民国八年的一个雨夜，吴啸天师兄一家三口都已死于非命，而罪魁祸首杜远山手中竟拿着神农药典。他想找杜远山拼命，夺回药典，却被杜远山的手下所阻拦。混乱中，他听到了师兄女儿东方靖琪的哭声，他抱起女孩跳窗逃走。却不知，师兄的儿子一息尚存，被杜远山抱起。十六年后，吴啸天和当年的东方靖琪，也就是如今他的义女吴小七来到了暨阳县父女俩此次的目的还是希望能够找到仇人杜远山报仇。却不知，杜远山正是当地有名的大户，开的惠民医院无人不知。在面摊旁，一户人家正在大办丧事。吴小七从面摊老板处，判断此病患应是假死还能救，决定借由此事，在暨阳县打响名头。因此吴小七的医术也被一些人所知。客栈，吴啸天知自己命不久矣，嘱咐吴小七复仇。

小七见事情愈演愈烈，决定趁此机会给杜家留个好印象，以便将来好接近杜家实现自己的报仇大计，于是用手中的银针扎中杜明海手腕，踢掉其手中的枪。马致远迅速将杜明海制服，以袭警夺枪罪名带走。此时爱财如命的警察局长肖金水出面调停，小七用药理知识层层剖析，认为责任不在惠民医院，而是马家无理取闹。杜明江对这个突然出现的外地女郎中生出爱才之心。杜明海生母二太太哭求杜远山去救儿子杜明海，并因悲痛过度引发头风病。肖金水左右逢源，借机分别敲诈马家和杜家。肖金水之妹肖若云见青梅竹马的杜明海刚出狱又二进宫焦急不已去狱中探望，杜明海竟厚着脸皮想吃烧鸡老酒。肖金水呵斥妹妹没有眼光，不准妹妹与杜明海有任何瓜葛，认为嫁给大少爷杜明江方为上策。

王富贵决定亲自去给小七送赏银，一见面就给小七行了暨阳管家的最高礼节“凤点头”，给小七一个下马威。小七见其故意刁难自己，便将杜家给的赏银顺手给了街边的乞丐。可惜中了王富贵的圈套，王富贵以小七对杜家不尊，当场宣告让小七断了进入杜家的年头。小七听闻，大为懊恼。马万年约了杜家码头工人大朱哥在茶楼见面，想要买通他为马家做事。恰逢革命人士李凤凰和石友琴在此接头。肖金水接到上级通知亲自带队在茶楼附近做埋伏。行动展开，马致远上楼抓捕，却被识破。李凤凰二人利用马万年跳窗逃跑。石友琴在逃跑过程中遇见了小七。因为之前的事情，小七有所愧疚决定帮她一把，放走石友琴。李凤凰却不幸中枪被捕，身负重伤，危及生命。小七不忍，说服肖金水救治李凤凰，小七运用自身高超的医术将李凤凰成功救治，耿直的马致远因此事爱上小七。

杜明海因下雨天装货，伤口未愈染上风寒，高烧昏迷不醒。无计可施的李歪脖，只能去找小七帮忙。小七见杜明海病情严重赶忙救治，写好药方让李歪脖去抓药，可是有一味药材找遍了暨阳县城只有马家药铺有。小七囊中空空，以祖传玉扳指作抵押想要买药。马万年则提出了一个条件，让小七想办法潜入惠民医院替马家“偷师学艺”，并开出十块大洋月例，否则不能赊药。小七认为吴啸天去世也有马家的责任，一直对马万年耿耿于怀，所以没有答应马万年的要求。马致远见状追赶小七，将药材送给她，希望小七能留在马家，为马家做事。小七谢绝其好意，将扳指抵押给了马致远，等有钱再来赎回。

杜明海举刀剁下了第六指，小七连扎数针在杜明海左手，这是银针止血及刺穴消失痛感。在场众人被杜明海之举惊呆，马致远转身离开。杜明海被小七所感动由此对小七心生爱意。肖若云前来码头看望杜明海，心疼杜明海身无分文，居无定所，为了帮助杜明海，骗杜明海请他吃饭同时宴请了哥哥肖金水和杜明江，希望哥哥肖金水能够帮杜明海一把，在她手底下干活，不料肖金水、杜明海二人一见面就开始争吵，不欢而散。小七在大街上遇见了被赶出酒楼的杜明海，杜明海提着烤鸭和烧酒借机感谢小七的恩情，开玩笑说要以身相许。小七一口答应，认为这是个进入杜府的好机会。杜明海道出了他被杜府赶出的真相，小七失望离开。

二太太终于醒了过来。杜明海激动地跑出通知大家，并为吴小七松绑。这天，吴小七在给二太太送银耳汤时，遇到杜明江。杜明江再次邀请吴小七去惠民医院当坐堂医生，被吴小七以各种理由推拒。随后，她将汤送到二太太房里，碰巧杜远山也在。他问及吴小七是哪里人，吴小七迟疑片刻回答自己是安徽芜湖人。在吴小七离开后，二太太夸她聪明能干，杜远山却指出吴小七隐瞒了自己真实的身份。因为他从吴小七的口音中听出她是北京人。杜远山对吴小七的怀疑愈发深重。为了赶走吴小七，二太太故意让她去杜远山书房做事，希望吴小七能主动去碰已经做好手脚的账本。这样一来，便可给吴小七安一个罪名，让其主动离开杜家。但吴小七进入书房，本就是为了寻找神农药典，而不是查看账本窃取机密。更何况，聪慧的吴小七早就看出了账本上的异样。这才躲过了大太太的陷害。大太太发现吴小七没有中计，也是特别恼火，一时猜不透吴小七的目的。

