锦衣卫千户袁彬奉命追查一道兵符的下落，他带领锦衣卫大战雇佣兵取得胜利，就在即将拿到兵符的时候，被一名红衣女横刀夺走，一直爱慕袁彬的女锦衣卫叶知秋立刻跟上，追踪红衣女下落。 锦衣卫指挥使季门达得知兵符失落，限袁彬五日内把兵符抢回来，并暗中策反袁彬的手下矮虎，希望矮虎能站在自己的阵营里。 叶知秋找到了红衣女的下落，她带领袁彬来到红衣女的秘密据点，却发现二人中了红衣女的埋伏，红衣女用叶知秋性命要挟袁彬，让他帮自己盗取王爷家的一件东西。袁彬无奈答应，得手后发现居然是四道兵符，同时他也偷听到王爷与人密谋要夺取十二道兵符，他带着兵符去寻红衣女，却又被红衣女戏弄，他用兵符换回了叶知秋，却让红衣女又逃跑了。

叶知秋在红衣女那里得到一块玉腰牌，上面刻着两柄金刀。袁彬拿着腰牌去找制作腰牌的匠人，匠人告诉他这是金刀门的腰牌。 袁彬从未听说过金刀门，他与叶知秋正陷入困境，天上划过一道报信的烟火，二人急匆匆赶到，发现报信人是镖局的镖师，此刻所有镖师都被杀害，袁彬断定凶手没有走远，与叶知秋分头寻找。 在不远处袁彬寻到了红衣女，红衣女承认自己是金刀门的人，二人大打出手，金刀门手下赶到带走了红衣女，袁彬仍然没有得知红衣女的身份。 季门达利用矮虎欠下的赌债，威胁矮虎命他尽快查清王爷府被盗之事，一位王爷的特使来到锦衣卫，追问季门达兵符的事，他指责季门达办事不力，季门达恼羞成怒，杀死了这名特使。

季门达将杀死特使之事嫁祸给袁彬，并令锦衣卫追杀袁彬。袁彬与锦衣卫追兵苦战，身负重伤千钧一发之际，红衣女及时赶到救走袁彬。 红衣女将袁彬带到自己的秘密据点养伤，并向袁彬讲出了事情的来龙去脉：原来金刀门是先皇留下的秘密军团，一直暗中为皇上做事，红衣女正是金刀门的门主，传言江湖上流传着十二道兵符，得到十二道兵符者可以召唤出十二个秘密军团，以此号令天下，此次金刀门得知王爷正在收集兵符，怀疑王爷心怀不轨，所以出手抢夺兵符。 袁彬此时恍然大悟，忆起眼前的红衣女正是童年的玩伴——姽婳！

金刀门得知黑龙帮藏有兵符，袁彬决定借此上演一出“鹬蚌相争，渔翁得利”。袁彬找到叶知秋，让她将兵符下落告知矮虎，同时自己给黑龙帮传递了锦衣卫要围攻他们的消息。黑龙帮与锦衣卫展开了一场恶战，袁彬趁机将矮虎制服带回金刀门，要求矮虎为自己作证，证明特使不是他杀的，叶知秋与姽婳大打出手，姽婳要杀叶知秋，袁彬不应，姽婳伤心跑掉。袁彬追上前去袒露了自己的情意。 叶知秋被门达抓住关进了诏狱。门达从叶知秋那里得知金刀门位置，姽婳与袁彬被其逼到绝境，装有兵符的匣子掉落，被门达拾到。门达为了遮掩真相将王爷之子杀死。姽婳为了不让门达得到全部的兵符，将身上仅剩的一枚扔下悬崖，同时姽婳与袁彬二人决定殉情，双双跳下悬崖。

袁彬跳下悬崖，发现自己身处一座洞穴，原来姽婳早就知道悬崖下面有一处玄机，为了试探袁彬的真心，才没有将此事告知。此处有一墓道，二人合力打开墓门后进入墓穴，姽婳猜测此墓主人为唐门开山始祖唐悲风，并在此意外发现了一个兵符，拔下兵符的一瞬间墓穴崩坏即将倒塌，二人逃出。 门达将杀死王爷之子的事，嫁祸给了金刀门，王爷知晓此事后缠绵病榻一蹶不振，同时门达一直让手下寻找袁彬的尸体。袁彬与姽婳在一座破庙落脚，与一队锦衣卫正面遭遇，二人击退锦衣卫，一名锦衣卫将袁彬还活着的事情禀告给了门达。门达此时得知与金刀门取得联系的关键是仇公。另一边，姽婳与袁彬为了早日结束躲来躲去的生活，也要通过仇公与金刀门主使取得联系。

