媛軟禁。不聊一日薛媛媛帶著孩子逃跑，落入河中溺斃。郭得友提出讓薛父斂回死嬰，母子合葬。薛慶陽應允。

薛府管家貴叔到龍王廟接嬰屍，向郭得友道出薛府下人並未親眼得見薛小姐淹死河中。郭得友藉著送死嬰的當，對薛媛媛施展點菸辨冤，發現薛媛媛真實死因。市政府肖祕書長千金肖蘭蘭訂婚，丁卯前去隨份子，在聚華大飯店門口遇到顧影和郭得友。郭得友稱薛媛媛一案明天就能告破。薛媛媛即將下葬，三人趕到阻止，揭露薛媛媛真實死因，薛慶陽認罪。抬棺人突然帶著棺材奪門而走。郭得友和顧影追擊，丁卯留下問薛慶陽孩子的下落，得到孩子被一個神祕人劫走的訊息。

屍體被殮回漕運的慈善醫院，醫院被漕運商會封鎖。肖蘭蘭得到訊息後覺得蹊蹺，請丁卯幫忙進入醫院。原因是肖蘭蘭的未婚夫錢子賢已經失蹤多日。丁卯帶著肖蘭蘭去醫院被拒。郭得友開始著手對綁著丁義秋沉在河底的玄武像展開調查。丁卯回漕運質問胡管家為何封鎖，得到怕暴發疫情的藉口。丁卯回想起薛慶陽供述搶走薛媛媛孩子的人的特徵，似乎跟自己的父親非常吻合。丁卯意志消沉地回到龍王廟，郭得友告訴他，有辦法能進醫院。郭得友、丁卯、顧影潛入醫院停屍房。

郭得友、丁卯、顧影潛入醫院停屍房，發現肖蘭蘭也混了進來。錢子賢的屍體也混在群屍中。丁卯驗屍得到屍體都有一種怪病，呈現為血管有藍紫色曲張。但錢子賢身上卻沒有這種感染。所有人都是中毒而死。線索混亂，郭得友點菸辨冤，得出這些屍體生前都吸食過鴉片。通過鴉片的線索，郭得友和丁卯兵分兩路，各自展開調查，得到的所有線索都指向一處——位於租界的聚華大飯店。

郭得友和顧影，丁卯和肖蘭蘭，不約而同來到聚華大飯店。郭得友製造混亂，四人趁亂混進了飯店後院隱藏的鴉片館。四人大鬧鴉片館，逃走時發現一間密室，裡面藏有漕運商會的船隻調遣記錄。警察查封煙館，郭得友抓出隱藏很深的煙館管理者，王掌櫃。王掌櫃被丁卯帶回警局審問，得到其父親丁義秋一直販賣鴉片的訊息。

當晚胡總管來警局看望丁卯，離開後丁卯發現王掌櫃離奇溺死於牢房之中。郭得友經過一番推斷，得出結論。肖蘭蘭通過被封存的報紙查到了玄武像的出處，並且得知丁義秋、胡海江、郭淳二十年前剿滅了一個叫做魔古道的邪教。郭得友利用丁卯伏法的假訊息，逼出殺死王掌櫃的真兇——胡總管。與此同時，老河神郭淳失蹤。郭得友向丁卯講解了胡總管殺死王掌櫃的手法。得知真相的丁卯幾近崩潰，胡總管被捕。

丁卯安慰胡總管的妻子，透露出胡總管的兒子胡天明曾為漕運商會賣命而死。如今胡妻孤苦伶仃，丁卯動容。漕運商會的死對頭一生門碼頭上驚現漕運手下馮二馬的屍體，雙方約下文鬥。顧影帶著馮二馬兒子小孩暫住龍王廟，馮二馬屍體也被斂回龍王廟。丁卯來到監獄探望胡總管。胡總管在監獄裡向丁卯詳細講述了魔古道的歷史，以及丁義秋和魔古道二十年的糾葛，偷走死嬰的就是丁義秋，最後為了警醒世人魔古道復甦，丁義秋請求胡總管將自己殺死沉屍。最後，胡總管只請求丁卯保護好漕運。丁卯繼任漕運會長。同時，馮二馬屍體運往龍王廟。

