明朝中叶，太子、瑞王与明月峡三股势力并存。锦衣卫、东厂拥护瑞王独揽大权，武当派拥护太子，明月峡则神秘莫测。太子武师孟灿与筹集到的五十万两被东厂劫走，武当四侠下山营救。东厂厂公金独异设计，练霓裳为夺银两中计，与跟踪而来的卓一航一起掉入山底水中。卓一航为救练霓裳给她做人工呼吸，两人情愫渐生。金千岩设计，玉罗刹劫走银两发现是假的，武当四侠击退金千岩，玉罗刹将他救走夺得银票并将其杀害。

武当四侠被误会是杀害锦衣卫一行人的凶手，被关了起来。练霓裳知道后冒充凌慕华出面澄清，锦衣卫岳鸣珂闯明月峡求证实。明月峡被设计，众多弟子中毒，岳鸣珂指出解救办法是蟾蜍草，一部分人在找寻解药的过程中中了金独异的圈套。何萼华和耿绍南去明月峡打探情况，耿绍南被抓。

卓一航带师兄妹三人前往明月峡营救大师兄，为了保护师兄安全离开明月峡，卓一航独自一人引开追兵，途中遇见少主，两人联手对抗金独异，在逃跑途中不幸落入陷阱，卓一航教授两仪剑法给少主，两人联手逃离陷阱，打退金独异。

金独异夜袭明月峡，卓一航发现东厂的人想用炸药来夜袭明月峡，中途帮了明月下一把，消灭了东厂的人，这样明月峡才得以安全。岳鸣珂追踪金独异，两人在湖边开战，此时，练霓裳出现重创金独异，也中了金独异的毒镖。在水洞修炼的练霓裳碰见卓一航，两人一起去了闹市，看到五十万两已经到达百姓手中，赶上镇中泼水节，两人戏水，玩得很开心。练霓裳决定去找师叔铁飞龙解毒。

练霓裳和白敏找到了做恶作剧的铁珊瑚，珊瑚问明来意，拉着霓裳赶紧到家去找父亲解毒。邵男中了毒后一直身体虚弱，稍有好转后回到武当，师傅看到邵男中毒很深，于是给他把脉，并问起师妹到底是怎么回事，何萼华如实说起。铁飞龙给霓裳把脉后告诉她，幸亏当时有人及时镇住了毒，不然就算是神仙也无药可治了。

练霓裳觉得事情蹊跷，于是还是决定返回铁家庄一探究竟。拿了密室要是之后，发现被关起来的是铁飞龙的孪生兄弟铁飞虎，飞虎说自己宁愿没有这个卑鄙无耻的哥哥。练霓裳告诉铁飞虎自己八岁跟着凌慕华，飞虎非常诧异，问她师傅教她的第一招武功是不是天山折梅手，霓裳否认，是梅花错。

练霓裳阻止了岳鸣珂与卓一航之间的争斗，与此同时，卓一航感觉到练霓裳的神秘。何萼华私闯明月峡聚会，被明月峡的人抓住，就在她被杀之际，卓一航赶到。卓一航一定要救师妹，甚至不顾自己的生死。耿绍南抓了穆九娘，企图用耿绍南误杀穆九娘交换何萼华。耿绍南与孟秋霞冲突之际，九娘上前阻止，不料被耿绍南用剑刺伤，伤重致死。九娘之死，加深了明月峡与武当派之间的恩怨。九娘临死之际劝练霓裳不要断送了自己的幸福。

铁飞龙杀死铁飞虎，他找到了自己与铁飞虎之间的差异，假扮铁飞虎，瞒过了练霓裳混入明月峡。明月峡的人抓到了铁珊瑚，铁珊瑚使计逃脱，不料未成功。铁飞龙投靠东厂，红花鬼母用毒控制了铁飞龙，为了保命，铁飞龙只得暗地顺从。练霓裳追杀铁飞龙，不料中了铁飞龙与金独异联手设下的圈套。双方焦灼之时，卓一航再一次出现救了练霓裳。