小七误将脏水泼到何家宝身上，春儿离间挑唆，遭到了何家宝的刁难。恰逢此时马致远找上门来，马致远上前替小七出头。几个喝醉的警察和何家宝言语产生冲突，警察和杜府家丁打了起来。杜明江出来制止和马致远对峙。杜明海回杜府看二太太看到马致远率人堵杜府大门，怕大哥杜明江吃亏，上前帮忙，为护兄长与马致远以命相搏。在打斗过程中，马致远身上小七所抵押的扳指掉落。小七制止了马致远和杜明海的争斗，马致远让手下醉酒的兄弟离开，独自一人准备进杜府找杜远山理论。

明海因小七每天都去马家给马致远看病而吃醋，对小七表示不满，小七不理会。这一切都被春儿看在眼里，春儿找大太太告状，大太太让其稍安勿躁，慢慢等小七露出破绽。杜明海郁闷的去找二太太，二太太认为小七是个丫鬟配不上杜明海，让其找门当户对的大小姐，杜明海生气离开。李歪脖等人在码头卸货偶然发现了里面暗藏军火，李歪脖见状不妙赶忙去找杜明海。小七在给马致远治病中无意得知此消息，想要揭发检举杜家趁此机会报仇。马万年将此事汇报给了肖金水，肖金水当即下令抓捕相关人士，扣押军火。杜明海得知此事，立即封锁了码头，让李歪脖通知大管家，查找货物底单。可惜准备时间不足，货主前来提取货物，被杜明海等人阻挠，双方爆发了激烈的冲突，原来这群人是附近铜锣寨的山匪，马致远带领警察及时支援，制服了山匪。

杜远山对于此次事件感到不解，怀疑家中出现内鬼。小七是被怀疑的重点对象，小七找到杜明海，隐晦的表达了自己多次看到大朱哥去见马万年，引起了杜明海的重视。杜明海发现大朱哥等人被马万年收买，押着这几人回杜府，杜远山大度将几人放掉，同时也打消了众人对于小七的猜疑。杜家因此事码头的经营权被马万年和肖金水合谋夺去。杜远山急火攻心，猝然病倒。小七无意中与杜明江的对话中得到了关于《神农药典》的消息，恰逢荷灯节将至，杜家上下都准备放花灯祈福。小七觉得这是绝好的机会，节日当天，小七借口身体不舒服，留在杜家。小七潜入杜家已逝的二老爷杜远川别院，却被春儿发觉，随便编了个借口搪塞了过去，王富贵出现帮助小七解围。

二太太发现杜远山房间失火，众家丁急忙救火，同时也发觉小七失踪。大太太认为此事和小七脱不了干系，立即派何家宝等人追捕。小七四处寻找马致远想要赎回自己的家传扳指，却得知马致远将扳指丢失。情形危急，小七赶忙离开。何家宝等人四处寻找小七不得，急忙去找王富贵汇报。王富贵却显得游刃有余，让何家宝等人去河边抓捕。小七欲从河边上船走水路逃走，可惜却被何家宝等人追上。小七被何家宝押着提到大管家王富贵面前。小七称父母大仇已报，死也无憾。王富贵却告诉她杜远山没死，杜远山精神抖擞地赶到，令小七大吃一惊，原来杜远山提前知道小七要对他下手，在王富贵的帮助下，分散小七的注意力，将毒药倒掉。

大太太连忙去找杜远山告状，称东方靖琪回来抢了杜家的生意，杜远山没有理会。大太太认为这是二太太请回来帮，杜明海争夺家产的，对东方靖琪开设药馆与杜家抢生意非常不满，和杜明江商量指使何家宝去以德大药房抬尸闹事。东方靖琪看出端倪，真相早已了然于胸，运用药理以及手中的证据让何家宝等人无地自容。马致远恰好遇到，将何家宝等人收监入狱。靖琪称此店用杜远山所赠盘缠而开，因此此店仍归属杜家。杜明海从人群中穿过，走到靖琪旁边，声称以德大药房也有他的股份，以后给大家免费看病，众人拍手叫好。

杜明海在以德大药房帮助东方靖琪免费赠送凉茶，这时杜府仆人长寿前来传达消息，杜明海听闻消息，想骗东方靖琪同去看戏，称二太太犯了头风病，正在免费赠饮凉茶的东方靖琪即被杜明海扛起飞奔到戏院。这引起想和杜明海独处的肖若云的不满。戏院中，杜明海竟向二太太介绍，称东方靖琪是其媳妇。肖若云醋意大发，故意找茬教训东方靖琪一个贫家女子要认清自己身份。本要离开的东方靖琪，被肖若云羞辱反激起斗志，随口几句便把肖若云气得离开。看出肖若云喜欢杜明海的杜明江失落无比，二太太急命杜明海送肖若云回家，杜明海路上竟劝肖若云接受杜明江，肖若云歇斯底里向杜明海表白只爱他，杜明海无计可施落荒而逃。