丁卯來到龍王廟驗屍馮二馬，從傷口中找到半顆牙齒，而且凶手沒有左手無名指。 郭得友對牙齒點菸辨冤，得出咬死馮二馬的是一個死人，而且極有可能是已經戰死的漕運打手孫老七。郭得友、丁卯、顧影撈到墓地掘墓驗屍，發現棺中竟然沒有屍體。郭得友判斷跟盜墓賊有關，遂帶二人潛入盜墓賊老巢，鬼市的深處。三人從盜墓賊老大口中知，孫老七屍體是馮二馬死前僱傭盜墓賊挖出的。

小海通過吃早餐回憶起了案發現場。通過小海的回憶，得到孫老七從水中躍出將馮二馬拉下水咬死。線索錯綜迷離。郭得友決定下河去找孫老七。丁卯回憶起兒時跟胡天明的相處時光，不禁感慨。漕運碼頭上，血腥的文鬥展開，丁卯傻眼。就在雙方越戰越勇之時，文鬥被水下冒出的活死人孫老七打斷。郭得友及時趕到，殺死活屍孫老七。丁卯和郭得友發現孫老七嘴裡吐出一種奇怪的甲蟲，郭得友聯想到之前潛入醫院停屍房時，似乎也接觸過這種蟲子，隨即趕回醫院。

連化清出現，用一種樂器，控制浮屍復活。郭得友和丁卯在醫院大戰百具活死人。與此同時，龍王廟的馮二馬也復活，於顧影和肖蘭蘭展開搏鬥。郭得友丁卯成功逃脫，並引發醫院爆炸。馮二馬也被自己的兒子小海刺死。連華清終於跟丁卯和郭得友見面，並用匕首劃開了丁卯的腹部，流血不止。丁卯命懸一線，生死難料。郭得友利用點菸辨怨完成縫合，化險為夷。丁卯在醫院醒來，他的德國導師，病毒專家施羅德前來看望，解釋活屍源於一種寄生蟲，連華清可以驅動活屍，其實是在操控蟲子。

丁卯剛剛傷愈，郭得友卻上門找丁卯借錢。此時漕運碼頭因為劇組拍電影而發生衝突，郭得友隨丁卯來到碼頭解決問題，結識了影星王美仁，並應邀聚參加電影宣傳晚宴。郭得友來到在鬼市花重金買關於魔古道的情報，就在知情人正要吐露訊息時，被奇怪的飛索擊殺。凶器疑似江湖祕傳神仙索。電影宣傳晚宴上影星王美仁應邀表演魔術，但表演過程中突發事件，戲法大師黃一索被吊死在舞台上。

黃一索被吊死，王美仁昏迷，顧影追到舞台後方，也離奇暈倒。王美仁驚嚇過度，神情恍惚。郭得友悉心安撫，王美仁這才逐漸平靜。顧影在龍王廟轉醒，回憶當日是被一個光頭胖子拋灑香粉，胖子手中似乎拎著一個皮箱，隨即顧影暈倒。郭得友扮作信馬潛入黃府，得知黃一索生前貪好酒色。巧遇丁卯顧影。三人意欲深入調查，被黃老夫人阻止。黃府二公子黃玉登報約戰殺兄凶手。多方線索指明凶手為早年被黃府逐出門的吳老顯。顧影和丁卯追查到吳老顯住處，顧影向丁卯陳說多年前與郭得友的一段淵源。同時黃府二公子黃玉離奇失蹤。付隊長前來黃府調查。