袁彬与姽婳来到了约定地点，见到了仇公。仇公询问兵符的事情，趁姽婳拿兵符之际，向她放了冷箭。中箭的姽婳回手一搏，划伤了仇公的脸。刹那间大批的锦衣卫蜂拥而至，袁彬带姽婳逃了出来。 姽婳中了毒箭，昏迷前她告诉袁彬，这个仇公是别人易容的，另外还告诉袁彬，去风陵渡找崔古生。 袁彬带着姽婳赶到风陵渡，原来崔古生是姽婳的师叔，是一个易容师。他帮姽婳解毒，听了姽婳所说的经过，他怀疑是另一个易容师唐三所为，假仇公的脸被划破，必定还会去找唐三。袁彬带姽婳赶到了唐三家，发现原来之前假扮仇公的正是季门达！ 袁彬二人与季门达激战，唐三趁乱溜走，门达也逃走，逃走时把毒箭射向袁彬，姽婳为保护袁彬不惜挡了毒箭。

袁彬为了保住姽婳性命，将她带到云居寺疗伤。在寺院里，真正的仇公出现，仇公告诉袁彬，十二兵符可以召唤出十二个军团，这些军团一旦被召唤出来，便会帮铲除逆贼，季门达错以为拥有十二兵符可以号令天下。幕后主使还没有露出一点儿马脚，所以他们既要除掉季门达，又不能打草惊蛇。仇公把除掉季门达这件事交给袁彬去办，只要事情办成，锦衣卫指挥使的位子就属于袁彬。 袁彬是通缉要犯，光明正大的露面非常危险。袁彬和姽婳再次找到崔古生，在崔古生的帮助下，袁彬换了一副新容貌，但崔古生告诉袁彬，这副容貌只能维持三天。 袁彬与姽婳依依惜别后，换上锦衣卫的飞鱼服，拿起绣春刀，重新回去，寻找机会接近季门达。

王爷得知季门达已找到七道兵符，命季门达带着兵符前去王府，季门达暗藏私心，决定乘此机会除掉王爷。仇公想借此来一出“螳螂捕蝉黄雀在后”，命袁彬和自己的手下范良臣去除掉季门达。袁彬走后，姽婳十分担心，独自去他。 夜里范良臣听见异动，外出查看，被一蒙面人杀死。 袁彬得知叶知秋与矮虎都是被门季达折磨惨死，袁彬心中悲恸欲绝，与季门达大打出手，最终杀死了门达。未等袁彬喘息，蒙面人冲出要刺杀袁彬，原来蒙面人的真实身份是唐氏一门的后人——唐三。多年前唐悲风因为制作兵符，惨遭灭门。唐三是唐悲风的后人，所以他致力寻找兵符，借此报仇，此时袁彬精疲力尽不敌对手，最后关头，姽婳出现，救了袁彬。

李公公在牢中离奇死亡，袁彬在李公公手中发现写有“臣以死谢罪，最后一块兵符藏在御贡香炉中”的布条，并将其上报。御贡香炉乃海珠国与大明的交好之物，袁彬将炉中兵符呈上，就在召唤十二军团时，炉中那枚兵符自燃，袁彬惊恐万分自认办事不力。 锦衣卫褚万向袁彬坦白，心中怀疑锦衣卫内的叛徒正是姽婳。袁彬叫来姽婳，姽婳对此做出解释，而袁彬也表示自己信任姽婳。姽婳被袁彬的一腔真心所打动，却遇到前来提醒姽婳要完成任务的孤云。姽婳十分矛盾。

真正的幕后主使现身，竟然是仇公！原来仇公只是诈死，为的就是得到兵符！并且他是姽婳的父亲，一直暗中让姽婳破坏袁彬的计划， 姽婳劝告仇公不要一错再错，但仇公心中只有集齐兵符，见姽婳仍执迷不悟，将姽婳重伤。袁彬及时赶来，将重伤的姽婳救下。姽婳向袁彬悔过，最终得到谅解。 十二枚兵符集齐，兵团随召而来。原来仇公也是军团中的一支，他背信弃义，违背契约，妄想得到至高无上的权利，走上歧途。仇公与袁彬带领下的军团展开激烈厮杀，袁彬与其余十一只军团合力战胜仇公，还百姓和平天下。