红花鬼母要属下查明耿绍南的下落，并且严密监视练霓裳和卓一航的下落。练霓裳知道属下来见自己，支开卓一航让他去为自己买糖葫芦。属下报告练霓裳红花鬼母抓了耿绍南约她见面，为了给九娘报仇，练霓裳和属下一起离开小屋去见红花鬼母。辛龙子也来告诉卓一航红花鬼母抓了耿绍南，卓一航急忙准备去救人。

孟秋霞将铁珊瑚用手铐铐了起来，并向书生解释，已她的狡诈，若不是这么做，肯定会被她溜走。这一举动反而让书生误解，认为明月峡确实为邪派，所做所谓也的确并不光明磊落。赶路途中秋霞将珊瑚拉至别处，拿着剑问她，红花鬼母为什么急着要抓珊瑚。铁珊瑚就是倔着不肯回答秋霞。

孟秋霞威胁铁珊瑚，若是不听话，就会落入红花鬼母的手中，但珊瑚并不吃她这一套，这时王照希过来提议为了不尽快被红花鬼母抓住，还是兵分两路逃走比较好，秋霞也正有此意，于是将他们二人锁在了一块儿，分开跑路。

一航独自伤心难过，掌门人看在眼里疼在心里，最终毅然离开，走之前被小师妹拦住，问一航究竟要去哪里，一航不想多做解释，只是说出去有事要办，等回来再向她说明。

卓一航出现在法场与霓裳深情对视，这时时辰已到，瑞王那边损伤惨重，落魄的瑞王继传东厂与锦衣卫，要求立刻把凶手找出来。这时金独异接到消息，立刻前往事发地点查看瑞王情况，将练霓裳再次压入大牢。

红花鬼母看出铁珊瑚一直在骗自己，但却不表露出来。鬼母得知锦衣卫也即将攻打明月峡，心生疑惑。正在琢磨之时，让何大人把铁珊瑚押进牢房，自己要写信给金独异。这时铁珊瑚给侍卫的双手都下了毒，趁机逃跑。

一航为大师兄的死感到非常痛心，于是去找练霓裳报仇。霓裳无可奈何，说九娘是自己唯一的亲人，所以自己必须杀了耿少南。于是一航问起练霓裳逃狱是杀的那些无辜的人，他们的命由谁来赔。霓裳此时也不想多做解释，说在别人眼中自己本来就是魔女，想杀谁就杀谁，拦也拦不住。

铁珊瑚她们意会过来偷剑谱的另有其人，于是她们去找王照希，怀疑是他拿了剑谱。但王照希矢口否认。一航关切地询问耿绍南的情况，耿绍南劝他回去，但是一航却说他还有些事情需要弄清楚。一航找到练霓裳，得知了事件的经过，他们互诉衷肠。

卓一航拿给练霓裳两根糖葫芦，没想到却化了，练霓裳却说跟他在一起，吃什么都是甜的。卓一航带着练霓裳来到了玉龙水洞，然后递给她一粒种子，还说了许多甜言蜜语，练霓裳听了十分感动。她也对一航说了很多心里话。卓一航当即向天地起誓，愿娶练霓裳为妻，练霓裳也回应了他。

铁珊瑚向练霓裳求情，说她是无辜的，卓一航也替她求情，练霓裳只得作罢。岳鸣珂找到红花鬼母，说瑞王让锦衣卫收回明月峡，让她不要不知好歹。卓一航为了救练霓裳而身受重伤，练霓裳十分伤心，但卓一航却不愿让她拿剑谱去换解药。

考虑到武当所面临的危机，卓一航决定暂时回武当，等到危机解除之后再带练霓裳归隐。卓一航、明月峡与卓一航的师叔相遇，师叔责备卓一航为一个魔女背叛武当。练霓裳上前争辩，与卓一航的师叔发生争执，打斗中练霓裳不幸受伤。卓一航最终决定回武当，在与师叔回归的途中，发现师叔中毒。原来是铁珊瑚暗中下毒。但武当弟子则以为是练霓裳下毒，发生误会。

慕容冲写信给练霓裳，要求杀铁飞龙的条件是玉罗刹灭了武当三老。练霓裳将计就计，用玉罗刹的名义给武当派下战帖，暗地里则只身一人前往武当，当面请求武当长老与明月峡联手。在卓一航的担保以及练霓裳的恳切请求下，武当掌门答应与明月峡联手对付慕容冲与金独异。