杜府众人筹款，因现金不足而发愁，肖若云赶到杜府，声称杜明海的事就是她的事，将自己的首饰之类的摘下，并帮忙想办法，见此情形大太太和杜明江对杜明海的不满加重。东方靖琪与杜明海伪装成山匪和大夫准备蒙混过关，胡乱打旗语，被山匪识破，山匪将计就计，将二人放行，进入山寨。靖琪在铜锣寨中找到了隐藏其中受了伤的杜远山，杜明海冒名顶替被识破，二人不幸被俘，成为山匪的人质。杜远山因心疼大骂杜明海糊涂，父子二人再生争执。杜家接到铜锣寨的山匪射箭传信，得知靖琪和杜明海被抓，顿时乱作一团。

山鬼派人将杜远山放了，东方靖琪却因接生未完无法离开。杜明海执意留下相陪。杜明江和山匪进行交易，心惊胆战，就怕被揭穿。山匪粗略的看了一下，放行。马致远等人在山脚等待杜明江的信号，可惜杜明江却早有算计，派何家宝埋伏，想要置杜远山于死地。何家宝冒充山匪出现，与杜远山缠斗，不料被杜远山制服。杜明江情急之下拿起木棒袭向杜远山，这时听到有动静，杜明江使出苦肉计，让何家宝将自己砍伤。李歪脖等人率众出现，看见情形大吃一惊，杜明江赶紧通知马致远进山剿匪。马致远等警察即将攻上山，却不料遭遇山匪的埋伏。

东方靖琪在街头听到杜家现在所遇到的危机，想要帮忙。杜家遭遇危机，杜远山有心无力，同时也因为杜明海两次冒死救父，杜远山心里对他有一定的认可，想要招杜明海回家帮忙做事。大太太等人对于杜远山的做法表示不满，称现在杜家一片混乱，需要有人主持。杜远山则称将来理清杜府的事情后再将杜府交给杜明江他们两兄弟。二太太去找杜明海回杜家，杜明海拒绝。二太太知道杜明海只听东方靖琪的，请求东方靖琪帮自己劝说杜明海趁此机会回府。杜明海提出要娶东方靖琪，东方靖琪称若杜明海能帮自己重振杜家产业，用十六抬大轿来娶自己，自己才会答应，杜明海欣然应允。

杜远山亲自在众人面前宣传东方靖琪为杜府药厂的新人大掌柜。东方靖琪履行诺言，用一系列换购政策收购质优价廉的草药原料，令杜家药厂起死回生。东方靖琪偶然窥破账面漏洞，设计将十个药店的掌柜的诳到药厂，并设法令杜远山到场，一起审计药厂旧账。王富贵猝不及防，急切中想与众账房商量对策，再次被东方靖琪点破，王富贵将查账的消息通知大太太、杜明江等人，杜明江等人慌忙凑了一笔钱以时间长为由搪塞了过去。 东方靖琪、杜明海触及到大太太、杜明江、王富贵一伙的利益，于是大太太愤慨借月会之际打压二太太，令二太太受辱。杜明海私下找到杜明江，愤然说出以后大太太等人再欺负二太太，他就不念及兄弟之情。杜明海的强势，令杜明江终于横下心整倒杜明海，夜里召来了王富贵、何家宝密谋。杜明海在街头突然被人用迷药迷晕掳去，醒来时却在妓院醉红楼内，后被衣不蔽体地扔在街上。此时药厂急寻杜明海发货，王富贵假装在醉红楼门口找到了晕晕乎乎的杜明海。杜明海被人抬回杜家时脸上还带着口红痕。

东方靖琪昼夜精心守护为杜明海疗伤，杜明海在东方靖琪的照料下清醒过来，但已忘记关于醉红楼的一系列事情。肖若云前来看望杜明海，见东方靖琪大为吃醋。与东方靖琪发生冲突。东方靖琪不以为意，反嘱咐肖若云好好照顾杜明海，令肖若云碰了个软钉子。东方靖琪此时已经明白杜明江一伙暗流汹涌，主动找杜远山说出自己的猜疑，杜远山说出自己不得不隐忍的真相，杜明江偷听到东方靖琪和杜远山对话，看出此次事件反而让杜远山更相信了东方靖琪和杜明海。杜明江连忙召集王富贵等人商量对策，称杜明海和东方靖琪已经严重威胁到他们的利益，东方靖琪若不扳到，自己贪污之事早晚东窗事发，必须要将两人除之而后快。王富贵不忍，杜明江称最近快到杭州药展，可以利用差价弥补缺漏。

对气味异常敏感的马致远发现一股烟味，唤醒靖琪。走出屋外，客栈已乱作一团，大门被强盗堵死。东方靖琪听到周山口的呼救，前去营救。杜明海和众人合力将大门撞开。 杜明海转身找东方靖琪，东方靖琪执意要救周山口，杜明海让靖琪去安全的地方，自己替她去救人。成功将周山口救出，冷静下来的三人，觉得这场大火蹊跷。第二天早上大太太找杜明江，发现了春儿和杜明江的事情。大太太窥破后责骂杜明江不知进取，杜明江却称对春儿不过逢场作戏。杜明江找王富贵商量事情，这时何家宝慌乱跑来称杜明海回来了，杜明江等人惊慌失措，同时杜明江派人杀害杜明海等人的事情也被躲在暗中的春儿听到。

