民国24年春，南浔富商颜书鸿的府门前宾客如云，原来这天是他50岁的寿诞。来贺寿的颜家世交艾重远本与颜家约定，将女儿艾灵慧嫁进颜府做长房媳妇。不料灵慧却当着颜书鸿的面拒绝了这门亲事，令颜书鸿心中十分不快。

颜书鸿一死，三房太太悲切之余却各怀心事。三姨太忽想起，老爷临走没有交代颜家一件最为贵重的物件，祖上遗传的一片金柬。于是，三个女人一同来到老爷书房寻找金柬，可是眼前的景象使她们吓了一大跳，老爷的书房早已被翻得乱七八糟。经不住三房太太的盘问，管家潘伯只得告诉她们金柬藏在老爷身上。

镇上名医范郎中向大家证实了老爷不死的秘密，原来在寿诞之日停电的时候，有人可能在颜书鸿的酒中下了一颗叫做“还魂散”的毒药，正是这粒毒药使老爷在鬼门关上走了一圈。唯有老爷知道，与颜家有世代仇怨的韦家后人可能给自己下了毒。原来，清朝康熙年间，南浔韦氏家族有个瞎子文人突萌发修正明史的念头，不料，明史修罢却惹怒清廷。

正清和云儿一见倾心，而云儿就像是老天派来的仙女一样，抓住了正清的心。一向缺乏关爱的正清，第一次感受到一份久违的真情，他做梦都想娶云儿做自己的结发妻子。颜府里三房太太都隐约知道金片与藏书楼密切相关，一面希望老爷能够说出颜家金片的下落，一面又怕惹恼了老爷，老爷收回成命把已分配好的遗产再收回去。但在鬼门关上走过一回的颜书鸿这次却格外开恩，承诺自己坚守男人信念，视诚信为自己的座右铭，所分配之遗产再不收回。

正清告诉父亲自己要娶外乡人云儿做妻子，使颜书鸿十分吃惊，遂对云儿的来历产生了怀疑，便要儿子带云儿来府。正清急切地带着云儿走进颜府，当老爷颜书鸿那双鹰一样的眼睛在云儿的身上扫来扫去时，云儿只觉得心脏像被剑刺破了一般。于是，云儿的回答漏洞百出，尽管一旁的四姨太极力地为云儿说着好话，但是颜书鸿依然觉得云儿来着不善，下决心要铲除她。

颜书鸿不动声色把藏书楼的一切典故都告诉了儿子，希望他从此能够替自己看护好藏书楼。当太阳升起的时候，正清打开藏书楼的窗户，阳光似乎照耀着300年来的历史，让一切不再那么血腥，让一切都恢复到应该有平静、祥和中。他似乎也感受到了300年前的藏书楼的真正内涵，不知不觉中，他已经把自己的命运和藏书楼联系在一起。

艾家母女此刻已方寸大乱，只能求助与颜书鸿。表面上，颜家大发善心，实际上颜书鸿对于艾夫人的求助早有所料。于是，颜书鸿亲赴湖州与绑匪面谈，并支付了一半赎金，这令艾家母女十分感激。谁都不知道，这一切都是颜书鸿和四姨太单卿精心设下的一场局，为的就是要把灵慧娶进颜府，而灵慧身后的嫁妆才是颜书鸿志在必得之物。

可是不爱正清的灵慧嫁入颜府，却早已想好要为简思翰徇情，于是在新婚之夜选择自杀。灵慧的不断寻死把颜府闹的是鸡飞狗跳，三房太天埋怨不断，也使正清手忙脚乱，更使颜书鸿十分恼火。艾夫人含泪劝阻女儿不能再寻死，毕竟她的父亲艾重远还在绑匪手上，艾家还得指望颜家支付另一半的赎金。见灵慧还不死心，艾夫人只得拿出了简家实现备好的简家毁约的信件，迫使灵慧终于明白不能再闹。