金独异与慕容冲攻打武当，武当弟子按照紫阳真人所交代的作战方案，分头攻打金独异与慕容冲。何萼华与耿少南负责对付慕容冲，两人的队伍受重创，何萼华也被慕容冲所抓，幸好练霓裳出手才得救。练霓裳将慕容冲引至逍遥谷，等候在那里的紫阳真人与慕容冲交手，在即将取得胜利之时，却被一蒙面人破坏，慕容冲逃脱。另一边，武当四弟子卓一航、耿少楠、何萼华、辛龙子一同对阵金独异，四人用四象剑阵将金独异打败。

紫阳真人将卓一航的真实身份告诉他，同时卓一航也得知了自己的父母是被练霓裳的师父凌慕华所杀。紫阳真人劝卓一航与练霓裳分开。一边是深爱的人，一边是杀父仇人的徒弟，卓一航陷入无尽的悲痛与挣扎中。

练霓裳病好后不明白为何武当追杀自己，于是举着剑问其中一个弟子，武当弟子如实相告，说练霓裳杀了武当很多人，并且连掌门都不放过。霓裳听到后大吃一惊。这时白石发现紫阳道长并非死于剑伤，而是死于剧毒，于是对黄叶起了疑心。

东厂将明月峡的老少妇孺全都杀尽，练霓裳回来后伤心至极，安排下属好好厚葬她们。铁飞虎和铁珊瑚从明月峡逃了出来，珊瑚看到叔叔一直抱着包裹不放，心里非常清楚，于是趁人不备抢了剑谱。这时红花鬼母突然追杀上来，逼珊瑚亲手杀了铁飞虎，带着剑谱一起离开。

练霓裳一个人孤单的走着，她内心深深的自责着，感觉自己对不起师傅，让明月峡就这么毁了。岳鸣珂看着练霓裳跪在那里，练霓裳察觉到身后有人，挥剑而去原来是岳鸣珂，她恨锦衣卫。掌门师伯的去世让卓一航内心煎熬，立誓要杀掉练霓裳，为师傅和死去的师兄弟报仇，但是那些心有不满的要求卓一航给他们一个交代。

卓一航与小师妹成亲，虽然小师妹内心知道他爱的是练霓裳根本就不是自己，但是还是愿意嫁给他。成亲当天大师兄看着心爱的小师妹就要嫁给卓一航心痛不已，却不能带走小师妹。没想到练霓裳却来到了武当阻止这场婚礼，卓一航说自己根本就没有爱过练霓裳，两人打了起来，卓一航一剑刺在练霓裳肩膀上，其实练霓裳的心更痛。

岳鸣珂为练霓裳疗伤，练霓裳情绪失控，将岳鸣珂误认为卓一航，并质问卓一航为何要欺骗自己。悲愤交加的练霓裳瞬间乌发变白发。何萼华的父亲身负重伤昏迷不醒。辛龙子责备卓一航的方法不仅没有伤害练霓裳，反而连累白石师叔，如今武当弟子更加慌乱。

江湖上关于白发魔女杀人的传闻不绝于耳。有人秘密通报慕容冲即将前来武当，卓一航认为此中有诈，嘱咐辛龙子无论消息真假都要小心谨慎。卓一航、辛子龙夜遇白发魔女，卓一航奇怪，因为总觉得此人背影十分熟悉。

红花鬼母的儿子不愧为武学奇才，不用学习任何门派的心法，就能将剑谱练透，铁珊瑚对此感到非常诧异，决定想办法从他下手。朱雀向练霓裳汇报自己已经打听到慕容冲的下落，他已经离开这里，往京城出发，练霓裳决定一切都按照原计划进行。

王照希发现了朱雀的端倪，质问她是否有事情瞒着自己，但朱雀依然遮遮掩掩，说希望能够相信自己。师兄弟三人在回武当的路上遇到了慕容冲，但人单力薄，再加上卓一航的武功已废，很快就寡不敌众。卓一航再次被慕容冲狠狠地打击，在落入悬崖的瞬间，白发魔女练霓裳拉住了他，令卓一航大吃一惊。