杜明江酒醉又遭东方靖琪质问春儿一事，恼羞成怒关上房门欲行非礼，东方靖琪拼死反抗。春儿恰好赶来，质问杜明江，一气之下以所知机密相威胁，杜明江急欲掩盖事实要掐死春儿，杜明海赶来反被杜明江砸晕。此时大太太赶到，责骂东方靖琪、春儿轻薄并要严惩。春儿向东方靖琪哭诉杜明江无情无义，并说杜明江深藏阴谋，东方靖琪决定带春儿到杜远山面前，和杜明江三头对面，揭穿杜明江的伪君子面具。东方靖琪刨根问底，春儿正准备说青龙会的事情，何家宝突然闯入打断了春儿的话，将其提走。

春儿事件总算被杜明江蒙混过关，随之而来的是五年一度的杜家大管家遴选，杜明江知道王富贵如保不住大管家的位子，自己和大太太就会处于劣势，决定不惜一切代价助王富贵续任大管家，同时在参赛资格上做足文章。杜明江和杜明海都深知得大管家者得杜家天下。东方靖琪也和杜明海在杜远山支持下积极策划参选一事。而此时马万年也仿佛在筹划着什么，并希望马致远能将东方靖琪挖到马家药厂，薪酬比杜家翻五倍，马致远闻讯欣喜期望能与东方靖琪朝夕相处，东方靖琪却拒绝了马致远，一直喜欢的马致远的杜家大小姐杜明溪看到马致远对东方靖琪心生爱意而感到不满。

东方靖琪让人查账，让杜明江、大太太等人胆颤心惊，害怕东窗事发。杜明江提前找到王富贵许以重利，希望他能一力承担，王富贵因为自己的孤儿院的孩子而答应。东方靖琪在查账过程中发现，十万大洋库银失踪，令杜远山无比震惊。此时却发现王富贵已然不见。大太太恶人先告状，向杜远山告发王富贵卷款外逃。杜明江指使何家宝对王富贵杀人灭口。东方靖琪与杜明海迅速赶往码头，却发现王富贵已淹死水中。

东方靖琪称，虽然证据找不到，但所有疑点都指向杜明江。杜远山心知肚明，见此情形气急攻心，突发脑中风。东方靖琪为其把脉得知其病情，准备出去为杜远山开药，临行前嘱咐二太太不要离开杜远山。东方靖琪四处寻找杜明海，从周山口处得知杜明海可能去了后山，周山口陪同东方靖琪一块去寻找。突然下起了大雨两人去躲雨。杜明海回到杜家，心灰意冷将自己关在屋内，二太太因关心杜明海让杜府仆人长寿帮自己看着杜远山，二太太离开杜远山去找杜明海。杜明江趁无人之际，对杜远山下毒。东方靖琪担心杜远山的情况，冒雨赶回杜家，回来后阴错阳差成了唯一待在杜远山身边的外人，东方靖琪为其把脉发现杜远山中毒。陈守礼把杜远山抢救过来，可惜却变成了口不能言全身瘫痪的痴呆。杜明江反诬陷东方靖琪为真凶，并一心想让东方靖琪坐实罪名。杜明海找来杜明溪，嘱托杜明溪一定要照看好杜远山。

肖若云因爱生恨，提出只要杜明海肯娶她，她才肯救东方靖琪，走投无路的杜明海尽管痛苦但仍咬牙答应了婚事。肖若云找肖金水闹着要和杜明海结婚并要求释放东方靖琪，肖金水被逼无奈，答应饶杜明海不死。肖金水为了肖若云下半辈子的幸福，将肖若云明嫁杜明海，暗配杜明江。肖金水以枪毙杜明海为要挟，再给东方靖琪一次机会，做他的四姨太，东方靖琪思考再三，决定答应肖金水，但她内心已决定，待救出杜明海，她将在婚礼当晚自尽。狱中，东方靖琪偶然间扣动墙壁，杜明海扣墙回应间二人逐渐确认就是彼此，二人虽然不能对话，却从此后通过扣墙来传递彼此平安的消息。马致远瞒着父亲找肖金水贿赂解救东方靖琪。肖金水嫌钱少，反而给他了一块大洋做礼金，令马致远受辱。

马致远怕东方靖琪受伤，扛起东方靖琪奔出杜家。马致远当场求婚，东方靖琪苦笑称，经此生死一劫，她已看开，她知道肖若云是真的对杜明海好，只求杜明海过得好。其实东方靖琪却心中难以释怀，暴雨后发起高烧，胡话连连，马致远心疼不已。肖若云第二天才发现新郎竟然是杜明江，赌气扇了杜明江耳光当场毁婚。跑回娘家质问，肖金水称自己所做一切都是为了肖若云好，认为嫁给杜明江远比嫁给屡惹祸端的庶子杜明海划得来，软硬兼施平息了肖若云的怒火。追随而来的杜明江则当场下跪发誓，称一生都会好好对待肖若云。

肖若云仍不甘心，找杜明海喝酒聊天，对杜明海再次表白情意并怂恿私奔，杜明江心生妒忌一路尾随。杜明海感谢其救自己出狱，但称心中只有东方靖琪，希望肖若云好好珍惜自己的婚姻。杜明江跑回祠堂愤怒不已，当着祖宗的牌位决心教训肖若云。肖金水准备去杜府看望肖若云同时向杜家要杜明海打伤警察的医药费，杜明江被突然到访的肖金水一通明敲暗打，再也不敢生心教育肖若云。东方靖琪眼见杜家在杜明江和何家宝管理下一片混乱，连孤儿院也因生活费被随意挪用而断粮，东方靖琪将身上仅有的两块大洋拿出给孤儿院买粮食。杜明江给肖金水送去医药费同时多给两百大洋的好处费。杜明江此时却认为杜家产业尽在掌握一心想要扩张，以肖若云和肚子里的孩子为由想要得到码头的经营权。早已对马致远心生不满的肖金水欣然同意，让杜明江尽管放手去干。