颜书鸿自以为正清接下藏书楼，又娶了可心的灵慧，从今往后就可安心立命。可是正清却执着地希望父亲答应自己休了灵慧，其实是想给灵慧一份自由身，于是在大雨天跪请父亲答应休灵慧，这使颜书鸿十分恼怒。灵慧终被正清的善良感动，心中开始惦念起住在藏书楼的正清。而正清似乎依然不能接受自己。正清、灵慧苦苦地折磨着对方，而三房太太都还没有忘记金片的存在。

正清受伤令妻子灵慧十分心疼，也十分挂念。四姨太先是花解了绣花鞋的危机，近而有意告诉灵慧，正清喜欢的人叫云儿。只有把正清拉出藏书楼，才能博得他的一颗真心。灵慧几乎已经不能再忍受下去了，遂在藏书楼门口大声告诉正清，他再不出来，自己就离开颜家。河边，正清向灵慧打开心扉，两个苦命的年轻人，决定忘却过去。

就在众人都认为无望之时，离家很久的正明突然一身军装回到了府里，令三姨太看到一线希望。老爷感到左右为难，遂把处置三姨太的权利交由长子正清处置，善良的正清原谅了三姨太，使回家的三少爷感到了久违的亲情。

来敲诈的人叫韩哥，他使四姨太如坐针毡。原来，当初正是韩哥帮助四姨太把假死的云儿带出南浔，而以后又设计绑架了艾重远。四姨太怕韩哥最终会暴露自己，而府里闹鬼之事沸沸扬扬，正清也早已怀疑到玄儿，于是四姨太决定杀掉韩哥来化解这些危机。果然，来拿钱的韩哥被巡夜的正清和水生误杀，所有人都认为这个人就是一直光顾藏书楼的贼，只有正清知道他不是。

到底是否有韦家人在颜府，这个秘密多少年来缠绕着颜家人，只要被怀疑就会被颜家人秘密处决掉，正清的母亲就因当年受到怀疑无法说明白还含冤自尽，这个痛楚一直捆扰着正清，而正明的新婚妻子就太像当年被处死的韦家后人云儿。正清担心着他们，不想新婚的正明带着妻子若云很快就回来了。

每一个关心藏书楼的人都在关心着金片，根本原因就是因为都知道了藏书楼里有万卷金书的秘密。三房太太都坐不住了，都提出要进藏书楼查看，老爷把这难题又交给了正清，不料，正清还真就打开了藏书楼。让一直向往藏书楼的正白进去寻找，当然最后是什么也没有找到。

谁也没想到，思翰提着一箱子钞票来到南浔颜家，声言要赎了灵慧。这使颜书鸿十分恼火，把思翰赶出府去。正清和灵慧因为思翰的到来，引发了情感纠葛，但是正直的正清反而再次赢得了灵慧的真爱，灵慧终于告诉正清自己怀孕了。老爷十分高兴，但四姨太惟恐灵慧诞下颜家长房孙子，延续颜家香火，将来的楼主还是正清的孩子，于是授意玄儿在楼梯上泼上豆油，使灵慧摔交小产了。

老爷原谅了若云，却故意把四姨太留下，要她把藏书楼的故事讲给若云听，其实老爷就是要所有想打藏书楼主意的人知道，谁也不会轻易得手。若云回来正白担心，因为当初就是自己绑架了若云，但奇怪的是若云没有向老爷告发他和潘伯，这令他很心经肉跳。

离开南浔的灵慧一路上劝解着思翰，而船到东塘镇，船主说什么也不肯走，而思翰声言还是要去步金寺当和尚，除非灵慧能够真的说服自己，俩人只能留宿东塘。夜半，思翰情急之下说出已将金片交付颜书鸿来换灵慧，使灵慧大吃一惊，这时思翰已经顾不得许多，欲对灵慧强行非礼，灵慧表示自己忠贞于丈夫。被逼无奈中，灵慧只得推开窗户就跳进了河里。

若云非常同情失去灵慧的正清，但正清并没有因为情感的纠葛忘却自己的楼主的职责。当若云试图说服正清忘却仇恨，也能够叫自己进藏书楼时，正清却义正词严地拒绝了她。若云明白今天的正清已不是当年哪个懦弱的少年，而自己已经爱上正明，已经是颜家名正言顺的少奶奶，他们的内心都经历着一份不平静。