顧影丁卯前去捉拿吳老顯，郭得友隨後跟隨，吳老顯房中種植奇花，三人分別身中幻術，顧影丁卯險些喪命。郭得友身陷辨冤幻境，老郭在幻境現身，將郭得友喚醒。小河神趕到吳老顯茅屋，見顧影昏迷，沒有了氣息，神魂落魄對顧影表露衷腸。誰知顧影故作昏迷，引郭得友上鉤。三人破解幻術之後，終於找到被勒死的吳老顯和已失神的黃玉。黃玉解釋說吳老顯綁架自己想殺人，出於自衛勒死吳老顯。但郭得友識破黃玉詭計，揭破了黃玉殺害自己哥哥和吳老顯的陰謀。黃玉對此供認不諱，將犯案過程陳述一遍。欲對郭得友痛下殺手。哪承想郭得友早有防備，虛張聲勢，黃玉昏迷被捕。黃玉被關到警局後神情失常，丁卯認為黃玉需要做精神檢測。

郭得友、顧影、丁卯彙總線索，得出結論，欲除魔古道，先找傳經人。三人決定去警局竊取檔案。此時一生門崔瘋子到漕運商會碼頭公然用高價搶奪腳力，肖蘭蘭出主意幫丁卯化解危機。丁卯與肖蘭蘭關係再進一層。王美仁受郭得友之託到警局看望付隊長，郭得友趁機拿到了關於傳經人的資訊確實經過加密，無法破解，肖蘭蘭提醒，必須有母本。崔瘋子計策並未得逞，氣急敗壞，神祕人前來表示願意與他合作搞垮漕運商會。不久，看押黃玉警察就被黃玉勒死在警局之中，行凶之時，黃玉神智清醒，並回憶起連化青深夜探訪，授計黃玉奪去下一代家主之位。第二日，付隊長帶人提審黃玉，黃玉再度精神錯亂。

郭得友從警局套出話來，在鬼市找到了破解密碼的母本，交予肖蘭蘭幫忙破解線索。並探聽得知，今日有人買走十具屍體，用木箱子呈放。一生門和漕運商會爭奪英國領事合作許可權，一生門似乎早知內情，佔據上風。顧影和張神婆幫一生門做法祈福，發現有人往一生門內部運送很大的木箱子。經過郭得友和顧影的追蹤，得知大木箱被運進了英國領事館。二人潛入正在舉行晚宴的領事館，丁卯也在其中與英國領事商談合作。黃玉被押送至小西關監獄，肖蘭蘭破解謎題，得出「小西關特需」。郭得友顧影尋找箱子，發現有人在領事館閣樓施展煉屍術，施術人，正是胡妻！

胡妻向郭得友顧影交代為何要施展煉屍術，不料屍體復活，領事館大亂。潛入人群的連化青，趁機遁走。復活的胡天明擒住丁卯，胡夫人為救丁卯，與愛子同歸於盡。郭得友、丁卯、顧影和王美仁有驚無險，順利逃脫。丁卯拆閱胡夫人絕筆，心下悽然。郭得友從肖蘭蘭得知小西關監獄，並藉助肖蘭蘭的幫忙成功混入小西關。丁卯也利用付隊長的關係追查至此。此時，牢房內，黃玉施展縮骨功，順利逃脫。

郭得友肖蘭蘭從獄警處獲知特需牢房訊息，勞內犯人，極度危險，正是魔古道傳經人。此時丁卯付隊長趕到。突然有獄警被殺，郭得友偷偷潛入牢房，特需牢房內，犯人解下眼罩，催眠了典獄長。丁卯及付隊長提審黃玉，發現黃玉早已消失無蹤。二人巧遇郭得友，就在郭丁趕往特需牢房之時，典獄長放出了監獄所有犯人，混戰一觸即發。黃玉救出了魔古道的神祕人物——傳經人，小神仙。監獄一片混亂，郭得友和丁卯來到關押傳經人的牢房時，發現傳經人已然逃離監獄。但通過傳經人控制他人的手段分析出，傳經人應該是一名催眠高手。郭得友與被催眠的小女孩對峙。肖蘭蘭遭到犯人猥褻，丁卯挺身而出，成功解救。魚四趕到，大戰犯人。郭得友面對小女孩決定賭一把。