马万年知道杜家银库空虚，孤注一掷，故意提高收药价格，导致药价暴涨，引起恶性竞争。 东方靖琪听闻此事，大吃一惊，赶忙找马致远了解此事，恐双方两败俱伤，登门劝阻马万年收手。杜明江见药材源源不断被马家收购，急于和马万年拼抢收药，却因银库空虚，无奈命何家宝将杜家房契抵押给大银行，双方展开竞价，激烈竞争。马万年老奸巨猾，表面答应收手，却算准杜明江性格好胜，指使磐安药商金老板出面，将自己此前收购的药物向杜明江倾销，杜明江不明真相大量购进，却被金老板骗去了巨额定金，再找金老板时，金老板早已逃之夭夭。

杜明溪好心熬了黑鱼汤给旧伤未愈的马致远，却因马致远罹患蛇串疮，被明白药理的东方靖琪阻止。不明真相的杜明溪吃醋迁怒东方靖琪和马致远。肖金水因为上头规定的乱党名额而发愁，肖若云献计让其重金悬赏，得到肖金水的肯定。杜明溪气汹汹的回到杜府，碰到的肖若云，向肖若云取经让马致远忘不了自己。肖若云称，你要想让他记得你，首先你就得让他忘不了你，哪怕是恨你也行。因误信误肖若云的玩笑话，杜明溪跑到警察局举报马致远是乱党，马致远总和一些不三不四的人来往。警察局长肖金水早有意吞并马家财产，将计就计，诬陷马致远为乱党，以“清党”为名抓捕了马致远。

马致远被释回家，知道详情后欲找肖金水报仇。东方靖琪拼死拦下，告诉他一定要为了马老爷保全自己的性命，让马老爷入土为安。东方靖琪陪马致远守灵，心中却内疚万分，怪自己竟没有意识到马万年反常找自己喝酒是告别尘世的最后晚餐。心中忏悔的杜明溪愧疚难言，长跪不起披麻戴孝，一步一磕头送马万年入葬。埋葬父亲后马致远决定手刃仇人远走他乡，谁知肖金水早有准备，多亏冯铁头阻止，马致远侥幸逃命，却因不甘心趁天黑将马万年从肖金水处买来的玉屏风上写上“肖金水粉身碎骨”鲜红的大字，放在了肖金水的大门前，令肖金水胆寒。

因当年斯雅贞之父救过杜远山一命，且和杜远山义结金兰，二太太决定遵守当初约定以不被人们所耻笑，肖若云劝说杜明海让东方靖琪做小，斯雅贞做大。东方靖琪盘问中察觉不对，却一时难以确定。杜明海抗命，欲带东方靖琪离开杜家，大太太借题发挥称若杜明海不讲信义，按家规可以令其和二太太净身出户。二太太称若不认下斯雅贞，杜家就会被暨阳人戳断脊梁骨。二太太以死想逼让杜明海认下斯雅贞，杜明海仍倔犟不肯屈从。而此时斯雅贞也跪下表示愿意让位做丫鬟，希望不要把她赶出杜家。斯雅贞体弱多病，因久跪突然晕厥，反是东方靖琪救回她的一条命。肖若云唯恐事情生变，拿出肖金水的洋酒，与杜明海打赌，杜明海不信一瓶洋酒能放倒自己，结果烂醉如泥。肖若云将杜明海扶到斯姑娘房中，以试药为名骗斯姑娘服下春药。

杜明海拽着东方靖琪上了一条货船，强迫船家开船，船老大不允起了冲突。冲突中碰倒了船上的货物。木箱倒下摔散，包装内有小包烟土样东西露出。岸上巡警冯铁头发现杜明海在船紧张追来，举枪逼杜明海下船。因巡警的行为，东方靖琪对船上货物生疑，闻出气味，疑似烟土。两人决定暂时放弃出走，先调查此事。此时李歪脖跑来说有要事报告，他发现杜明江在开发的新型药膏实际上很可能是福寿膏。东方靖琪和明海均大吃一惊，东方靖琪立即联想起船上货物，知道贩卖生产大烟按民国典律是死罪，让李歪脖去找石友琴帮忙，两人匆匆赶回。原来，肖金水看上烟土生意，授意杜明江在远山药厂生产大烟“福寿膏”，且把杜明海和东方靖琪都蒙在鼓里。