灵慧和思翰已经说服了对方，都愿意重新开始自己的新的生活，便决定离开东塘镇，但是一拨神秘的人已经赶到了东塘镇。有杀手潜入小旅店，准备要杀灵慧。但杀手却误伤了老板娘，也惊动了镇上警察，思翰、灵慧虽不知道到底什么人要杀他们，但已感受到了危机。于是，俩人匆忙离开东塘镇，各自回到家中。

颜书鸿拒绝把简家金片交还给思翰，令思翰心灰意冷中回到简家老宅。思翰走后，一伙神秘之人却潜入颜府，用枪威逼颜家男人交出金片，并当面打死了下人阿英。危机时刻玄儿逃出府去，叫来警察，才吓走了那伙强盗。

谁都没想到，正清手捧金片，来到了简家老宅，亲手把金片交还了思翰，思翰被正清的义举再次感动，连夜带金片赶回上海。颜书鸿费劲心思得来的金片，被儿子正清轻易交出，简直气急败坏，于是动用家法惩罚正清。当板子一下下抽在正清的身上，却同时疼在了爱他的灵慧心里。而四姨太知道，这个当年懦弱的大少爷已经成长为一个坚强、有骨气、有主见的男人了。

政府要员查询到资料，终于满意地走了，谁都以为老爷该安心了，但颜书鸿并没有放弃对简家金片的追夺。真叫是天注定，简洹章一心要在股市上翻本，于是打算将金片抵押出去，筹备更多的资金来翻本，但是恰就将金片抵押到了颜书鸿的门下。当张经理来报时，颜书鸿知道金片即将失而复得，心中大喜。

单卿知道自己终将一死，想不到灵慧来告诉她，正清要在祠堂见她。祠堂里，正清的话感化了单卿，单卿终于承认自己是韦家后人，却也感念8年来在颜府已经将自己感化成了一个颜家的女人，想不到正白早就拉着父亲隐蔽在此，现在他逼着父亲处决四姨太。

上海被日军占领了，简洹章一家欲举家迁回南浔，可是简夫人却病死在家中，临终也希望简家父子能够要回属于简家的金片，简洹章和儿子女儿十分难过，简洹章明知要回金片并无大用，但心中一口恶气难下，决定和颜家斗到底。

三兄弟为藏书楼的命运发生了激烈争执，正明和正白为此拔枪相向。兄弟情分似乎蚕食已尽，使正清剩感悲哀。正明逼迫大哥同意自己运书，但是公路上的卡车最终还是被炸毁了，唯一的希望失去了，正明只能选择留下来，再找机会运书，无论如何也决不把书留给日本人。但正明没有说破正白老师的真正意图，还是给二哥留下了一份亲情。

若云怀孕了，她决定生下这个孩子，但慈云师太要她想明白这个孩子的身份，同时拒绝了若云关于要求告诉金片上内容的秘密。但她没想到，正白跟踪了她的行踪，警告她不打藏书楼的主意，但是正白也知道，要找到万卷金书必须翻出三片金片上的内容，而这个只有韦家人能够看得懂，正白威逼利诱若云，但若云丝毫不为所动，使正白气急败坏。

简洹章的秘书带人绑架了张经理，而简洹章突然发现自己可能被人利用。但是已经来不及了，秘书告诉他，金片维新政府里也有人想要，简洹章只能走一步看一步了。76号的人逼进颜家，并带来张经理对质，并当着颜家人的面杀了张经理。妄图抢到金片，但是正白、正明两兄弟联手赶走了他们。

正清喝下若云敬的酒就中毒而亡了，正白愤怒之极，一定要将若云给大哥陪葬，正明见此景无话可说，即使三姨太求情也无用。祠堂里等死的若云与灵慧终于打开心扉，若云终于说出自己给正清下毒是被逼无奈，为保藏书楼她必须这么做。若云的身上还带着解药，虽然正白不相信，但也只好将计就计，但依然警告若云不要再动藏书楼的心思。