付隊長和魚四挺身而出，壓制暴亂。郭得友貌似救下被催眠的小姑娘。黃玉現身，挾持了郭得友為人質，付隊長開槍擊斃黃玉。突然軍隊趕到監獄，接管了監獄控制權。肖三告訴肖祕書長，小神仙已死，就地掩埋。王美仁到龍王廟與郭得友告別，遇見顧影，二人和解。郭得友和丁卯找付隊長瞭解監獄暴亂是否與魔古道有關，從付隊長口中得知傳經人已被處決。肖三安慰肖蘭蘭，言語點播肖蘭蘭莫要深查魔古道。肖三與連化青翻臉。反被連化青牽制。顧影與郭得友蜜意柔情被張神婆撞破，言語交鋒中，張神婆得知小神仙出世，驚懼萬分。經過監獄一事，丁卯與肖蘭蘭關係更近一步，肖父警告丁卯，不許跟肖蘭蘭見面。丁卯得知，接管監獄的軍隊，正是肖家派出。

丁卯和郭得友急欲得知傳經人情況，二人從張神婆口中得知，二十年前的往事。連華清找肖三對峙，原來傳經人並沒有被處決，而是被肖三秘密關押，作為跟連華清談判的籌碼。丁卯與肖蘭蘭關係更近一步，二人在碼頭談心時突然遭遇黑衣人襲擊，幸好肖三及時趕到化解危及。顧影不顧神婆勸阻，來到龍王廟尋找郭得友。連華清利用肖三的疏漏，制服肖三，找到了傳經人小神仙。小神仙許諾，會找到聖童！肖父從軍官處得知，當日私自調兵者，正是肖三，下令全城搜捕！丁卯研習催眠，春情旖旎之間被肖蘭蘭喚醒，告知丁卯，小神仙尚在人間。龍王廟內，郭得友發現顧影趕仙鞭之上，有一張戲票。顧影失魂落魄，流落街頭。

顧影突然失蹤，郭得友感到不妙，按照留下的線索，在戲園子與小神仙會面，見識到了小神仙強大的催眠技藝。小神仙道出了魔古道的全部真相，並以顧影的生命為要挾，讓郭得友投靠魔古道。肖三被連化青餵食鮮血，染上魔古道病毒！郭得友在街頭偶遇肖蘭蘭，丁卯，告知二人已與小神仙碰面。經二人提醒，郭得友心性大變。找到神婆商討對策。二人找到肖父討要鐵畫銀鉤風水總圖。顧影別小神仙控制，自入水牢。郭得友分析出了關押顧影的地點，尋蹤覓跡前來一家廢棄的火油工廠解救。郭得友與肖祕書長派遣的軍隊前往營救。不料軍隊被小神仙催眠，全部互相開槍慘死。郭得友卻也是受小神仙空制入水。

危急之際，郭得友進入辨冤幻境，經師父點化，郭得友突然醒來，把小神仙拉入水中，反將小神仙溺斃，救出顧影。街道上，肖三攔住肖蘭蘭，告訴肖蘭蘭連化青有大陰謀，讓丁卯組織，同時，郭得友已不可信任。得知自己是魔古道聖童身份的郭得友，決然與顧影分別，與連華清合作。連化青帶領郭得友再臨廢棄工廠，由暗道下潛至地下。天津衛全城通緝郭得友，丁卯為此事與肖父決裂，肖蘭蘭跟隨丁卯離去。丁卯帶領漕運眾人趕至工廠，與魔古道教眾搏鬥。爭鬥間，工廠煙囪轟然炸裂。

原來連華清已經找到了魔古道病毒的源頭——惡水之源，是一個有劇毒的地下深潭。連華清的終極計劃是炸掉水潭，感染全天津。郭得友假意合作，跟隨連華清來到惡水之源。而丁卯肖蘭蘭也跟隨線索追查至此，遭到活人屍化的肖三阻擊。連華清聊到郭得友不是真的叛投，展開搏鬥。擊敗肖三的丁卯和肖蘭蘭趕來幫忙。顧影被老郭帶至此地，得知自己的聖童身份，此刻突然趕到，卻被垂死掙扎的肖三刺傷。眾人拼盡全力，也沒能阻止連華清提前準備的炸彈掉入惡水之源。郭得友為救天津城與眾人告別，奮不顧身躍入毒水之中。