东方靖琪劝杜明海娶了斯姑娘，杜明海失魂落魄地回到杜府，看到杜府到处张贴着大红的喜字，他觉得分外刺眼扎心，他愤怒地砸碎了院子里的酒坛。肖若云看到他痛苦煎熬的样子内心突然愧疚起来，她去找肖金水倾述，称她开始后悔不该找人假扮斯雅贞破坏杜明海结婚。肖金水却劝她不要半途而废。按照杜家的传统，杜明海和斯雅贞的婚礼由大管家证婚。东方靖琪克制着内心巨大的悲痛履行着大管家的职责，杜明海的眼神始终没有离开过东方靖琪。次日二姨娘突然到东方靖琪房间，她知道东方靖琪受的委屈，她感谢东方靖琪顾全大局做出的牺牲。二姨娘无不惋惜地称，实在想不通斯雅贞为什么正好在婚礼前出现，而且现在的斯雅贞与幼时的斯雅贞完全不一样。二姨娘走后东方靖琪回想这些话顿时起了疑心。东方靖琪故意去找斯雅贞，此时她正在肖若云那里。东方靖琪问了一些关于济南的常识，结果马上判断出斯雅贞根本就是假冒的。那一刻东方靖琪感到巨大的悲痛和被欺骗毁掉婚姻的愤怒，她愤然地要报官。可后来经过她冷静下来的思考后，她决定还是顾全杜家名义隐瞒下来。

肖金水接到属下汇报称，石友琴焚烧了他们所有烟土。肖金水血本无归，他愤然地告诉杜明江，这一切都是拜东方靖琪所赐，他要想办法除掉东方靖琪。东方靖琪茫然不知。这天在孤儿院她无意间听到院里老人说到杜明江是杜远山从安庆拾回来的孤儿，东方靖琪闻言大惊，她推算着杜明江的岁数，又找了二姨娘核实。东方靖琪心中有了怀疑。东方靖琪离开不久，杜明海就从歪脖那里听说了何家宝行动诡异的事情，他们发现何家宝暗藏烟土在药箱的事，杜明海大惊，他马不停蹄地追赶东方靖琪。然而还是晚了一步，设卡缉毒的冯铁头在东方靖琪的药箱里找到烟土。杜明海想把过错揽到自己身上，冯铁头不由分说地带走东方靖琪。东方靖琪让杜明海赶紧去找县长。然而县长却不再相信杜明海，他根本不给他喊冤的机会。东方靖琪再次被肖金水打入死牢。杜明海带着一帮兄弟和工人到警察局门口示威，为东方靖琪喊冤，要求释放东方靖琪。晚上杜明海等在醉红楼外，骄傲的杜明海放下身段卑躬屈膝地哀求肖金水放了东方靖琪。

杜明海走投无路绝望之时走进了铜锣寨。石友琴得知他想劫法场救东方靖琪的打算后提出，当日自己是替他做了大当家，现在除非他就任大当家才能号令众兄弟，不然他们不会听命于他。杜明海万般无奈之下坐上了大当家的座椅。次日东方靖琪被五花大绑至刑场执行枪决，肖金水和督斩的省政府官员在座。周山口突然闯进刑场，他怒斥肖金水言而无信，肖金水却厚颜无耻地不承认。周山口痛心地走到东方靖琪面前掏出戒指向她求婚，东方靖琪仍然拒绝了。周山口这时焦急地问她神农药典的事，他说自己可以帮她把药典里的药方做成成药惠济百姓。东方靖琪不解他是如何得知这本书，她告诉周山口书不在自己身上，在杜远山那里。此时肖金水为防止异动已经将警察们埋伏在通往刑场的几处街道。果然，杜明海和石友琴带着铜锣寨的土匪们从几处街道朝刑场汇聚。警察发现他们马上开火阻止，双方展开剧烈枪战。就在东方靖琪在刑场千钧一发之际，马致远带兵赶到。他现在已经是国军营长，他带着一个营的兵力包围了刑场。

马致远接管了警察局，他再次回到这里看着物是人非，想到过往经历的巨变他百感交集。东方靖琪前去警局见马致远，马致远深情表白她希望她嫁给自己。东方靖琪谢绝了他的好意，她说自己心里只有杜明海。东方靖琪问到对杜明江的处罚，一向刚正不阿嫉恶如仇的马致远告诉她，死刑令已经签发，杜明江三日后执行死刑。肖若云当天买了烧酒和烤鸭赶往铜锣寨。杜明江的死她一点也伤心，她找到杜明海后吵嚷着自己成了寡妇，三年后就可以成为铜锣寨当家夫人。杜明海冷冷地呵斥她，驱赶她离开。肖若云却死皮赖脸撒泼打滚地坚持要留下来。杜明江刚死不久，一帮百姓拿着棍棒就冲到杜府，他们吵嚷着逼着杜府交出土匪头子杜明海偿命。因为当日他带土匪劫法场激战时误伤了许多百姓，许多家被害的家破人亡。杜府仆人长寿急忙把此事禀告了杜远山，此时的杜远山身体状况恶化已病体恹恹，他让长寿赶紧去把东方靖琪叫回来处理。东方靖琪得信后急忙赶回来，她苦口婆心地劝说激愤的百姓，并表示愿意承担抚恤金。