辛龙子开始发现大师兄的种种反常行为，通过前后联想分析，把卓一航推下山崖的人很有可能就是大师兄。想到这些的辛龙子无比心痛。大师兄将武当所有有关卓一航的东西都给清理掉了，何萼华问大师兄为什么这么做。

武当派，辛龙子与大师兄竞争练两仪剑法的机会。另一方面，霍彩蝶和卓一航在医书上找到了医治卓一航的方法，卓一航用心疗伤，一心想要走出谷底。

何萼华忧伤地吹着笛子，耿邵南来找她，质问她是不是还在思念卓一航。然后耿邵南向她表达了自己的爱意，但是何萼华并不接受，还说他变得让人不认识了。耿邵南很生气，他询问师父慕容冲寻找天狼剑谱的事，师父让他稍安勿躁。

凌慕华看到了天都留给她的书，书中说他一直努力为她寻找从走火入魔中解脱之法，最后终于练就了飞花逐蝶，凌慕华看了之后非常感动。朱雀的恩公找到她，希望她帮助他夺回天狼剑谱。还说事成之后放她自由。

凌慕华看到卓一航在房间里挂的铃铛，急忙问他到底跟练霓裳是什么关系。卓一航老实回答，若不是凌慕华杀了自己的父母，就可以跟练霓裳白头到老。这个回答让凌慕华大吃一惊。凌慕华回忆三年前自己被铁飞龙打下这个山谷，功力就一直未能恢复，没想到霓裳也步入自己的后尘，越加走火入魔。

师叔提醒邵南，眼下武当百废待兴，此时邵南也尚未上任武当掌门，做事不宜太过张扬。但邵南却不以为意，如果有一天自己能够统治天下，那么小师妹就是母仪天下的王后，置办一场得体的婚礼，张扬一点又怎样呢。况且自己也答应过师妹，如果有一天能跟她在一起，一定会把全天下最好的东西都给她。

红花鬼母死了以后公孙雷非常难过，慕容冲看到此番情景，于是收留了他，并且暗自庆幸，红花鬼母被练霓裳除掉了更好，这样公孙雷就能为自己所用。此时珊瑚也正在被剧毒所折磨着，浑身疼痛万分。这时岳鸣珂悄然进门，决定救珊瑚一起逃出去。

耿绍南独自练习天狼剑谱，武艺渐渐炉火纯青，仅仅炼成了一半，威力就如此强大，大师兄认为只要能完全炼成，练霓裳就一定不会是自己的对手，掌门之位，也指日可待。这一切被辛龙子看到，心里疑惑大师兄到底练的是什么套路的武功，这么刁钻的招式，一点都不像武当的招式。

铁珊瑚因祸得福，破解了红花鬼母的毒。岳鸣珂告诉铁珊瑚应该前往明月峡，珊瑚很是吃惊。鸣珂说练霓裳得罪了锦衣卫，如果这次他们可以助明月峡一臂之力，度过难关，那么自己和霓裳之间的误会也会解开。珊瑚觉得十分有道理，答应鸣珂一同前往。

练霓裳觉得让锦衣卫内斗是天方夜谭。王照希却说孟秋霞临终前告诉了自己，其实是武当的黄叶道人下令，让秋霞向自己透露慕容冲离开京城的消息，从而才能顺利杀死瑞王，秋霞是慕容冲安排到明月峡的棋子，她也是黄叶安排在慕容冲身边的人马。黄叶与慕容冲之间必有矛盾。

卓一航与霓裳约定一个月之后雪山相见，慕容冲此时也从王照希口中得知所有的一切，原来瑞王的死都是黄叶一手安排的，现在又让自己辅佐一个不知从何而来的桂王。心里非常不满。耿绍南来到慕容冲的房间，质问他为何这次任务如此失败，既没有抢回银子，也没有拿回锦囊，如果没有那个能力，最好提前说一声。

小师妹劝大师兄回头是岸，但耿绍南却说自己已经无路可走，太子也知道谋反之事，肯定不会饶了自己。何萼华建议两人隐退江湖，过安居乐业的日子。岳鸣珂醒来后发现自己的恢复视力，珊瑚对他表白，愿意一生相随。