马致远来到杜远山的灵堂吊孝。东方靖琪操持着杜家大大小小的事情，这天仆人慌慌张张地跑来告诉她，斯雅贞摔倒动了胎气孩子早产了。东方靖琪急忙赶到斯雅贞卧房，此时斯雅贞因为难产痛得死去活来。她哀求东方靖琪一定要保住孩子。斯雅贞最终生下一个男孩。可她因为大出血已经油尽灯枯。弥留之际她希望东方靖琪不要恨自己，哀求她好好待自己的孩子。东方靖琪郑重地答应了。由于马致远一直坚持剿匪，杜明海在铜锣寨根本不敢下山，但他也将铜锣寨防守的固若金汤，马致远多次攻打都无功而返。就这么过去了两年。这天东方靖琪想到斯雅贞留下的孩子长顺长到两岁都没有见过亲生父亲，再加上她对杜明海的思念，她准备带长顺去看看杜明海。东方靖琪盘亘数日后准备离开，肖若云也想就这个机会带小海去城里看看。于是她们抱着孩子下山，杜明海将她们送到山下默默地看她们离开。此时马致远见机会难得，他一声令下，警察们很快与杜明海等土匪枪战起来。在东方靖琪凄厉的大叫声中，马致远的子弹打中了杜明海的胸膛。

杜明海死后，肖若云消沉痛苦地整日以泪洗面借酒消愁，东方靖琪找到她和她推心置腹地谈心，谈她们俩都深爱的那个男人杜明海。两人抱头痛哭同病相怜冰释前嫌。不久东方靖琪将肖若云带到一家茶楼，她让肖若云做茶楼大掌柜。肖若云不解，东方靖琪告诉她，杜明海过去有个愿望就是开一间大茶楼，她要帮他办到。肖若云感激地看着东方靖琪。很快便到了1940年，日军大肆侵华，这一年暨阳也岌岌可危。这天一帮从前线下来的国军残兵败将进入暨阳城，为首的是一个姓吴的排长，他瘸着腿突然看到惠民医院，他惊喜地冲进医院。吴排长推搡开看病的百姓，叫嚣着让陈医生为自己治腿。陈医生为难地告诉他，因为打仗医院麻药运不进来，无法为他手术。吴排长怒火中烧，指使手下的士兵抢劫医院钱财。这时东方靖琪得到通知赶到，她提出用针灸为他止痛然后给他伤腿做手术。东方靖琪严肃地告诉他，他的腿必须马上手术，不然有性命之忧。东方靖琪和陈医生配合最终为吴排长做了手术，吴排长对东方靖琪感激涕零。

东方靖琪、肖若云和马致远奋力抗击日军，但寡不敌众再加上武器远没有日军的精良，很快他们便损失惨重。马致远让肖若云和东方靖琪的卫生队撤出阵地，马致远眼见暨阳城守不住了，二零六团因为遭遇日军无法赶过来增援，马致远等人成了孤军奋战。马致远眼看日军包围过来，他劝东方靖琪离开城楼，东方靖琪却不愿偷生，她坚持和马致远一起撤离。马致远无法，只好打晕她，然后用阵亡战士的尸体掩盖在她身上。日军控制了暨阳县，他们把全城百姓集中训话，日军宣布由他们统治暨阳城，为此他们选了一个暨阳新的大队长。当日军把新的大队长介绍给百姓时，杜家所有人都震惊地目瞪口呆，这个大队长赫然竟是杜明江。杜明江振振有词地要暨阳百姓都要听从日军统治，肖若云却暗骂他就是汉奸。杜明江放出何家宝让他做了自己副官，原本如丧家之犬的何家宝再一次耀武扬威起来。杜明江到远山药厂找东方靖琪，他得意地告诉她从今后他们的好日子就来了。东方靖琪冷冷地告诉他，自己不认他这个当汉奸的哥哥。

杜明江劝说马致远投降日军，马致远倔强地不愿做汉奸。杜明江悄悄说服他留得青山在不怕没柴烧，谁知马致远却固执己见不愿投降。这时日军军官秋田命令手下仓桥将马致远手下兄弟一个个砍头，他要让马致远亲眼目睹他誓死保护的兄弟一个个死在他面前。就在仓桥高举配刀要砍马致远副官三金的头颅时，马致远流着泪阻止了仓桥，他答应为了兄弟忍辱偷生。几年杳无音讯的杜明溪突然回来见东方靖琪，东方靖琪看到她百感交集。杜明溪变得成熟干练了许多。她告诉东方靖琪自己现在是新四军的指导员，她这次回来就是为了给新四军找红伤药，她希望东方靖琪能帮助自己。东方靖琪非常爽快地答应了杜明溪。秋田让杜明江带自己去见东方靖琪，他要亲自找东方靖琪谈一谈。很快秋田带着杜明江和一干日军冲进杜府。东方靖琪在肖若云茶楼内室见到杜明溪，东方靖琪交给她一些红伤药。这时只听到茶楼下吵嚷声，杜明江带着皇协军来到茶楼。

仓桥问杜明江关于维持会长的事东方靖琪考虑的如何，杜明江只好掩饰称她还没有想好。仓桥大怒，以清查反日分子的名义将孤儿院的孩子和远山药厂的工人都抓了起来。东方靖琪愤怒地让秋田有什么事冲自己来，秋田知道东方靖琪的软肋，他枪杀了孤儿院老刘，还准备杀了药厂所有工人，东方靖琪被迫答应就任维持会长和为日本人做红伤药。这天晚上杜明江喝的醉醺醺地搂着两个妓女走进肖若云的茶楼，他原本想刺激肖若云，还扬言要给肖若云写休书。肖若云毫不在乎地称，自己根本没把他当自己男人，她说杜明海才是自己男人。周山口拿出一本药典送给东方靖琪，她看到这本几乎失传的药典又惊又喜，对周山口十分感激。这时周山口提出想带她离开，让她跟自己离开开始新的生活。东方靖琪感谢他的好意，却称自己现在还有一个身份是维持会会长，她没有办法离开。秋田办公室，周山口突然拜访他。原来周山口竟是秋田外甥，他是个地地道道的日本人。

杜明江气势汹汹地要往药厂里面闯，东方靖琪突然拿出一个委托书，委托书明明确确规定远山药厂是日军药品专供基地，除了日本人任何人不得擅自进入。原来这是周山口借口保护药厂特意说服东方靖琪而立下的委任状。杜明江看到委任状只好灰溜溜地离开。东方靖琪担心杜明江会杀个回马枪，她忧心忡忡。这时杜明江就此事向秋田做了汇报，他希望秋田支持他搜查药厂。秋田答应授权给他。杜明江拿着授权再次返回药厂搜查，结果遍寻两三遍后他们一无所获。杜明江不死心，经过自己观察他在仓库找到一处地下密道，然而密道仍然没有找到人。杜明江无功而返，仓桥勃然大怒狠狠地扇了他一耳光。东方靖琪把躲在办公室里的杜明溪放了出来。她把药厂所有的红伤药送给杜明溪，并嘱咐她利用晚上时间偷偷出城。肖若云按照东方靖琪的计策故意神神秘秘地从东城门运送药物。杜明江果然上当，他带着所有人盘查了肖若云，待发现肖若云并没有什么问题后，他突然警觉自己中了调虎离山之计，他赶紧带人往城西赶去。杜明溪和马致远进行了一次深谈，两人为了保家卫国的民族大义尽释前嫌握手言和。

三天期限到后，东方靖琪把做好的红伤药准备交给秋田。秋田要东方靖琪交出神农药典，东方靖琪早就猜到日本人会出尔反尔，她突然露出药车上的炸药，她逼迫秋田马上交换被关押的孤儿院孩子，不然她就炸了这些药。秋田权衡利弊后只好同意。周山口让东方靖琪跟自己去药厂，路上他们遇到一路日军追杀一个受伤的男人。东方靖琪救下此人并把他带到茶楼。在茶楼此人告诉她，他是从东白山下来的新四军阿祥，他从杜明溪那里听说过东方靖琪的名字，这一次他是专门下山采购粮食的。就在他们谈话时，周山口悄悄接近房间躲在暗处想偷听他们的谈话。肖若云悄悄告诉东方靖琪，东白山来人约好次日十二点在茶楼和她见面。次日东白山来人见面时肖若云在楼下望风，她让东方靖琪去包间见接头人。东方靖琪推开包间的门，接头人回过头，东方靖琪震惊地呆立原地，来人竟然是杜明海。杜明海告诉东方靖琪，他受伤后被游击队救起，然后他和游击队一起去了苏北。现在他要就任东白山的大队长，这一次他就是专门来找东方靖琪为东白山弄红伤药。

周山口顺利把药和粮食送到了东白山，杜明溪十分不解以东方靖琪的谨慎为什么会轻易相信周山口。她还是谨慎地将周山口蒙着眼接上山和送下山。东方靖琪告诉周山口自己决定次日就把红伤药的配方告诉他。周山口心中暗喜。周山口向秋田汇报后，秋田让他不要亲自去花明泉村，以免双方动手起来误伤了他。送药那天周山口谎称拉肚子不能亲自去，东方靖琪便委托肖若云和长寿带人送药。此时杜明江按照秋田指示埋伏在花明泉村。肖若云和长寿久等杜明溪不来接头便进村找她，见到杜明溪后长寿无意间提到前一次送药过来的阿祥。杜明溪很吃惊，因为他们根本不认识叫阿祥的人。再仔细分析后，杜明溪断定周山口是个奸细，众人大惊。时长寿提到屋外送药一起过来的还有四个弟兄，杜明溪让他把那几个人叫过来。然而就在长寿叫那四人时，何家宝突然开枪打中那四个人，一时间双方交起火来。何家宝押着长寿撤退，肖若云死在杜明海怀里。

杜明海问到东方靖琪跟自己离开考虑的如何，东方靖琪顾及药厂、孤儿院和杜家还有那么多人她不能说走就走，她还要再考虑考虑。仓桥向秋田汇报运到前线的红伤药没有一点疗效，秋田勃然大怒。周山口明明掌握了红伤药所有工序，秋田顿时明白东方靖琪从中做了手脚。靖琪告诉周山口药典藏在晋安九峰山悬空寺里。周山口按捺不住心中的狂喜忙不迭地答应帮忙取书。靖琪从杜家祠堂里取出藏在这里的神农药典。她跪在杜远山灵位前焚烧了药典，她说自己已经把书籍里的内容全部记在脑海里，书籍不能落入日本人手里。此时在杜家念经的大太太早就心灰意冷，所以在蜡烛倒塌点燃佛堂帷幔时她葬身火海。紧接着马致远点燃炸药，远山药厂在爆炸声中被夷为平地。东方靖琪让杜明溪带着孤儿院孩子离开，她坚持要回去找杜明海。半路上周山口突然拦住东方靖琪，靖琪却乘其不备突然掏枪打死了他。此时杜明海带着新四军与秋田展开激烈枪战，枪战中杜明江和何家宝双双被打死结束了他们罪恶耻辱的一生。然而在最后的肉搏战时，杜明海打死了秋田却被两个背后偷袭的日军用刺刀刺透胸膛。